ID RNApol_bact_RpoY; MATRIX. AC MF_01553; DT 02-DEC-2005 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE. DE DNA-directed RNA polymerase subunit epsilon [rpoY] [rpoY]. CC /VERSION=6; MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1277840; R2=0.0100875; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7018.8510742; R2=11.4010868; TEXT='Heuristic'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1718; H_SCORE=26605; N_SCORE=18.467; MODE=1; TEXT='?'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=731; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??'; MA /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='M'; M=-3,-19,-19,-29,-19,-2,-18,-2,17,-10,17,52,-19,-19,-1,-11,-17,-9,9,-20,-2,-10; MA /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-37,-29,0,-38,-29,44,-28,19,18,-20,-21,-20,-28,-18,-6,29,-21,-1,-29; MA /M: SY='F'; M=-20,-27,-24,-34,-27,63,-30,-8,0,-23,6,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-4,20,46,-27; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='V'; M=1,-29,-12,-31,-29,-1,-30,-30,30,-21,10,10,-28,-28,-28,-21,-10,-1,45,-28,-9,-29; MA /M: SY='F'; M=-18,-25,-23,-30,-24,45,-29,-2,2,-22,11,4,-20,-29,-24,-15,-20,-9,-3,9,41,-23; MA /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,36,-30,13,1,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-7,26,71,-22; MA /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40; MA /M: SY='E'; M=-8,3,-29,9,35,-27,-19,-3,-26,7,-22,-17,-2,11,10,-2,-1,-4,-26,-29,-19,22; MA /M: SY='D'; M=-6,16,-19,17,2,-23,-11,-3,-20,-4,-22,-16,14,-13,-1,-7,12,8,-14,-35,-15,0; MA /M: SY='K'; M=-8,-8,-26,-10,-1,-13,-20,-10,-14,16,-12,-1,-5,-10,0,10,-10,-7,-12,-19,-6,-1; MA /M: SY='B'; M=-6,9,-22,7,3,-21,-17,-9,-16,2,-15,-11,7,-12,0,-3,3,8,-13,-29,-13,1; MA /M: SY='E'; M=-10,1,-27,4,27,-26,-20,-2,-24,12,-19,-12,0,-8,21,13,0,-4,-23,-25,-14,23; MA /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; MA /M: SY='V'; M=2,-8,-16,-14,-14,-11,-16,-14,3,-9,-7,-1,-1,-19,-11,-6,3,3,9,-29,-12,-13; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-13,-3,-27,-22,-21,-12,-12,-24,-16,-20,78,-11,-21,-11,-10,-23,-29,-27,-12; MA /M: SY='V'; M=-7,-19,-21,-20,-15,-11,-27,-19,7,3,-3,3,-16,-22,-11,6,-10,-4,17,-25,-9,-15; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40; MA /M: SY='N'; M=-9,13,-21,6,1,-20,-13,2,-20,7,-21,-10,18,-14,3,6,5,7,-18,-31,-12,2; MA /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10; MA /M: SY='Q'; M=-13,2,-30,4,12,-30,-20,14,-26,20,-23,-7,3,-12,21,18,-7,-12,-24,-24,-6,15; MA /M: SY='S'; M=13,-6,-11,-10,-8,-15,-9,-17,-9,-12,-17,-12,-1,-12,-7,-13,23,20,1,-33,-16,-8; MA /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-29,-19,7,-28,-17,17,-22,37,21,-26,-28,-16,-12,-26,-9,10,-20,-1,-18; MA /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-27,8,-33,-25,32,-26,25,18,-25,-26,-23,-23,-20,-7,27,-21,-1,-26; MA /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,36; MA /M: SY='A'; M=36,-13,-13,-20,-13,-17,1,-20,-7,-13,-5,-7,-11,-13,-12,-20,5,-2,0,-21,-18,-13; MA /M: SY='E'; M=-12,18,-28,27,31,-31,-13,-3,-30,5,-24,-21,7,-2,9,-2,1,-7,-26,-33,-19,19; MA /M: SY='S'; M=6,4,-12,0,-4,-17,-9,-13,-15,-9,-20,-15,6,-11,-6,-11,24,24,-6,-34,-16,-5; MA /M: SY='E'; M=-7,3,-27,7,31,-23,-21,-7,-18,4,-12,-12,-3,-6,8,-2,-2,-4,-18,-28,-15,19; MA /M: SY='R'; M=-5,-3,-24,-2,1,-20,-18,-11,-13,3,-16,-10,-3,-6,-2,6,-1,-3,-7,-28,-15,-2; MA /M: SY='E'; M=-4,13,-25,21,30,-29,-16,-5,-25,4,-19,-18,2,-6,10,-5,2,-4,-21,-30,-18,20; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; MA /M: SY='V'; M=19,-21,-10,-25,-21,-8,-18,-25,13,-16,1,1,-21,-22,-21,-20,0,1,29,-27,-14,-21; MA /M: SY='R'; M=-19,-12,-30,-12,-3,-17,-22,1,-23,23,-15,-7,-2,-20,7,58,-11,-10,-16,-19,-6,-3; MA /M: SY='E'; M=-7,-5,-26,-4,9,-21,-20,-3,-15,9,-11,-6,-5,-13,8,9,-6,-6,-12,-24,-10,7; MA /M: SY='L'; M=-3,-16,-25,-19,-10,-8,-22,-12,1,1,5,5,-14,-19,-7,-2,-15,-9,-1,-17,0,-10; MA /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-31,-24,8,-31,-23,25,-27,34,19,-28,-29,-22,-21,-23,-7,22,-22,-2,-23; MA /M: SY='E'; M=1,4,-24,4,19,-27,-12,-8,-26,16,-23,-15,2,-8,7,7,1,-5,-19,-26,-16,12; MA /M: SY='D'; M=-2,14,-24,19,13,-28,-10,-6,-27,4,-22,-18,4,-6,1,-4,2,-1,-20,-30,-17,6; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='T'; M=-8,-1,-22,-4,2,-18,-19,-9,-20,8,-18,-12,1,-3,0,10,3,14,-14,-26,-11,0; MA /M: SY='D'; M=-8,15,-29,19,12,-29,-8,-3,-27,-1,-27,-21,11,13,-1,-8,0,-8,-28,-33,-22,4; MA /M: SY='Y'; M=-18,-20,-23,-23,-21,33,-29,9,1,-16,3,1,-17,-29,-16,-13,-19,-10,-7,16,55,-21; MA /M: SY='N'; M=-12,33,-22,17,0,-20,-4,21,-21,-2,-27,-17,50,-20,1,-1,6,-3,-29,-38,-14,0; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,19,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-30,19,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-19,0,0,21,0,0,-10,-30,-30,-20,40; MA /M: SY='F'; M=-18,-25,-23,-31,-23,53,-29,-8,0,-23,6,1,-18,-28,-25,-16,-17,-9,-3,8,33,-22; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30; MA /M: SY='Q'; M=-9,6,-27,9,23,-32,-20,0,-19,4,-18,-8,1,-8,30,0,1,-3,-23,-26,-13,26; MA /M: SY='E'; M=2,-9,-25,-6,10,-20,-17,-10,-15,-3,-9,-9,-10,8,0,-7,-4,-6,-15,-26,-16,4; MA /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,26,-29,40,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23; MA /M: SY='S'; M=-3,14,-20,18,18,-26,-8,-5,-26,-1,-27,-21,11,-8,6,-6,19,6,-20,-36,-19,12; MA /M: SY='G'; M=-8,7,-31,14,7,-32,24,-11,-36,-7,-28,-22,3,-5,-6,-12,-1,-15,-30,-27,-25,0; MA /M: SY='E'; M=11,6,-21,2,14,-25,-9,-7,-21,8,-21,-15,6,-9,5,-2,5,-3,-17,-27,-18,9; MA /M: SY='H'; M=-6,-10,-24,-13,-9,0,-20,38,-15,-12,-9,-2,-4,-20,-3,-8,-8,-10,-15,-14,20,-8; MA /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-30,-20,8,-29,-21,20,-28,44,18,-29,-29,-20,-20,-27,-9,13,-21,-2,-20; MA /M: SY='E'; M=7,6,-23,9,28,-28,-13,-6,-23,2,-17,-15,-1,-5,12,-6,4,-4,-20,-27,-18,20; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-29,-21,-20,32,-30,20,-1,-11,0,0,-19,-30,-11,-10,-20,-10,-10,28,76,-20; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40; MA /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,16,-34,-20,0,-26,29,-24,-6,0,-10,32,23,-5,-10,-25,-20,-10,24; MA /M: SY='E'; M=0,5,-26,6,27,-31,-15,-1,-23,9,-20,-12,1,-7,24,2,2,-7,-24,-25,-16,26; MA /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; MA /M: SY='N'; M=-2,10,-13,4,-1,-14,-4,4,-15,-1,-19,-12,19,-11,0,1,12,6,-14,-26,-11,-1; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='P'; M=-1,-2,-28,2,15,-26,-8,-12,-21,-4,-21,-17,-5,17,-2,-12,-1,-8,-20,-29,-23,5; MA /M: SY='D'; M=-13,27,-27,30,6,-27,-3,10,-31,-1,-27,-20,21,-15,-1,-4,1,-9,-27,-32,-12,2; MA /M: SY='F'; M=-19,-28,-22,-35,-27,61,-30,-12,2,-26,13,2,-21,-30,-32,-18,-21,-10,-1,10,36,-27; MA /M: SY='K'; M=-8,6,-27,6,20,-27,-17,-6,-27,27,-25,-13,6,-9,11,15,-2,-4,-22,-26,-14,15; MA /M: SY='V'; M=-6,-30,-17,-32,-26,4,-32,-26,29,-26,28,16,-28,-28,-24,-22,-20,-6,31,-24,-4,-26; MA /M: SY='T'; M=-4,-6,-19,-7,7,-13,-22,-14,-6,-7,-4,-4,-10,-13,-3,-9,1,11,-1,-24,-11,2; MA /M: SY='E'; M=-7,11,-23,9,25,-23,-15,-4,-21,4,-20,-16,11,-8,8,-2,8,6,-20,-32,-17,16; MA /M: SY='F'; M=-10,-26,-21,-32,-25,33,-29,-21,12,-23,13,6,-20,-26,-27,-18,-17,-8,11,-7,12,-25; MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105; //