CLUSTAL format seed alignment for MF_01272

_____________________________________________________________________________

Features found in the protein:
The following colors are used to highlight features:
blue indicates SIGNAL, PROPEP, TRANSMEM, DOMAIN, ZN_FING, REPEAT,
DNA_BIND and CA_BIND.
magenta is used to display DISULFID, THIOLEST and THIOETH.
red is used for all other features, such as INIT_MET, ACTIVE SITE,
 METAL,BINDING, NP_BIND, SITE, REGION, etc.
The ID of the sequence used as the template for feature propagation is 
underlined.
A '<' at the beginning of a sequence or '>' at the end indicate that
 the protein is fused with another domain either at the N- or C-terminus.
_____________________________________________________________________________

HDOX1_STAAE      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX_STAAB       MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAAC      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAAR      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAAN      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAAW      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAAS      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAAM      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAA8      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX_STAAT       MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX1_STAA3      MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHG-------IETLEGFDGMFVTQTL-EQEDFDEV
HDOX2_STAAN      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAAC      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAA8      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAAE      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAAW      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAAS      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX_STAA1       -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAAM      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAA3      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTEDTDEV
HDOX2_STAAR      -MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQG-------IETIEGFQQMFVTKTL-NTKDTDEV
HDOX_BACCZ       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACAH       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACCQ       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACC1       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACC0       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACC7       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACC3       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACAC       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACAA       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACAN       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACHK       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIDRFNKVGQ-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACCR       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIERFNKVGK-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACC4       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIERFNKVGK-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACC2       -MIIVTNTAKITKGNGHKLIERFNKVGK-------VETMPGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_BACMK       -MIIVTNTTKITKGNGHKLIERFNKVGK-------VETMSGFLGLEVLLTQ-NTVDYDEV
HDOX_HALH5       -MVIVTNTSKITKGNGEKLIERFNKVGK-------VEFMEGFLGLEVLLTE-NTKDFDEV
HDOX_SHOC1       -MVIVANKTLIRKGEGHKLVKRFDKIGK-------IEMQKGFLGLEVLVNA-KEKEVDEV
HDOX_STAES       -MFVVTNRITVKKGYAKQMAPNFTKGGP-------IESLKGFEGIEVWQID-KDDYSEDM
HDOX_STAEQ       -MFVVTNRITVKKGYAKQMAPNFTKGGP-------IESLKGFEGIEVWQID-KDDYSEDM
HDOX_STAHJ       -MFVVTNRITVKKGFAEKMAPRFTKGGK-------IEALQGFHKIEVWKVT-RDHENEDM
HDOX_STAS1       -MYVVTNRIDVKKGFAEKMAPKFTQGGK-------IQELEGFQKVEVWLID-DEADYDQM
HDOX_LISIN       -MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEV
HDOX_LISMO       -MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEV
HDOX_LISMF       -MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEV
HDOX_LISMH       -MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEV
HDOX_LISMC       -MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEV
HDOX_LISW6       -MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEV
                    :. *   : ** ...   .*            :    **  . :          :::

HDOX1_STAAE      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX_STAAB       KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAAC      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAAR      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAAN      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAAW      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAAS      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAAM      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAA8      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX_STAAT       KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX1_STAA3      KILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDE--SSPIINNKVITYDIGYSYMK---
HDOX2_STAAN      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAAC      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAA8      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAAE      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAAW      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAAS      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX_STAA1       KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAAM      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAA3      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX2_STAAR      KILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK---
HDOX_BACCZ       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACAH       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACCQ       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACC1       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACC0       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACC7       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACC3       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACAC       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACAA       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACAN       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKAAHSHQGG------MPDYILDNKISYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACHK       TISTRWNAKEDFQGWTKSPAFKDAHSHQGG------MPDYILDNKITYYNVEVVRMPMAA
HDOX_BACCR       TISTRWNAKEDFQGWTKSAAFKDAHSHQGG------MPEYILDNKIAYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACC4       TISTRWNAKEDFQGWTKSAAFKDAHSHQGG------MPEYILDNKIAYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACC2       TISTRWNAKEDFQGWTKSAAFKDAHSHQGG------MPEYILDNKIAYYDVKVVRMPMAA
HDOX_BACMK       TISTRWNAKEDFQGWTKSSAFKDAHSHQGG------MPDYILDNKIAYYDVKVVRMPMAA
HDOX_HALH5       TVVTRWNTKDDFKNWTKSSAFRDAHSKRE-------VPEYILENKISFYEVKVVRGPLTA
HDOX_SHOC1       TISTRWETKADFHAWTKSEAFREAHSGRNA------RPDYILGNEIEFYDVEVVRMPIAQ
HDOX_STAES       YVNSWWETEEDFKNWVNSDVFKQAHKNTGKS-----EDSPVIKSEIVKSNVLSSLNRR--
HDOX_STAEQ       YVNSWWETEEDFKNWVNSDVFKQAHKNTGKS-----EDSPVIKSEIVKSNVLSSLNRR--
HDOX_STAHJ       YVNTWWETEKDFEAWTKSDAFKEAHQNRDKTSS---ESSPVISSEIVKATVLSTLN----
HDOX_STAS1       YINTWWDSEDDFKGWLKSDAFKEAHEGKSKTKS---DDSPILGNKVVKANVISELS----
HDOX_LISIN       VVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIV
HDOX_LISMO       VVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIV
HDOX_LISMF       VVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIV
HDOX_LISMH       VVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIV
HDOX_LISMC       VVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIV
HDOX_LISW6       VVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNEIARFEVVHVQNPVTI
                  : : *.::     * :*  *: **             . :: . :    :         

HDOX1_STAAE      ------------
HDOX_STAAB       ------------
HDOX1_STAAC      ------------
HDOX1_STAAR      ------------
HDOX1_STAAN      ------------
HDOX1_STAAW      ------------
HDOX1_STAAS      ------------
HDOX1_STAAM      ------------
HDOX1_STAA8      ------------
HDOX_STAAT       ------------
HDOX1_STAA3      ------------
HDOX2_STAAN      ------------
HDOX2_STAAC      ------------
HDOX2_STAA8      ------------
HDOX2_STAAE      ------------
HDOX2_STAAW      ------------
HDOX2_STAAS      ------------
HDOX_STAA1       ------------
HDOX2_STAAM      ------------
HDOX2_STAA3      ------------
HDOX2_STAAR      ------------
HDOX_BACCZ       AQ----------
HDOX_BACAH       AQ----------
HDOX_BACCQ       AQ----------
HDOX_BACC1       AQ----------
HDOX_BACC0       AQ----------
HDOX_BACC7       AQ----------
HDOX_BACC3       AQ----------
HDOX_BACAC       AQ----------
HDOX_BACAA       AQ----------
HDOX_BACAN       AQ----------
HDOX_BACHK       AQ----------
HDOX_BACCR       AQ----------
HDOX_BACC4       AQ----------
HDOX_BACC2       AQ----------
HDOX_BACMK       AQ----------
HDOX_HALH5       AEAGNDSQAQAQ
HDOX_SHOC1       AQ----------
HDOX_STAES       ------------
HDOX_STAEQ       ------------
HDOX_STAHJ       ------------
HDOX_STAS1       ------------
HDOX_LISIN       EK----------
HDOX_LISMO       EK----------
HDOX_LISMF       EK----------
HDOX_LISMH       EK----------
HDOX_LISMC       EK----------
HDOX_LISW6       EK----------