ID   RNApol_Rpo5_RPB5; MATRIX.
AC   MF_00025;
DT   28-FEB-2005 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE.
DE   DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo5 [rpo5] [rpo5].
CC   /VERSION=9;
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=74;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7939997; R2=0.0102314; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6394.1489258; R2=5.8655257; TEXT='Heuristic';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1599; H_SCORE=15773; N_SCORE=18.154; MODE=1; TEXT='?';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=656; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-21,-29,-23,18,-27,-20,16,-22,12,11,-19,-21,-22,-18,-16,-8,13,-14,3,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-8,24,-23,21,4,-24,-5,-2,-22,2,-24,-18,26,-16,-2,-3,4,-4,-20,-35,-18,1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-33,-27,1,-34,-28,35,-25,19,15,-26,-22,-24,-24,-17,-6,33,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-21,-19,-10,-6,-22,-15,1,-13,12,6,-16,-10,-6,-10,-10,0,-3,-23,-7,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-26,20,22,-27,-16,-1,-24,4,-19,-15,6,-9,9,-3,1,-5,-22,-31,-15,16;
MA   /M: SY='H'; M=-17,1,-27,-1,-3,-18,-19,76,-22,-10,-18,-1,11,-21,4,-2,-8,-16,-21,-31,12,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-24,3,22,-20,-20,-6,-12,1,-12,-7,-3,-10,7,-5,-1,-4,-11,-27,-12,14;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-20,-29,-20,12,-27,-17,16,-25,32,18,-25,-27,-18,-19,-22,-8,10,-16,4,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-15,-29,-26,-3,-31,-27,29,-19,9,11,-26,-27,-22,-19,-11,-2,41,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-29,6,23,-29,-20,0,-29,27,-24,-12,1,-9,16,21,-5,-8,-24,-24,-12,18;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-2,-28,-3,-2,-12,-20,87,-26,-11,-17,0,7,-20,6,-1,-10,-18,-26,-26,20,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-24,-1,18,-21,-22,0,-12,3,-12,-7,-5,-11,9,1,-3,-4,-10,-26,-10,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-22,-30,-22,0,-31,-24,27,-20,19,13,-23,-19,-19,-18,-18,-7,22,-22,-4,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-31,-23,5,-29,-20,27,-24,31,24,-25,-25,-17,-20,-22,-8,19,-20,-1,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=-1,6,-18,7,0,-21,-9,-10,-20,-7,-25,-18,8,6,-4,-10,18,15,-15,-35,-19,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-30,8,23,-28,-20,-7,-21,11,-21,-13,-3,9,10,3,-5,-9,-21,-26,-17,15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-26,19,39,-29,-13,-3,-29,4,-22,-20,3,-4,12,-3,7,-4,-25,-32,-20,25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,22,52,-30,-19,0,-30,8,-20,-20,2,-2,19,-1,1,-7,-29,-30,-19,36;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-15,-22,-14,-10,-15,-14,6,-12,4,6,-14,-16,-11,-15,-5,-4,9,-20,-9,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-27,8,21,-27,-18,-4,-22,11,-20,-12,-1,-6,14,3,-2,-7,-19,-25,-13,17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-26,9,24,-26,-13,-4,-26,12,-22,-15,5,-9,11,8,2,-4,-23,-28,-16,17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-19,-31,-22,8,-32,-24,26,-25,26,14,-26,-27,-23,-21,-20,-7,24,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-27,-17,5,-29,-19,15,-20,39,16,-26,-27,-16,-14,-27,-10,7,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-2,1,-23,-1,4,-24,-9,-9,-23,14,-21,-11,3,-12,4,11,3,2,-16,-25,-14,3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-28,6,19,-26,-18,0,-26,18,-21,-12,1,-11,11,20,-3,-7,-21,-26,-12,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-26,-22,-15,17,-27,0,4,-16,13,7,-22,-26,-12,-13,-21,-10,-4,10,36,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-11,15,-27,13,-1,-24,7,-3,-28,4,-26,-17,18,-17,-3,2,-2,-10,-25,-26,-13,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-17,-31,-24,1,-30,-23,25,-25,20,12,-23,-24,-20,-23,-16,-5,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-12,7,-28,8,15,-27,-16,-1,-28,21,-24,-13,6,-12,11,21,-3,-5,-23,-26,-13,12;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-31,-11,3,-21,-23,-16,-10,2,-14,-8,-13,21,-4,-2,-11,-9,-13,-25,-16,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-27,8,20,-22,-17,-3,-23,1,-19,-15,-1,-10,13,-2,2,-1,-22,-13,-6,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,7,-27,7,17,-30,-17,9,-22,4,-19,-7,5,-11,32,2,1,-5,-25,-24,-10,24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,21,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-38,-11,-1,-28,-20,-18,-18,-6,-27,-14,-19,75,-8,-16,-11,-10,-27,-29,-26,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-10,-32,-10,1,-20,-21,-10,-24,27,-20,-8,-8,-16,8,24,-15,-13,-20,5,-3,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,1,-38,-27,44,-29,24,22,-21,-21,-19,-28,-21,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-9,-24,-9,-3,-10,-19,-1,-15,10,-14,-6,-5,-17,1,10,-3,-4,-10,-19,1,-2;
MA   /M: SY='A'; M=8,-11,-18,-13,-10,-13,-17,-12,-4,-8,-6,-5,-12,-11,-11,-8,-2,-1,4,-24,-10,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,11,-17,8,-1,-21,-8,-10,-19,-5,-22,-16,12,-12,-3,-8,18,17,-12,-34,-16,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-18,-23,-16,-6,-26,-23,19,-17,7,6,-21,-13,-18,-19,-10,-4,23,-24,-10,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=25,-18,-12,-24,-18,-12,-14,-24,8,-13,-2,-1,-17,-18,-17,-19,1,-1,19,-24,-15,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-25,-14,-3,-14,-24,-10,-9,10,0,1,-12,-20,1,20,-14,-9,-4,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-27,-2,7,-14,-10,-2,-19,-3,-16,-13,-5,-10,-2,-9,-4,-9,-19,-6,1,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-19,-26,-21,5,-27,-21,16,-22,15,8,-17,-23,-19,-20,-16,-5,9,-18,1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,3,-28,4,-5,-29,30,-12,-34,-2,-28,-19,6,-16,-8,-6,0,-14,-26,-24,-23,-7;
MA   /M: SY='A'; M=26,-17,-16,-24,-16,-12,-7,-22,3,-17,5,0,-15,-16,-15,-21,-3,-5,5,-20,-14,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,0,11,-28,-16,-9,-28,37,-26,-10,-1,-11,10,25,-7,-8,-19,-21,-12,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-34,-8,6,-25,-22,-15,-16,0,-22,-14,-14,41,-4,-3,-9,-9,-19,-28,-22,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-5,-17,-28,58,-15,-37,-17,-30,-20,10,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-28,53,17,-36,-10,-1,-35,1,-28,-26,17,-10,2,-6,2,-6,-27,-37,-19,9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-35,-29,6,-34,-28,37,-26,17,16,-24,-25,-25,-24,-16,-6,34,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-33,-28,2,-33,-28,35,-25,21,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-29,-3,11,-26,-20,-5,-26,35,-23,-6,-1,-12,14,33,-9,-10,-20,-21,-10,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-29,-39,-30,0,-39,-30,49,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-21,-24,-17,-5,-30,-23,21,-16,5,6,-14,-18,-15,-18,-6,5,19,-24,-4,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-31,7,13,-30,-18,-9,-27,25,-27,-13,-1,7,7,12,-6,-9,-23,-26,-15,9;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-6,-33,1,16,-29,-18,-8,-22,-1,-22,-16,-9,33,8,-7,-5,-9,-26,-26,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-11,-9,-10,-10,-19,-19,-9,-10,-9,-9,2,-11,-10,-10,18,46,-1,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-11,-18,-10,-17,-2,-17,-10,-10,-11,-9,-8,-11,-9,-18,12,4,-1,-21,-16,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-29,-6,-12,-28,52,-16,-35,-15,-26,-15,-1,-18,-14,-16,-2,-18,-27,-21,-26,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-28,5,27,-21,-22,12,-22,6,-16,-11,-2,-10,14,6,-4,-8,-22,-23,-4,19;
MA   /M: SY='A'; M=13,-14,-16,-18,-15,0,-5,-13,-8,-14,-10,-8,-10,-18,-15,-16,4,0,-1,-13,2,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-17,-24,-20,-3,-29,-24,21,-17,8,7,-21,-23,-21,-18,-9,1,28,-26,-6,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-12,-18,-13,-16,3,-21,-9,0,-13,-5,-4,-13,-22,-15,-14,-1,5,7,-12,14,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-23,-21,31,-31,14,3,-13,2,1,-20,-29,-13,-12,-20,-10,-7,25,71,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-29,-24,18,-31,-14,18,-23,24,11,-26,-29,-22,-19,-22,-8,15,-8,19,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-7,-30,-29,-1,-30,-30,28,-21,9,9,-28,-29,-28,-21,-9,1,44,-30,-10,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-18,-26,-21,-6,-28,-23,21,-14,6,10,-19,-22,-16,-14,-9,1,27,-26,-7,-20;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
//