ID KhpA; MATRIX. AC MF_00088; DT 28-FEB-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE. DE RNA-binding protein KhpA [khpA] [khpA]. CC /VERSION=7; MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=70; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0673859; R2=0.0095645; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7120.5532227; R2=4.2978725; TEXT='Heuristic'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1181; H_SCORE=12196; N_SCORE=14.363; MODE=1; TEXT='?'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=568; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='M'; M=-9,-19,-21,-23,-9,-2,-23,-7,13,-13,20,34,-20,-20,-4,-12,-18,-9,8,-22,-4,-7; MA /M: SY='K'; M=-4,-3,-26,-2,16,-24,-21,-11,-16,21,-18,-9,-5,-10,5,8,-6,-8,-11,-24,-13,10; MA /M: SY='E'; M=-9,18,-28,29,31,-32,-15,-4,-29,2,-23,-21,4,2,9,-6,1,-6,-26,-32,-20,20; MA /M: SY='L'; M=0,-26,-19,-30,-20,10,-26,-21,15,-26,34,13,-25,-26,-20,-21,-21,-8,9,-17,-1,-20; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-28,30,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,26,-22,-2,-26; MA /M: SY='E'; M=1,0,-23,3,27,-22,-18,-9,-17,3,-12,-12,-6,-7,6,-5,0,-3,-14,-27,-16,17; MA /M: SY='H'; M=-13,-9,-25,-11,-8,1,-21,29,-14,-6,-9,-3,-4,-21,-3,-4,-6,-6,-14,-12,23,-8; MA /M: SY='I'; M=-8,-28,-26,-36,-27,0,-37,-28,41,-28,20,17,-20,-21,-20,-27,-17,-4,27,-22,-2,-27; MA /M: SY='V'; M=11,-25,-13,-28,-24,-4,-23,-26,20,-19,10,7,-24,-24,-23,-21,-8,-2,31,-25,-11,-24; MA /M: SY='R'; M=-4,-5,-25,-8,1,-22,-17,-9,-23,28,-20,-6,-3,-13,5,29,-6,-4,-14,-21,-11,2; MA /M: SY='G'; M=6,-3,-22,-4,-2,-25,16,-13,-25,-10,-27,-19,4,1,-7,-14,12,-3,-21,-29,-24,-5; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23; MA /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30; MA /M: SY='D'; M=-18,41,-30,58,22,-38,-12,-1,-38,6,-29,-27,16,-9,3,-5,-1,-10,-29,-37,-19,12; MA /M: SY='H'; M=-17,1,-20,-4,-4,-10,-18,39,-24,0,-19,-7,10,-22,1,10,-8,-12,-23,-23,8,-4; MA /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-7,5,-30,-20,-18,-22,-4,-29,-19,-17,75,-6,-15,-9,-10,-29,-29,-28,-5; MA /M: SY='D'; M=-14,29,-30,44,33,-35,-8,-1,-36,3,-26,-25,10,-7,7,-7,0,-11,-30,-34,-21,20; MA /M: SY='E'; M=-14,24,-30,37,41,-34,-16,-1,-34,9,-25,-23,8,-5,12,-1,-1,-10,-29,-33,-19,26; MA /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30; MA /M: SY='R'; M=-11,-14,-22,-14,-9,-15,-23,-3,-9,8,-10,-2,-9,-21,-2,23,-7,-3,3,-25,-7,-7; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,16,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,41,-26,-6,-29; MA /M: SY='T'; M=-6,3,-19,-2,-6,-15,-16,-10,-8,-2,-12,-3,6,-16,-4,-1,4,9,-4,-30,-12,-6; MA /M: SY='E'; M=-5,-3,-27,1,24,-22,-20,-9,-18,8,-12,-11,-7,-3,6,3,-6,-8,-15,-26,-16,14; MA /M: SY='I'; M=-8,-16,-23,-20,-9,-1,-28,-13,10,-13,0,2,-12,-18,-12,-14,-7,-3,8,-22,-2,-12; MA /M: SY='E'; M=-9,12,-26,19,30,-29,-17,-4,-26,2,-22,-19,3,2,12,-5,5,1,-24,-32,-18,21; MA /M: SY='G'; M=-1,0,-24,2,2,-26,24,-13,-31,-10,-25,-19,3,-13,-7,-13,10,-1,-22,-28,-23,-3; MA /M: SY='E'; M=-11,9,-29,17,33,-29,-13,-5,-29,5,-22,-20,1,2,9,1,0,-5,-26,-30,-20,20; MA /M: SY='R'; M=-9,-3,-27,-3,4,-26,-2,9,-29,9,-23,-11,2,-14,10,13,-1,-7,-23,-24,-11,5; MA /M: SY='S'; M=-1,-4,-21,-6,-3,-22,0,-13,-22,3,-20,-11,0,-13,0,-1,9,6,-14,-27,-15,-1; MA /M: SY='I'; M=-9,-11,-24,-14,-4,-11,-25,-15,4,-4,1,1,-8,-18,-7,-3,-9,-3,4,-25,-9,-7; MA /M: SY='V'; M=-1,-22,-19,-28,-23,-4,-29,-20,24,-21,7,8,-18,-21,-19,-21,-7,3,26,-26,-5,-23; MA /M: SY='Y'; M=-12,-27,-25,-29,-23,14,-32,-10,21,-22,23,12,-25,-28,-18,-19,-23,-9,11,-4,26,-23; MA /M: SY='E'; M=-11,6,-30,14,45,-29,-20,7,-29,13,-21,-16,1,-4,21,8,-2,-11,-29,-28,-15,32; MA /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,25,-28,40,18,-29,-29,-22,-21,-25,-8,19,-22,-2,-23; MA /M: SY='R'; M=-8,-7,-21,-9,-4,-17,-17,0,-18,7,-18,-9,0,-17,0,23,5,5,-8,-28,-9,-4; MA /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30; MA /M: SY='H'; M=3,10,-19,5,-1,-22,-7,25,-22,-7,-23,-13,16,-15,1,-7,10,-2,-19,-33,-8,-1; MA /M: SY='P'; M=-9,-9,-34,-3,11,-30,-19,-12,-23,7,-28,-16,-9,42,4,-3,-5,-8,-26,-28,-22,5; MA /M: SY='E'; M=-4,12,-26,21,28,-30,-13,-6,-28,4,-25,-21,3,3,7,-5,5,-5,-24,-32,-20,17; MA /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,12; MA /M: SY='V'; M=-5,-26,-16,-29,-24,2,-28,-21,24,-21,21,21,-25,-26,-20,-18,-16,-2,27,-25,-5,-22; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-6,-29,43,-27,-9,0,-11,16,34,-9,-10,-21,-20,-10,12; MA /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7; MA /M: SY='Q'; M=-10,10,-27,11,12,-31,-6,9,-27,3,-24,-12,12,-13,21,5,3,-8,-28,-28,-14,16; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='T'; M=-5,-15,-20,-25,-20,-5,-30,-25,19,-20,5,5,-10,-15,-15,-20,0,21,15,-25,-5,-20; MA /M: SY='A'; M=38,-14,-14,-24,-14,-16,-8,-22,2,-14,-4,-4,-12,-12,-12,-22,4,-2,6,-20,-16,-14; MA /M: SY='K'; M=-11,-2,-28,-3,6,-26,-20,-9,-28,40,-26,-10,0,-12,8,35,-7,-4,-18,-21,-10,6; MA /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,33,-30,37,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24; MA /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1; MA /M: SY='T'; M=3,-4,-12,-14,-12,-10,-20,-21,-4,-12,-8,-7,-2,-11,-11,-13,16,38,3,-29,-10,-12; MA /M: SY='L'; M=-4,-29,-19,-31,-23,4,-29,-23,24,-27,34,16,-27,-27,-21,-22,-22,-7,20,-22,-3,-23; MA /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-31,-25,5,-31,-25,26,-26,31,16,-29,-29,-24,-21,-21,-6,29,-24,-4,-25; MA /M: SY='T'; M=1,-10,-17,-14,-13,0,-11,-11,-9,-10,-11,-8,-7,-18,-12,-11,6,11,-3,-15,6,-13; MA /M: SY='A'; M=42,-9,-12,-17,-10,-21,7,-19,-14,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,12,0,-4,-22,-21,-10; MA /M: SY='V'; M=10,-20,-5,-25,-19,-8,-20,-23,9,-20,6,2,-17,-21,-17,-21,-3,-2,13,-27,-12,-19; MA /M: SY='A'; M=21,-10,-19,-15,-12,-22,18,-16,-18,-9,-16,-6,-6,-14,-10,-15,4,-7,-10,-22,-20,-11; MA /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; MA /M: SY='S'; M=1,-5,-16,-5,-9,-16,-5,-7,-11,-8,-13,-9,-3,-16,-9,-6,6,4,-1,-27,-12,-10; D=-5; MA /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='K'; M=-4,2,-20,2,6,-21,-12,-5,-20,23,-18,-8,1,-8,9,17,-4,-6,-14,-16,-8,7; D=-5; MA /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='N'; M=0,9,-17,6,1,-19,-3,-6,-14,-6,-17,-12,11,-11,0,-8,8,2,-13,-26,-14,0; D=-5; MA /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='G'; M=-4,11,-23,7,-3,-27,20,-6,-29,-5,-29,-19,20,-16,-2,-7,10,-5,-26,-31,-22,-2; MA /M: SY='R'; M=-12,-6,-27,-6,2,-23,-21,-9,-23,33,-22,-8,-3,-15,5,35,-8,-5,-12,-22,-10,2; MA /M: SY='R'; M=-14,-2,-29,-2,7,-24,-10,-3,-30,25,-24,-13,5,-15,8,39,-6,-10,-23,-23,-14,5; MA /M: SY='V'; M=-6,-29,-19,-33,-29,8,-33,-26,32,-23,13,12,-25,-27,-26,-23,-15,-5,35,-19,3,-29; MA /M: SY='R'; M=-4,-9,-20,-11,-4,-16,-17,-6,-13,4,-15,-7,-4,-17,6,15,4,4,-6,-22,-6,-1; MA /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-32,-24,12,-31,-23,24,-28,35,16,-28,-29,-24,-21,-24,-8,21,-20,0,-24; MA /M: SY='E'; M=-13,21,-30,33,42,-33,-17,-1,-33,11,-24,-22,6,-4,13,0,-1,-10,-29,-32,-19,28; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30; MA /M: SY='I'; M=-8,-28,-20,-34,-27,7,-32,-23,31,-24,21,22,-24,-25,-21,-22,-19,-7,27,-21,-1,-25; MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105; //