ID   RNApol_arch_Rpo6; MATRIX.
AC   MF_00192;
DT   28-FEB-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE.
DE   DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo6 [rpo6] [rpo6].
CC   /VERSION=6;
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7478706; R2=0.0110823; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4720.8496094; R2=2.6400626; TEXT='Heuristic';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1468; H_SCORE=8596; N_SCORE=18.027; MODE=1; TEXT='?';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=610; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-8,-28,-10,1,-10,-19,-7,-10,-1,-11,5,-6,11,-2,-6,-10,-9,-15,-23,-11,-1;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-26,-4,3,-16,-18,-3,-22,32,-20,-7,-3,-12,6,25,-10,-9,-16,-10,4,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-19,-23,-17,13,-26,-8,13,-21,32,13,-23,-26,-15,-15,-23,-9,4,-6,17,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,55,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,55,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-11,-28,-14,-5,-17,-25,-14,-7,17,-12,-2,-5,-15,0,20,-9,-3,-4,-21,-7,-5;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-29,-33,-23,-3,-36,-26,35,-18,16,16,-18,-20,-16,-20,-20,-10,20,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=43,-13,-10,-21,-13,-17,-4,-21,-4,-11,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,7,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=44,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,20,-30,-20,17,-30,44,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,26,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-15,-21,-22,-15,-6,-20,9,11,-13,7,34,-11,-18,-1,-11,-9,-7,4,-25,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-18,-34,-13,-3,-16,-23,-8,-14,-5,-14,-9,-16,34,-1,-4,-13,-10,-21,-17,-5,-6;
MA   /M: SY='P'; M=3,-22,-25,-19,-12,-18,-21,-24,0,-14,-12,-8,-22,31,-17,-20,-7,-5,4,-28,-21,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-20,-28,-20,6,-30,-21,19,-27,37,15,-24,-26,-18,-20,-21,-1,11,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,49,37,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-16,-19,-21,-18,-8,-27,-25,11,-17,-1,0,-14,-3,-17,-18,0,17,14,-28,-10,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-30,3,22,-30,-18,-7,-26,14,-26,-15,-3,15,13,4,0,-7,-25,-27,-18,16;
MA   /M: SY='E'; M=-13,3,-6,3,17,-25,-19,10,-29,7,-22,-15,5,-15,6,9,-4,-10,-24,-32,-13,10;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=2,3,-16,1,-7,-15,-4,-12,-10,-10,-7,-8,2,-16,-11,-12,1,3,-4,-26,-14,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-9,-18,-9,-10,-6,-20,-12,8,-8,5,3,-9,-15,-9,-3,-10,-6,7,-17,-5,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-24,34,11,-31,-10,-1,-28,-1,-27,-21,19,-11,8,-6,10,2,-24,-36,-18,9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-32,-11,-3,-25,-18,-20,-14,-11,-26,-17,-17,61,-11,-18,-2,-4,-18,-32,-26,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-26,4,-33,-26,31,-26,28,16,-27,-27,-24,-23,-20,-6,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-25,20,10,-22,-17,-8,-20,0,-8,-12,1,-14,-2,-5,-5,-7,-16,-31,-13,4;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-28,-38,-28,-2,-36,-29,44,-28,17,17,-19,-19,-19,-29,-17,-9,27,-20,-2,-28;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-14,-25,-17,-6,-7,-21,-3,-3,1,-2,10,-11,-18,0,8,-11,-9,-5,-13,5,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-3,-28,1,26,-14,-23,-1,-15,5,-6,-3,-8,-11,8,-1,-9,-10,-17,-18,-1,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-22,-32,-25,25,-32,-17,19,-26,24,11,-25,-28,-24,-20,-22,-9,14,-8,17,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-14,16,-30,25,29,-32,-17,-3,-33,20,-25,-19,6,-8,11,13,-4,-10,-26,-29,-16,19;
MA   /M: SY='R'; M=-4,6,-25,0,4,-25,-12,-1,-23,18,-23,-11,14,-15,12,21,0,-6,-21,-25,-14,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-29,-5,-14,-29,51,-15,-36,-9,-30,-19,7,-19,-14,-12,0,-16,-29,-22,-26,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-27,-23,-3,-30,-26,22,-12,10,9,-24,-26,-21,-14,-14,-4,32,-26,-7,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-32,-24,5,-31,-21,28,-26,34,23,-27,-27,-19,-21,-24,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-12,-39,-1,2,-31,-19,-18,-22,-9,-30,-21,-15,78,-9,-19,-9,-10,-30,-31,-29,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-22,-36,-27,24,-33,-25,26,-29,24,13,-24,-27,-27,-23,-21,-9,20,-14,6,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,3,-18,-1,-4,-17,-18,-16,-11,-2,-15,-10,1,-11,-6,-6,11,23,-5,-30,-11,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-24,-32,-25,-5,-33,-28,32,-23,9,10,-24,-7,-22,-25,-15,-6,28,-25,-8,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-26,-16,-13,-7,-25,-8,3,1,-6,0,-3,-21,-6,8,-11,-7,1,-17,4,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-5,-27,-1,2,-17,-17,-9,-12,-9,-17,-13,-7,13,-5,-15,-1,-4,-14,-22,-6,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-6,-20,-4,-8,-9,-18,-9,-4,-6,-4,1,-8,-19,-7,-8,-3,-2,0,-23,-1,-8;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
//