ID   RNApol_arch_Rpo12; MATRIX.
AC   MF_00615;
DT   28-FEB-2005 CREATED; 29-SEP-2021 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE.
DE   DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo12 [rpo12] [rpo12].
CC   /VERSION=7;
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0604589; R2=0.0100562; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3266.1765137; R2=2.3529413; TEXT='Heuristic';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=877; H_SCORE=5329; N_SCORE=10.889; MODE=1; TEXT='?';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=641; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-22,-12,-9,-9,-19,-11,3,-7,-1,7,-8,-19,-7,-9,-8,-6,3,-23,-6,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-20,31,-30,17,1,-12,3,1,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,27,74,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-27,-11,1,-19,-23,-11,-8,19,-12,2,-7,-14,2,14,-10,-9,-5,-22,-9,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=8,-20,-18,-24,-18,-6,-9,-20,4,-19,7,6,-17,-15,-16,-19,-8,-5,6,-22,-11,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-27,-3,2,-19,-17,-1,-27,26,-23,-11,6,-17,6,39,-6,-8,-20,-22,-10,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-31,-8,-12,-28,47,-17,-37,-7,-29,-18,0,-18,-13,-10,-3,-18,-28,-14,-24,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-26,-6,6,-18,-14,-1,-22,13,-18,-10,-3,-14,7,19,-4,-5,-18,-17,-3,4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-23,-1,9,-20,-20,-13,-13,1,-14,-10,-5,-3,0,-4,1,5,-8,-28,-15,3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-18,-33,-27,16,-30,-25,23,-24,16,11,-24,-26,-26,-21,-15,-3,26,-18,1,-27;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-21,13,8,-19,-11,-9,-23,1,-20,-16,4,-11,-2,-1,7,5,-14,-29,-14,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-23,-10,-4,-12,-21,-13,0,-3,-3,1,-7,-11,-6,-7,-7,-5,-1,-24,-8,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,19,-24,25,22,-29,-12,-1,-29,4,-25,-20,11,-8,5,-3,7,-1,-23,-34,-18,13;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-25,4,21,-15,-20,-4,-13,-1,-8,-8,-6,-2,7,-5,-7,-9,-16,-19,-7,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-8,-18,-9,-7,-4,-17,-10,2,-10,10,7,-9,-19,-9,-9,-12,-6,1,-21,-6,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-23,7,12,-18,-11,-3,-18,6,-16,-10,1,-10,5,1,-3,-6,-16,-19,-6,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,2,-23,0,-1,-20,-10,-8,-15,4,-16,-8,5,-16,-1,5,0,-2,-11,-28,-14,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-24,-18,-12,-2,-17,-13,-2,-9,4,1,-11,-14,-12,-7,-13,-6,-4,-18,-2,-13;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-19,-32,-27,1,-31,-25,32,-23,16,15,-24,-25,-22,-23,-14,-5,32,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-29,-8,4,-21,-21,0,-19,21,-17,-4,-3,-15,13,30,-9,-10,-16,-18,-5,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-33,-10,0,-23,-22,-19,-7,-11,-18,-11,-14,44,-7,-19,-7,-6,-15,-28,-21,-8;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-5,-25,-7,-5,-1,-19,12,-14,11,-13,-5,-2,-18,0,11,-11,-8,-15,-1,26,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-26,-7,-15,-27,49,-16,-35,-14,-28,-19,5,-19,-14,-12,5,-11,-26,-24,-26,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-23,-15,-13,15,-18,17,-10,-14,-7,-4,-8,-23,-10,-11,-4,-5,-11,-4,31,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-5,-30,-5,5,-23,-19,-2,-30,33,-23,-11,2,-17,10,55,-9,-10,-21,-21,-11,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,0,-36,-29,41,-26,18,18,-24,-24,-23,-26,-17,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-33,-25,23,-30,-23,20,-27,24,11,-24,-28,-26,-21,-19,-7,17,-15,5,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-25,-25,-30,-24,18,-29,-12,14,-19,11,11,-21,-25,-18,-15,-19,-8,8,2,21,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,-1,9,-29,-20,-10,-28,48,-28,-7,-1,-10,10,28,-10,-10,-19,-20,-10,9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-13,-24,-10,5,-15,-25,-15,0,-5,-2,-1,-15,-6,-4,-9,-9,-6,3,-27,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-29,-10,0,-21,-19,-2,-27,27,-19,-9,-1,-19,10,59,-9,-9,-18,-20,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-30,-5,-1,-26,-14,-12,-20,-5,-26,-16,-9,39,-6,-10,0,-4,-21,-30,-22,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-2,-23,-2,4,-16,-10,-11,-17,-4,-20,-15,-1,14,-5,-8,2,-3,-17,-25,-17,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-11,-21,-12,-12,-12,-14,-16,2,-13,-2,1,-12,-15,-12,-15,-6,-4,6,-24,-8,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-23,-16,-10,-16,-18,-19,-3,0,-11,-4,-12,-4,-10,0,-5,-1,3,-26,-14,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-28,-1,4,-24,-20,-5,-24,30,-22,-9,0,-14,6,28,-8,-8,-17,-23,-9,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-25,-12,-2,-15,-23,0,-6,1,-9,-3,-4,-16,0,9,-5,-4,-5,-23,-5,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-17,-29,-25,2,-31,-25,25,-17,13,11,-25,-27,-23,-17,-15,-4,33,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-28,-2,6,-25,-17,-9,-25,25,-26,-13,0,3,4,16,-4,-5,-20,-23,-12,3;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-12,-16,-10,-18,-5,-15,-10,-9,-11,-9,-5,-12,-9,-14,10,4,-1,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-12,-26,-14,-11,-12,-28,-16,10,-7,-1,2,-9,-19,-9,1,-11,-8,9,-25,-8,-13;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
//