ID   FlhD; MATRIX.
AC   MF_00725;
DT   28-FEB-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE.
DE   Flagellar transcriptional regulator FlhD [flhD] [flhD].
CC   /VERSION=7;
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=104;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=99;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1089282; R2=0.0090898; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9648.8876953; R2=9.5580587; TEXT='Heuristic';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1619; H_SCORE=25123; N_SCORE=16.825; MODE=1; TEXT='?';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=704; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-16,-18,-25,-17,-3,-18,-3,14,-10,13,46,-15,-18,-1,-10,-11,-2,7,-23,-3,-9;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-20,4,5,-25,9,-12,-25,-8,-23,-18,3,-10,-4,-12,13,2,-17,-29,-21,1;
MA   /M: SY='T'; M=7,8,-13,0,-5,-17,-11,-13,-15,-8,-16,-14,9,-11,-7,-10,17,27,-7,-31,-15,-6;
MA   /M: SY='S'; M=-3,8,-18,8,6,-22,-12,-7,-17,-5,-21,-15,8,-12,4,-7,16,11,-11,-34,-16,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,14,-24,16,25,-29,-11,1,-25,2,-25,-17,12,-8,18,-2,12,-1,-25,-33,-18,21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23,6,-32,-21,30,-28,37,24,-26,-26,-18,-22,-26,-10,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=12,2,-19,1,2,-25,-8,-12,-22,12,-24,-15,2,-10,1,1,11,1,-12,-27,-17,2;
MA   /M: SY='E'; M=-13,15,-29,20,36,-27,-17,23,-30,4,-22,-17,12,-8,14,-1,-1,-11,-30,-32,-11,24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-37,-26,46,-27,20,25,-20,-20,-17,-27,-20,-10,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-30,-11,-8,-7,-18,11,-21,5,-18,-10,-2,-22,1,22,-10,-10,-20,7,14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,16,-27,26,43,-30,-15,-1,-30,5,-23,-22,5,-3,13,-3,6,-6,-27,-33,-20,28;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-28,-20,-32,-24,2,-30,-25,29,-26,26,15,-25,-25,-21,-23,-19,-7,25,-22,-4,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,7,-30,-19,24,-27,42,25,-27,-27,-17,-20,-27,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=14,-1,-10,-5,-3,-18,-4,-13,-17,-10,-23,-17,5,-10,-3,-11,32,23,-7,-35,-18,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-26,-25,-28,-18,4,-25,-15,7,-16,25,18,-25,-27,-12,-5,-26,-13,0,2,2,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-30,-1,17,-37,-20,9,-21,13,-20,-1,0,-11,53,19,-1,-10,-29,-20,-10,34;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-28,-5,9,-24,-20,0,-26,21,-19,-9,0,-15,18,45,-4,-5,-21,-22,-11,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-15,20,-25,42,30,-27,-27,-15,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=1,2,-23,-4,1,-24,-11,-3,-22,14,-21,-11,9,-15,10,23,0,-6,-18,-24,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-24,15,17,-29,-16,5,-26,5,-23,-14,6,-9,16,0,6,2,-22,-30,-12,16;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,61,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-30,-5,6,-24,-21,-2,-26,33,-23,-8,-2,-15,16,36,-9,-10,-21,-16,-3,9;
MA   /M: SY='A'; M=32,-5,-16,-11,-7,-21,-6,-18,-10,-4,-12,-9,-7,-11,-8,-14,4,-3,-3,-22,-17,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=10,-13,0,-17,-8,-13,-14,-17,-5,-14,-3,-2,-12,-18,-10,-16,3,0,2,-29,-15,-9;
MA   /M: SY='A'; M=30,-8,-16,-14,-9,-23,13,-18,-19,-6,-18,-13,-5,-12,-9,-14,8,-4,-9,-22,-21,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-18,-15,-24,-18,-3,-21,-12,13,-14,11,27,-17,-20,-9,-13,-6,4,14,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-19,-34,-26,62,-29,-17,-1,-25,6,-1,-17,-27,-33,-18,-14,-1,-1,6,28,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-12,-25,-14,-5,-18,-18,-6,-21,19,-15,-8,-5,-20,3,47,-7,-7,-9,-21,-11,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-21,-28,-20,5,-18,-18,14,-27,39,19,-26,-28,-18,-19,-26,-11,6,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,7,-36,-28,39,-28,20,16,-23,-24,-24,-26,-19,-8,31,-20,0,-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,0,3,-1,-22,-9,-9,-21,-8,-25,-17,10,-14,2,-9,22,13,-14,-38,-19,1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-27,13,29,-30,-5,-2,-27,3,-21,-17,5,-7,15,-4,2,-9,-26,-28,-20,22;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-25,29,28,-31,-12,-3,-31,6,-27,-22,9,-7,8,-2,8,-3,-24,-34,-19,18;
MA   /M: SY='M'; M=0,-20,-18,-26,-21,-4,-14,-18,12,-18,12,17,-19,-22,-15,-17,-10,-1,14,-23,-8,-19;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,-16,-19,-14,-19,15,-20,-14,-15,-8,-9,-10,-15,-14,-20,3,-6,-7,-20,-20,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-1,29,-24,36,17,-32,-8,-4,-29,-1,-24,-23,14,-10,1,-10,3,-7,-23,-34,-20,9;
MA   /M: SY='A'; M=9,-17,-21,-24,-17,-13,-12,-23,8,-12,-3,1,-12,-16,-14,-17,-4,-3,9,-22,-12,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-30,-21,11,-31,-17,21,-28,41,18,-28,-29,-19,-20,-28,-10,10,-15,9,-21;
MA   /M: SY='L'; M=9,-19,-14,-22,-16,-5,-17,-18,7,-19,13,7,-17,-21,-14,-17,-4,0,10,-25,-10,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,7,-20,5,5,-22,-13,-9,-22,8,-21,-15,7,-11,1,4,8,9,-14,-29,-15,3;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-19,-29,-19,6,-26,-18,17,-26,41,20,-27,-27,-17,-19,-25,-9,9,-20,-2,-18;
MA   /M: SY='S'; M=2,7,-13,7,-1,-19,-9,-12,-19,-9,-23,-18,8,-10,-4,-10,27,26,-9,-36,-16,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-13,-24,-14,-2,-9,-20,-12,0,-14,10,6,-13,-1,-7,-14,-14,-8,-7,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-6,-21,-6,7,-25,-9,-14,-19,1,-22,-15,-5,10,-1,-9,8,-1,-15,-27,-21,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-27,-1,20,-36,-17,4,-20,7,-19,-4,-1,-9,45,4,1,-9,-26,-21,-13,33;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,2,-29,-23,0,-28,-19,14,-23,21,20,-23,-27,-17,-19,-18,-4,12,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-15,-25,-24,-1,-27,-23,24,-20,13,9,-17,-28,-23,-19,-12,-3,31,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-13,5,-30,8,10,-30,-19,-7,-31,41,-29,-13,3,-11,9,31,-9,-10,-21,-23,-11,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,29,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-12,-19,-11,-21,8,-20,-13,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-3,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,-1,-18,-1,11,-26,-1,-8,-22,-4,-23,-15,2,-9,9,-8,17,3,-16,-30,-19,10;
MA   /M: SY='T'; M=6,-6,-14,-12,-9,-13,-15,-17,-8,-9,-12,-9,-1,-12,-7,-6,16,24,-1,-29,-13,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,30,-21,15,-3,-21,9,5,-23,-3,-30,-20,48,-19,-3,-3,11,-1,-28,-37,-21,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-8,-23,-11,3,-21,-20,0,-6,-3,-2,11,-7,-15,27,-1,-3,-2,-13,-22,-8,15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-31,-21,20,-29,-18,17,-28,42,20,-28,-29,-21,-19,-28,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-33,-24,6,-33,-24,31,-29,36,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-24,-9,-4,-17,-15,6,-20,8,-13,-7,2,-19,2,28,-3,-6,-15,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-38,-28,51,-31,-21,12,-30,21,8,-22,-29,-32,-21,-22,-10,7,-2,18,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,15,-30,24,-20,-9,1,-20,10,60,-10,-11,-21,-21,-6,0;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-22,-34,-25,51,-29,-21,2,-27,9,1,-22,-14,-33,-20,-19,-9,2,-2,15,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-15,34,-27,48,19,-34,-11,-1,-36,3,-28,-26,15,-10,3,-1,4,-6,-26,-37,-19,10;
MA   /M: SY='D'; M=-19,33,-30,47,19,-34,-13,0,-37,8,-27,-24,14,-12,4,10,-2,-10,-28,-34,-18,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-2,-20,-1,7,-8,-16,18,-16,-4,-13,-8,-1,-12,3,-5,3,1,-15,-15,12,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=2,-12,-23,-14,-5,-16,-7,-15,-10,-3,-5,-4,-8,-16,-6,0,-5,-7,-7,-22,-13,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-15,-28,-25,0,-30,-27,24,-21,14,10,-23,-24,-23,-20,-9,6,31,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-25,-33,-23,5,-30,-24,23,-27,30,14,-26,-25,-19,-23,-25,-11,12,-5,1,-22;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-18,0,5,-26,1,-6,-21,-4,-24,-15,9,-11,10,-7,18,3,-18,-31,-19,7;
MA   /M: SY='A'; M=15,-14,-1,-19,-11,-14,-14,-18,-4,-16,-2,-4,-11,-18,-7,-18,3,-1,-1,-27,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-14,-5,-8,-11,-19,-18,-9,-12,-3,-8,-3,-13,-10,-12,10,31,-2,-29,-10,-9;
MA   /M: SY='R'; M=1,-1,-21,-1,3,-25,-11,-4,-23,7,-22,-13,3,-13,12,18,9,0,-17,-27,-15,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-29,6,13,-27,-15,10,-25,1,-24,-15,4,13,3,-6,-3,-9,-25,-30,-15,6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-21,-4,-2,-21,-8,2,-20,2,-21,-10,6,-16,5,8,7,3,-14,-29,-12,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-27,-14,-4,-15,-22,-8,-15,6,-5,-4,-9,-6,3,26,-11,-5,-14,-22,-10,-3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-17,1,-7,-17,-8,-15,-7,-11,-14,-10,-6,-2,-12,-14,3,-1,2,-28,-16,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-21,17,7,-23,-7,-7,-21,3,-19,-14,3,-12,-2,1,0,-6,-12,-27,-15,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=7,14,-23,20,17,-30,-2,-8,-28,-3,-21,-20,3,-8,0,-12,3,-8,-20,-29,-21,8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-18,-28,-20,7,-29,-21,18,-27,41,16,-27,-28,-20,-19,-24,-4,12,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-5,-22,-7,2,-21,-19,-4,-7,-4,-7,0,-2,-16,20,-3,0,0,-10,-26,-10,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-28,1,19,-32,-20,12,-23,9,-19,-5,1,-11,37,14,0,-5,-26,-23,-9,27;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-15,-21,-16,-9,-17,-21,10,-18,-1,0,-12,-18,-14,-19,6,4,15,-29,-12,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-31,-1,2,-23,-20,74,-28,-8,-21,-3,5,-3,12,-2,-9,-18,-30,-29,10,2;
MA   /M: SY='T'; M=20,-6,-11,-15,-10,-14,-10,-17,-8,-10,-9,-4,-5,-11,-8,-14,14,22,0,-26,-14,-9;
MA   /M: SY='G'; M=16,-2,-17,-8,-10,-22,19,-15,-22,-12,-23,-16,5,-14,-10,-15,15,3,-14,-27,-22,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-26,-26,-36,-26,-3,-31,-25,37,-24,16,21,-19,-19,-16,-26,-16,-9,23,-20,-3,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-23,-20,-26,-19,-1,-10,-18,7,-24,27,15,-22,-25,-16,-19,-19,-10,3,-20,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-21,-26,-16,1,-26,-13,13,-13,30,26,-23,-24,-10,-10,-24,-10,6,-20,-1,-13;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-19,-10,-9,-21,13,-15,-24,-6,-21,-15,0,-15,-8,-1,12,6,-14,-26,-19,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-6,-28,-7,3,-22,-20,6,-13,-2,-8,-2,-2,-2,18,3,-8,-10,-21,-24,-10,9;
MA   /M: SY='A'; M=13,-20,-20,-22,-12,-12,-16,-21,0,-17,5,-2,-20,6,-15,-20,-9,-5,0,-23,-15,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-26,-17,-29,-22,7,-26,-23,19,-24,20,10,-22,-25,-21,-21,-13,-4,20,-22,-4,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-28,3,28,-29,-17,-4,-24,7,-20,-14,-4,6,18,4,-1,-9,-24,-26,-18,22;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,5,-23,9,12,-28,-15,-5,-21,8,-23,-12,2,-11,15,2,6,-2,-15,-29,-15,13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-20,-25,-21,-7,-2,-29,-3,12,-21,24,11,-18,-22,-10,-16,-21,-11,3,-23,0,-10;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
//