ID   RNApol_arch_Rpo8; MATRIX.
AC   MF_00866;
DT   29-SEP-2021 CREATED; 29-SEP-2021 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE.
DE   DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo8 [rpo8] [rpo8].
CC   /VERSION=1;
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=110;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=105;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0770855; R2=0.0103413; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1502; N_SCORE=18.619; MODE=1; TEXT='?';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=525; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-19,47,-24,-25,-18,0,-25,-23,-26,-12,-13,-16,-31,-25,-25,-9,-12,-10,-35,-25,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-24,-2,9,-23,-19,-10,-20,21,-20,-10,-1,-12,4,15,-1,0,-12,-25,-13,6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-33,-29,0,-33,-30,36,-23,13,13,-26,-26,-26,-23,-12,-2,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-20,-2,4,-17,-17,-11,-11,0,-13,-9,2,-15,-2,1,3,4,-5,-30,-14,0;
MA   /M: SY='S'; M=-3,14,-19,18,7,-26,-2,-6,-28,-1,-29,-21,13,-11,1,-2,19,5,-19,-36,-19,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-23,-32,-26,-3,-34,-27,34,-20,12,15,-20,-21,-19,-21,-14,-4,29,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-28,12,34,-29,-19,-3,-24,13,-20,-14,1,-6,17,3,-1,-8,-23,-28,-16,25;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-4,-33,1,7,-30,-19,-8,-26,16,-27,-14,-5,22,8,14,-8,-10,-26,-25,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-23,-6,-5,-21,24,-15,-25,-15,-18,-14,-1,-16,-9,-15,7,-5,-18,-27,-22,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-8,-24,-9,1,-20,-15,-10,-17,12,-14,-7,-4,-15,3,18,-2,-5,-11,-23,-12,1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-25,-33,-24,7,-33,-20,30,-27,33,20,-25,-26,-18,-23,-25,-10,16,-16,7,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-12,-35,-8,4,-28,-21,-12,-21,9,-25,-13,-11,37,3,7,-9,-10,-24,-25,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-27,6,-2,-25,23,-9,-32,-4,-26,-19,7,-16,-7,-6,2,-9,-25,-24,-18,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-19,-28,-21,-1,-27,-21,22,-21,20,15,-20,-24,-15,-19,-15,-4,19,-23,-5,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-6,-26,-7,-9,2,-22,-4,-7,-5,-1,-4,-6,-22,-9,-6,-13,-6,-10,-5,16,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-32,-25,-1,-33,-25,30,-19,17,13,-21,-24,-19,-13,-18,-7,25,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-17,-29,-23,-4,-25,-26,22,-21,13,8,-21,-22,-20,-22,-10,-3,24,-23,-8,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,3,-23,-1,2,-20,-18,-1,-18,11,-18,-10,6,-14,1,12,0,3,-13,-27,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=3,-23,-18,-30,-21,14,-23,-20,12,-22,16,10,-20,-23,-20,-20,-12,-6,10,-15,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-26,12,16,-26,-13,-7,-25,10,-22,-16,3,-10,5,8,3,-3,-18,-29,-16,9;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-9,68,-18,-20,-21,-13,-21,-28,-22,-24,-20,-5,-30,-20,-22,3,-4,-14,-45,-27,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,11,-29,15,14,-31,6,-3,-29,0,-23,-16,8,-12,10,-5,-1,-12,-28,-28,-19,12;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-26,31,15,-30,-8,-2,-29,7,-27,-21,19,-11,3,-1,3,-6,-25,-34,-18,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-18,-24,-24,-15,2,-29,-16,11,-12,8,5,-14,-20,-12,-9,-12,-1,6,-15,5,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-23,7,19,-25,-18,-7,-22,12,-21,-13,4,-8,9,4,4,6,-17,-28,-14,14;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-18,-33,-28,3,-32,-27,32,-24,19,15,-26,-26,-24,-23,-16,-5,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-24,7,23,-21,-16,-4,-20,2,-16,-12,4,-9,8,-3,3,3,-20,-27,-12,16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-25,-19,-33,-24,28,-26,-13,13,-21,20,27,-22,-26,-20,-16,-20,-7,10,-11,9,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,35,-29,49,16,-32,-12,8,-32,-2,-22,-19,15,-12,1,-9,-3,-10,-26,-37,-14,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-22,-26,-18,-2,-29,-21,21,-19,13,12,-19,-23,-16,-19,-15,-6,19,-17,-4,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-13,-24,-16,-10,-11,-25,15,3,-11,-2,4,-8,-19,-6,-10,-9,-8,3,-27,1,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-24,5,15,-23,-16,-5,-20,9,-18,-12,1,-12,8,10,2,-4,-15,-29,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-24,15,22,-26,-14,-3,-21,2,-19,-11,5,-8,10,-4,6,-3,-19,-32,-16,16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-32,-22,7,-32,-23,24,-23,21,14,-23,-14,-19,-21,-21,-10,14,-18,-1,-23;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-9,5,-21,-2,-10,-8,-11,-7,-2,-9,-9,-6,13,-19,-10,-10,-3,-5,-6,-24,-7,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-15,-21,-21,-17,-7,-25,-20,14,-15,3,5,-10,-9,-14,-17,-6,4,11,-25,-8,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-35,-27,49,-30,-17,10,-26,16,8,-22,-29,-30,-19,-21,-9,7,1,24,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-23,-2,2,-17,-15,-10,-20,12,-21,-12,2,-9,0,9,3,0,-13,-27,-12,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-28,8,28,-28,-18,-6,-24,12,-22,-15,-1,3,11,2,0,-5,-22,-28,-18,19;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-29,0,-11,-29,48,-14,-37,-11,-30,-20,9,-18,-13,-13,1,-16,-29,-24,-27,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,19,-27,27,28,-31,-7,-3,-31,4,-25,-21,10,-8,8,-4,5,-5,-27,-33,-20,18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,10,-27,8,15,-29,-15,-3,-27,26,-26,-13,11,-11,12,16,-3,-8,-24,-26,-14,14;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-16,-30,-26,-2,-23,-25,24,-21,12,11,-24,-25,-23,-21,-12,-4,31,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-22,-9,-1,-9,-21,-10,-8,1,-7,-5,-5,-17,-3,3,-5,-1,-4,-22,-5,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-19,-34,-27,18,-30,-24,23,-24,15,13,-22,-25,-25,-22,-15,-5,22,-16,3,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-11,-23,-12,4,-10,-27,-16,7,-9,-2,-1,-11,-16,-7,-10,-7,-4,8,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-27,6,-34,-27,33,-27,23,15,-24,-25,-23,-24,-19,-5,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,2,-12,3,0,-19,-4,-11,-19,-10,-24,-18,8,-11,-2,-11,31,19,-10,-38,-18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,1,-28,3,17,-26,-20,-4,-29,27,-23,-13,1,-11,12,32,-5,-5,-21,-24,-13,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,15,-23,15,24,-26,-5,-1,-26,1,-26,-20,18,-9,9,-3,12,-1,-25,-34,-20,16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-12,-27,-12,-3,-17,-24,-13,-12,21,-8,-2,-9,-14,-1,21,-14,-9,-7,-21,-8,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-38,-9,4,-27,-21,-18,-16,-7,-24,-16,-18,68,-7,-17,-10,-10,-25,-29,-26,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-26,16,27,-29,-15,-4,-27,14,-24,-17,6,-7,11,4,2,-6,-22,-30,-17,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-7,-20,-20,26,-26,-2,-8,-17,-5,-7,-14,-22,-19,-15,-14,-8,-10,3,34,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-20,-12,-7,-13,-15,-15,-9,0,-4,-2,-6,-16,-6,-2,0,8,-5,-25,-10,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-27,23,22,-33,-13,-1,-27,2,-24,-17,8,-2,17,-4,4,-6,-26,-31,-18,19;
MA   /M: SY='G'; M=-7,4,-27,3,0,-26,11,5,-28,0,-26,-15,10,-16,-2,-2,1,-10,-24,-28,-15,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,33,-28,48,13,-30,-13,4,-31,-2,-24,-23,12,-13,-1,-10,-2,-9,-23,-31,-9,5;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-20,3,-30,15,3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-22,99,-30,-30,-17,-30,-30,-20,-28,-15,-15,-22,-38,-30,-28,-10,-8,0,-47,-27,-30;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-24,-13,-17,-27,49,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-30,-4,1,-21,-21,52,-25,7,-19,-3,4,-18,11,18,-10,-15,-23,-25,7,2;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-10,-19,-28,61,-20,-37,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-15,-27,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-16,-23,-18,-17,14,-26,10,0,-11,-2,1,-15,-25,-10,-10,-9,2,-3,6,45,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-18,-31,-25,6,-31,-25,26,-23,24,14,-27,-28,-24,-20,-19,-6,28,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-14,-32,-29,18,-29,-25,21,-22,9,7,-26,-29,-30,-20,-12,-3,33,-17,3,-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,-4,-16,-8,-5,-13,-14,-11,-15,-3,-17,-12,0,-9,-4,-4,16,20,-8,-26,-6,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-26,4,13,-20,-22,-8,-8,-2,-11,-6,-6,-8,4,-8,-5,-7,-7,-26,-10,8;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-29,3,14,-27,-16,-7,-29,30,-24,-12,0,-11,8,24,-7,-8,-21,-23,-13,10;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-20,5,14,-21,-12,2,-19,13,-17,-9,3,-4,13,10,-1,-6,-17,-18,-9,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-6,8,-19,8,6,-18,-9,1,-14,-2,-11,-9,7,-11,3,-4,-1,-4,-14,-23,-10,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-28,19,10,-31,13,-8,-34,0,-27,-21,7,-9,-2,-7,1,-11,-27,-28,-22,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-25,14,12,-27,10,-4,-29,0,-27,-20,18,-12,1,-5,5,-7,-27,-30,-21,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-20,-4,-1,-21,-7,-5,-22,8,-22,-12,5,-13,3,9,9,8,-15,-26,-13,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-15,-27,-18,-11,8,-24,-4,-6,4,-6,-2,-12,-20,-5,4,-16,-10,-9,6,22,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-20,-24,-17,1,-26,-19,11,-12,6,4,-16,-23,-16,-4,-12,-6,15,-21,-5,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-17,-8,-12,-2,-21,-11,-3,-14,-6,-6,-6,-17,-14,-14,2,13,3,-23,-1,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-21,-26,-18,-1,-29,-20,22,-22,18,11,-20,-23,-13,-19,-14,-5,17,-22,-2,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-37,-28,7,-36,-27,39,-29,25,18,-23,-24,-22,-26,-21,-9,26,-19,1,-28;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-12,-1,-2,-21,7,-11,-22,-11,-30,-20,9,-11,-2,-11,36,16,-12,-38,-21,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-22,-29,-21,6,-20,-21,16,-27,28,13,-22,-26,-20,-21,-20,-9,9,-20,-3,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-24,-30,-27,-24,25,-4,-10,-15,-21,-9,-9,-18,-26,-23,-17,-18,-16,-16,31,22,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-29,-12,-20,-27,60,-20,-34,-21,-24,-17,-3,-21,-20,-20,-2,-19,-24,-20,-28,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-23,-31,-22,16,-30,-21,17,-26,22,10,-25,-14,-23,-21,-22,-9,10,-14,4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,28,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-30,-17,-34,-28,17,-32,-26,26,-26,20,12,-26,-28,-28,-22,-18,-6,29,-19,1,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-14,-26,-15,-8,-16,-25,-3,-4,10,-10,0,-9,-19,-2,16,-11,-9,2,-23,-5,-7;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-23,-34,-26,13,-28,-24,27,-27,21,13,-21,-24,-23,-23,-20,-9,18,-15,2,-26; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-23,-2,5,-18,-18,-9,-13,7,-15,-9,-1,-14,0,6,0,-2,-7,-26,-11,1;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-17,-6,-2,-15,-11,-13,-16,-7,-22,-13,0,5,-4,-10,19,15,-11,-32,-16,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,13,-27,13,10,-28,-13,-2,-25,9,-27,-17,14,0,9,6,3,-3,-25,-31,-17,8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-26,10,16,-25,-16,-4,-21,10,-19,-12,8,-11,10,3,0,-6,-20,-29,-14,13;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-22,5,14,-24,-6,-4,-22,5,-20,-12,4,-5,11,2,5,-4,-20,-25,-15,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-14,0,3,-12,-10,-6,-8,5,-9,-5,1,-7,1,2,0,-2,-7,-16,-7,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-8,-17,-10,-7,-7,-9,-5,-5,-6,2,0,-5,-16,-4,-6,-6,-3,-6,-16,-3,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-21,11,0,-20,2,-6,-18,-5,-14,-11,7,-8,-2,-7,-1,-7,-17,-23,-14,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-34,-24,30,-31,-21,17,-30,34,14,-26,-29,-26,-21,-25,-10,10,-12,8,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-6,11,-24,5,8,-24,-12,-3,-23,20,-25,-11,17,-12,5,10,3,-2,-20,-29,-15,7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-27,-21,-11,-8,-26,-15,9,-14,0,8,-20,7,-11,-17,-13,-8,4,-20,-4,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-5,-19,-12,-13,-9,-13,-6,2,-10,3,23,-5,-18,-5,-10,-5,2,0,-26,-8,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-14,30,-27,41,21,-32,-14,-3,-31,5,-25,-22,12,-10,2,-5,1,-4,-23,-35,-18,11;
MA   /M: SY='H'; M=-14,4,-30,7,14,-27,-19,36,-30,17,-24,-8,5,-13,13,11,-8,-14,-26,-26,0,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-21,-29,-26,10,-32,-15,24,-21,15,11,-25,-28,-21,-19,-17,-6,24,-10,18,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-20,-33,-27,25,-31,-20,20,-25,16,9,-23,-27,-26,-20,-17,-5,19,-10,13,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-15,76,-23,-23,-22,-15,-20,-31,-19,-22,-18,-14,-33,-22,-20,-9,-12,-15,-42,-25,-23;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-18,-32,-25,0,-29,-26,29,-23,19,15,-25,-25,-22,-22,-15,-5,29,-24,-6,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-23,-3,-1,-21,-15,-10,-15,9,-16,-7,-1,-14,0,10,1,-3,-9,-26,-13,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-4,3,-22,-20,-5,-24,29,-25,-10,0,-2,3,19,-9,-9,-18,-22,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-5,-21,-5,1,-15,-18,-6,-8,-4,-8,-6,-3,-15,-3,-3,2,0,-5,-29,-11,-2;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
//