ID   LPS_assembly_LapA; MATRIX.
AC   MF_01948;
DT   21-JAN-2015 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE.
DE   Lipopolysaccharide assembly protein A [lapA] [lapA].
CC   /VERSION=7;
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=94;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=89;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=8.3430367; R2=0.0056768; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8707.3349609; R2=2.0011868; TEXT='Heuristic';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1268; H_SCORE=11244; N_SCORE=15.546; MODE=1; TEXT='?';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=28; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??';
MA   /DEFAULT: M0=-23; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-20,-53,-28,-61,-42,-3,-54,-43,26,-33,28,72,-44,-41,-18,-33,-31,-10,20,-34,-30,-34;
MA   /M: SY='K'; M=-15,-12,-60,-22,5,-50,-32,-8,-50,69,-40,-30,-2,-22,18,44,-12,-12,-40,-58,-40,8;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-23,-37,-30,-23,-12,-22,2,-35,-13,-30,-26,-15,-35,-10,-10,1,-12,-29,-19,16,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-32,-61,-26,-68,-59,15,-67,-50,44,-48,22,19,-59,-52,-47,-48,-40,-25,22,-38,-14,-58;
MA   /M: SY='I'; M=-31,-64,-27,-68,-59,10,-68,-49,36,-45,33,21,-60,-51,-45,-45,-40,-26,20,-38,-15,-55;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=4,-31,-28,-37,-29,-25,-22,-26,-11,-14,-21,-14,-25,-32,-22,-26,-5,0,-5,-40,-18,-27; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-26,-54,-30,-59,-53,25,-59,-35,15,-41,11,11,-51,-50,-40,-43,-30,-17,4,-27,2,-50;
MA   /M: SY='I'; M=-25,-62,-26,-66,-54,5,-65,-48,35,-43,26,21,-56,-48,-42,-43,-37,-20,30,-40,-18,-50;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-56,-25,-58,-48,0,-52,-43,15,-36,16,9,-52,-36,-39,-41,-26,-20,12,-40,-20,-45;
MA   /M: SY='V'; M=-19,-58,-26,-60,-47,1,-59,-44,23,-41,8,7,-51,-46,-40,-42,-31,-10,32,-28,-15,-46;
MA   /M: SY='I'; M=-15,-59,-24,-63,-52,-13,-54,-51,29,-39,25,15,-53,-44,-41,-42,-31,-20,22,-46,-28,-48;
MA   /M: SY='A'; M=13,-46,-21,-47,-37,-9,-36,-36,-3,-27,1,-1,-41,-32,-31,-36,-8,-8,7,-42,-23,-35;
MA   /M: SY='I'; M=-27,-64,-20,-67,-57,3,-67,-50,31,-44,31,18,-58,-50,-44,-44,-37,-23,24,-40,-19,-53;
MA   /M: SY='F'; M=-29,-61,-33,-62,-57,51,-60,-33,7,-45,15,8,-58,-53,-45,-46,-36,-31,-1,-20,11,-54;
MA   /M: SY='I'; M=-20,-60,-24,-64,-51,-6,-62,-50,36,-41,26,24,-54,-45,-40,-42,-34,-16,33,-43,-25,-47;
MA   /M: SY='I'; M=-23,-61,-24,-64,-52,-5,-65,-50,36,-42,27,18,-55,-47,-42,-42,-35,-14,34,-44,-23,-49;
MA   /M: SY='A'; M=33,-24,-24,-28,-25,-40,5,-31,-34,-16,-31,-23,-18,-24,-22,-30,22,0,-22,-53,-39,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-21,-58,-26,-62,-52,-8,-55,-49,26,-39,25,17,-51,-46,-40,-41,-31,-16,20,-44,-25,-48;
MA   /M: SY='T'; M=2,-36,-20,-41,-33,-23,-40,-38,1,-24,-7,-1,-29,-34,-26,-31,-4,25,14,-47,-27,-32;
MA   /M: SY='F'; M=-33,-64,-31,-67,-60,32,-67,-42,21,-46,31,18,-60,-53,-46,-46,-40,-31,7,-29,-2,-56;
MA   /M: SY='G'; M=13,-22,-51,-30,-36,-56,73,-38,-63,-26,-63,-44,-14,-43,-36,-38,-4,-24,-51,-58,-56,-36;
MA   /M: SY='A'; M=35,-22,-19,-26,-21,-37,-6,-29,-31,-14,-28,-20,-16,-21,-19,-28,30,6,-18,-53,-35,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-23,-7,-51,-16,1,-44,-36,9,-43,12,-36,-20,9,-33,29,15,-10,-12,-33,-50,-28,10;
MA   /M: SY='N'; M=-30,46,-51,17,-9,-57,-12,17,-60,-1,-59,-40,85,-40,1,-9,8,-2,-50,-68,-36,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,11,-54,16,16,-55,-20,-12,-55,-4,-54,-36,8,-20,12,-17,-3,-7,-41,-61,-46,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-10,-49,-10,28,-48,-37,9,-47,13,-41,-16,-4,-28,65,2,-7,-10,-35,-44,-30,40;
MA   /M: SY='V'; M=-17,-47,-34,-48,-31,-25,-54,-38,6,-22,4,8,-39,-20,-17,-28,-24,-14,12,-49,-32,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-18,-60,-21,-64,-48,-15,-64,-53,49,-43,16,16,-54,-44,-43,-43,-34,-8,56,-49,-30,-47;
MA   /M: SY='T'; M=4,-16,-25,-25,-19,-36,-29,-17,-21,-12,-27,-9,-6,-30,-9,-21,11,41,-3,-49,-27,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-30,-61,-29,-63,-55,37,-63,-39,25,-47,11,10,-58,-52,-47,-47,-38,-25,19,-27,1,-55;
MA   /M: SY='N'; M=-22,44,-48,25,-6,-57,-12,2,-58,-4,-58,-41,69,-36,-3,-14,17,1,-48,-70,-41,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-40,-51,-49,-60,-51,45,-60,26,-28,-41,-18,-28,-42,-60,-32,-41,-31,-31,-29,28,104,-42;
MA   /M: SY='L'; M=-30,-62,-34,-64,-53,14,-65,-30,11,-40,32,15,-53,-50,-38,-39,-37,-28,6,-31,-1,-47;
MA   /M: SY='I'; M=-28,-63,-25,-67,-56,5,-67,-50,40,-45,27,19,-58,-49,-45,-45,-38,-22,29,-41,-19,-53;
MA   /M: SY='A'; M=55,-20,-20,-16,-17,-43,3,-30,-37,-12,-37,-26,-23,-15,-20,-31,15,-4,-18,-54,-43,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-19,-10,-52,-11,28,-49,-41,2,-44,22,-39,-15,-5,-29,64,6,-12,-12,-35,-46,-34,39;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-46,-15,-22,-49,26,-29,-52,-11,-49,-37,-4,-35,-22,-26,8,-13,-43,-60,-47,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-22,18,-65,27,51,-56,-36,3,-59,2,-58,-40,4,-25,20,-13,-7,-13,-42,-61,-44,38;
MA   /M: SY='F'; M=-33,-60,-36,-63,-55,44,-62,-23,3,-44,12,6,-54,-54,-41,-44,-36,-29,-1,-12,27,-50;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-17,-51,-24,-5,-45,-33,7,-48,15,-41,-28,-8,-18,13,37,-5,-14,-37,-50,-31,3;
MA   /M: SY='L'; M=-24,-67,-27,-67,-56,-4,-66,-50,24,-40,49,25,-58,-47,-40,-40,-37,-25,17,-42,-23,-49;
MA   /M: SY='S'; M=18,-11,-28,-16,-13,-44,-18,-25,-41,-12,-41,-31,-4,11,-15,-23,46,7,-30,-61,-37,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-30,-22,-37,-31,-28,-40,-36,-5,-20,-5,2,-21,-34,-20,-27,3,36,8,-48,-28,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-27,-68,-29,-68,-57,1,-68,-49,22,-40,50,26,-58,-49,-40,-40,-38,-26,18,-40,-19,-49;
MA   /M: SY='L'; M=-27,-66,-27,-68,-56,-4,-67,-51,30,-41,46,32,-57,-48,-39,-41,-38,-24,21,-42,-23,-49;
MA   /M: SY='A'; M=28,-36,-26,-38,-32,-30,1,-35,-25,-23,-23,-17,-31,-29,-30,-35,1,-11,-12,-48,-36,-31;
MA   /M: SY='I'; M=-20,-50,-27,-56,-47,-12,-46,-46,21,-40,0,3,-44,-46,-39,-41,-26,-6,20,-34,-23,-46;
MA   /M: SY='V'; M=-13,-53,-23,-56,-45,-11,-56,-46,24,-36,14,11,-46,-42,-37,-39,-24,0,32,-45,-24,-42;
MA   /M: SY='F'; M=-31,-60,-36,-60,-58,70,-59,-27,-3,-46,9,5,-58,-55,-47,-47,-36,-35,-12,-12,22,-56;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-50,-32,-52,-47,-7,-27,-40,-7,-34,6,0,-43,-43,-37,-39,-20,-22,-5,-42,-24,-43;
MA   /M: SY='V'; M=0,-41,-16,-47,-40,-24,-34,-43,6,-31,-7,-3,-35,-38,-33,-37,-7,0,8,-49,-32,-39;
MA   /M: SY='G'; M=0,-20,-60,-30,-40,-60,90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
MA   /M: SY='F'; M=-26,-56,-34,-57,-53,56,-56,-29,-3,-43,6,4,-53,-52,-43,-44,-32,-25,-6,-17,15,-52;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-56,-26,-60,-50,-9,-48,-48,24,-39,18,17,-50,-44,-39,-42,-29,-19,17,-44,-27,-47;
MA   /M: SY='L'; M=-24,-64,-21,-66,-55,-8,-66,-51,29,-41,38,21,-56,-48,-41,-41,-35,-18,26,-44,-25,-49;
MA   /M: SY='G'; M=16,-17,-42,-25,-30,-52,52,-34,-56,-22,-56,-40,-9,-36,-30,-34,14,-13,-45,-58,-50,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-35,-69,-35,-72,-57,-3,-55,-45,-13,-53,-18,-13,-62,-60,-42,-48,-47,-36,-18,66,4,-51;
MA   /M: SY='L'; M=-24,-65,-18,-68,-57,-7,-66,-53,30,-42,39,21,-58,-48,-42,-43,-36,-23,21,-44,-25,-51;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-50,-21,-55,-44,-5,-47,-43,21,-35,5,12,-47,-39,-36,-40,-21,-10,19,-42,-24,-43;
MA   /M: SY='C'; M=1,-42,2,-47,-41,-8,-37,-38,-12,-32,-11,1,-35,-39,-30,-38,-6,-4,-7,-40,-24,-39;
MA   /M: SY='G'; M=0,-36,-36,-41,-40,-29,3,-39,-25,-29,-18,-15,-28,-41,-33,-36,-7,-13,-19,-50,-36,-37;
MA   /M: SY='L'; M=-24,-53,-34,-56,-48,9,-53,-32,2,-37,12,5,-46,-38,-36,-39,-24,-23,-3,-31,-2,-43;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-42,-36,-47,-40,24,-47,-9,-14,-31,-9,-5,-36,-45,-28,-30,-17,-16,-13,-22,14,-37;
MA   /M: SY='Y'; M=-34,-56,-39,-62,-48,13,-61,-15,-1,-41,-6,-8,-49,-54,-31,-40,-36,-27,-5,9,30,-42;
MA   /M: SY='L'; M=-21,-61,-26,-64,-55,0,-62,-48,25,-40,33,19,-55,-46,-41,-42,-33,-21,15,-41,-20,-49;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-17,-58,-27,-4,-49,-25,-11,-47,45,-40,-30,-7,-27,8,43,-15,-15,-36,-56,-41,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-16,-47,-27,-51,-45,-15,-53,-41,7,-30,24,14,-36,-42,-30,-34,-19,-7,8,-46,-26,-39;
MA   /M: SY='K'; M=-16,-15,-55,-23,1,-48,-34,-6,-47,46,-39,-27,-5,-25,18,46,-9,-11,-36,-54,-38,7;
MA   /M: SY='L'; M=-26,-60,-33,-62,-48,-6,-63,-35,14,-35,25,15,-50,-47,-34,-30,-36,-23,14,-33,-17,-42;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-13,-41,-16,9,-47,-28,-8,-43,19,-38,-20,-7,-23,30,8,3,1,-30,-50,-36,15;
MA   /M: SY='L'; M=-21,-32,-33,-40,-39,-23,-47,-31,-2,-26,12,4,-15,-43,-25,-30,-21,-16,-1,-50,-29,-34;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-29,-48,-36,-19,-40,-33,-17,-31,15,-24,-13,-20,-31,-3,36,-18,-17,-24,-50,-38,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-17,-48,-26,-11,-35,-33,-1,-42,19,-34,-25,-6,-30,4,23,-5,-8,-32,-48,-24,-6;
MA   /M: SY='L'; M=5,-49,-24,-50,-40,-18,-43,-40,-2,-27,20,8,-43,-34,-29,-34,-12,-14,0,-45,-28,-35;
MA   /M: SY='Q'; M=-19,-1,-52,-10,7,-49,-31,3,-49,19,-42,-27,12,-30,22,18,-5,-9,-38,-54,-35,11;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-55,-18,-2,-50,-30,-5,-50,42,-42,-31,7,-26,11,44,-3,-10,-40,-57,-39,2;
MA   /M: SY='K'; M=-16,-14,-53,-21,6,-44,-36,-1,-44,33,-34,-20,-5,-27,25,24,-8,-9,-35,-51,-33,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-25,-60,-26,-64,-53,-10,-65,-50,36,-41,32,22,-52,-47,-41,-42,-36,-19,30,-46,-26,-49;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-7,-55,-17,7,-50,-31,-7,-49,48,-42,-30,2,-24,17,31,-3,-6,-38,-57,-39,9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-22,-53,-29,-6,-42,-37,-6,-44,31,-33,-24,-12,-30,13,32,-14,-16,-36,-38,-30,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-39,-36,-40,-19,-24,-49,-20,-10,-16,2,3,-31,-37,5,-22,-18,-16,-7,-42,-22,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-48,5,24,-51,-24,-12,-48,-3,-48,-32,5,-26,7,-16,12,4,-33,-59,-41,16;
MA   /M: SY='K'; M=4,-25,-37,-28,-9,-39,-31,-19,-31,11,-23,-14,-17,-22,9,-2,-1,-5,-21,-50,-34,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-16,-4,-54,0,36,-50,-38,-3,-47,12,-42,-23,-7,-26,42,-4,-8,-13,-33,-52,-39,37;
MA   /M: SY='I'; M=-23,-35,-34,-43,-33,-22,-52,-31,9,-26,4,2,-26,-42,-26,-31,-20,-15,5,-51,-28,-31;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-37,-5,1,-49,-19,-14,-45,-1,-45,-30,8,-12,0,-16,15,2,-31,-59,-40,0;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-48,-9,9,-50,-31,-12,-43,5,-41,-27,3,-11,7,-12,-2,-10,-29,-59,-41,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-39,-35,-38,-26,-26,-42,-36,-11,-22,2,-3,-34,-27,-21,-30,-12,-15,-4,-51,-33,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-15,-42,-20,-6,-44,-37,-17,-29,2,-33,-20,-10,-30,1,15,-7,8,-15,-52,-37,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-37,-9,-9,-43,-29,-23,-35,3,-33,-23,-2,-18,-7,-14,11,18,-23,-58,-37,-10;
MA   /M: SY='A'; M=1,-26,-36,-29,-14,-39,-36,-30,-17,-4,-24,-16,-22,-11,-15,-21,-5,-2,-8,-56,-39,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-26,-33,-28,-22,-47,-32,-27,-38,-15,-41,-30,-20,24,-20,-18,4,-2,-29,-59,-42,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-32,-32,-25,-32,-38,-35,-5,-21,-12,-9,-24,-29,-24,-30,-7,-5,5,-54,-35,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-15,-50,-23,-2,-42,-25,-15,-38,28,-37,-26,-7,-29,1,0,-9,-4,-26,-52,-31,-4;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
//