ID HIV_VPU; MATRIX. AC MF_04082; DT 30-AUG-2017 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 24-JAN-2024 INFO UPDATE. DE Protein Vpu [vpu] [vpu]. CC /VERSION=2; MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8125670; R2=0.0089979; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7287.2602539; R2=5.7502656; TEXT='Heuristic'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1371; H_SCORE=15170; N_SCORE=14.157; MODE=1; TEXT='?'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=744; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='??'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-3,20,-13,24,55,-21,-21,-3,-11,-21,-10,10,-20,0,-11; MA /M: SY='H'; M=-12,-8,-26,-7,4,-13,-22,21,-12,-8,-2,1,-6,-18,12,-5,-8,-10,-16,-20,6,7; MA /M: SY='H'; M=-12,-18,-32,-17,-11,-8,-22,10,-9,-16,-10,-5,-14,2,-8,-14,-13,-12,-16,1,7,-12; MA /M: SY='L'; M=-12,-25,-25,-28,-18,1,-30,-18,16,-16,27,13,-21,-25,-13,-2,-23,-10,8,-20,-2,-18; MA /M: SY='G'; M=-7,1,-30,7,-8,-29,33,-15,-33,-15,-23,-19,0,-5,-14,-18,-4,-16,-27,-26,-25,-12; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; MA /M: SY='L'; M=-3,-16,-16,-19,-12,-2,-18,-13,12,-11,13,7,-12,-15,-9,-5,-12,-6,7,-13,-3,-12; D=-4; MA /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; MA /M: SY='L'; M=-6,-23,-16,-24,-18,4,-24,-18,22,-21,27,14,-21,-21,-16,-17,-18,-6,16,-16,-1,-18; D=-4; MA /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; MA /M: SY='G'; M=17,-6,-14,-11,-11,-17,19,-15,-16,-11,-14,-11,-3,-11,-11,-14,6,0,-9,-16,-17,-11; D=-4; MA /I: I=-4; MI=-21; IM=-21; DM=-21; MA /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-39,-30,20,-36,-28,35,-29,16,14,-21,-24,-26,-26,-19,-9,25,-14,6,-30; MA /M: SY='I'; M=5,-22,-24,-29,-24,-10,-8,-26,17,-23,2,5,-15,-19,-19,-25,-9,-9,14,-21,-11,-24; MA /M: SY='A'; M=36,-15,-15,-25,-15,-15,-9,-22,4,-15,-3,-3,-12,-12,-12,-22,3,-2,7,-20,-15,-15; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22; MA /M: SY='V'; M=6,-16,-19,-19,-18,-14,3,-22,0,-19,-9,-5,-9,-19,-16,-20,4,-2,7,-27,-16,-18; MA /M: SY='V'; M=17,-23,-10,-27,-23,-7,-20,-27,16,-17,3,3,-23,-23,-23,-20,-3,0,33,-27,-13,-23; MA /M: SY='A'; M=31,-14,-12,-21,-12,-12,-9,-20,-3,-15,4,-3,-14,-15,-12,-19,2,3,2,-21,-14,-12; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-35,-26,12,-34,-25,30,-29,31,17,-25,-26,-23,-24,-23,-9,21,-18,2,-26; MA /M: SY='I'; M=-10,-27,-26,-36,-27,16,-33,-26,31,-28,12,11,-17,-21,-22,-26,-13,-7,19,-15,5,-27; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,47,-30,23,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,28,-20,0,-29; MA /M: SY='A'; M=30,-1,-12,-12,-10,-18,-3,-14,-8,-9,-12,-10,4,-15,-10,-15,8,0,-1,-26,-19,-10; MA /M: SY='V'; M=3,-27,-18,-33,-27,-3,-30,-29,33,-23,11,11,-23,-23,-23,-24,-11,-4,35,-24,-7,-27; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,30,-24,21,14,-29,-29,-26,-21,-16,-4,38,-26,-6,-28; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='T'; M=7,-8,-15,-13,-14,-15,4,-20,-13,-14,-14,-11,-4,-15,-14,-15,13,18,-1,-28,-17,-14; MA /M: SY='I'; M=-12,-30,-25,-38,-28,21,-35,-25,31,-30,25,15,-22,-25,-25,-25,-22,-10,18,-13,7,-28; MA /M: SY='V'; M=1,-28,-17,-31,-25,0,-29,-26,28,-24,20,12,-25,-25,-23,-22,-15,-5,30,-24,-6,-25; MA /M: SY='Y'; M=-17,-25,-27,-27,-22,27,-31,1,11,-19,15,7,-22,-29,-17,-16,-22,-10,0,10,47,-22; MA /M: SY='I'; M=-13,-19,-30,-24,-14,-11,-30,-17,12,1,0,6,-10,-19,-6,12,-15,-10,6,-20,-5,-14; MA /M: SY='E'; M=-10,8,-30,15,49,-30,-20,-2,-30,19,-22,-18,0,-2,18,7,-2,-10,-28,-28,-18,33; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='R'; M=-13,-10,-28,-10,0,-17,-22,-9,-19,25,-8,-3,-7,-18,3,32,-15,-10,-13,-20,-8,0; MA /M: SY='K'; M=-11,1,-30,4,20,-29,-20,-7,-30,39,-27,-12,0,-9,12,27,-8,-10,-22,-22,-12,16; MA /M: SY='I'; M=-10,-23,-27,-28,-16,-6,-32,-18,25,-21,20,15,-18,-21,-2,-18,-18,-10,10,-20,-2,-11; MA /M: SY='K'; M=-7,-13,-23,-13,-6,-16,-24,-17,-6,20,-9,0,-13,-18,-6,9,-12,-7,4,-23,-9,-6; MA /M: SY='R'; M=-14,-9,-28,-7,10,-16,-22,-6,-18,13,-4,-5,-7,-17,5,27,-13,-10,-15,-22,-10,5; MA /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='R'; M=-17,-4,-30,-2,16,-23,-20,-1,-30,27,-21,-12,0,-14,12,49,-8,-10,-22,-22,-12,11; MA /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8; MA /M: SY='I'; M=-10,-21,-30,-26,-9,-7,-35,-23,32,-21,11,11,-15,-15,-11,-23,-15,-10,16,-22,-5,-14; MA /M: SY='D'; M=-17,24,-29,33,18,-31,-14,0,-34,14,-26,-21,14,-12,6,15,-3,-9,-27,-32,-17,11; MA /M: SY='R'; M=-14,-7,-16,-5,11,-22,-21,5,-27,8,-21,-12,-6,-16,11,14,-10,-13,-25,-7,-7,10; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25; MA /M: SY='L'; M=-12,-24,-24,-26,-18,1,-30,-15,14,-12,17,10,-20,-25,-13,1,-20,-9,10,-17,3,-18; MA /M: SY='E'; M=-12,15,-30,22,31,-35,-18,0,-30,16,-24,-15,4,-7,23,6,-2,-10,-28,-28,-16,27; MA /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27; MA /M: SY='R'; M=-14,-10,-28,-12,-5,-19,-13,-9,-19,16,-16,-7,-2,-18,1,36,-7,-5,-13,-21,-11,-5; MA /M: SY='E'; M=-14,11,-30,20,41,-29,-19,0,-31,13,-21,-19,3,-6,15,15,-2,-10,-28,-29,-18,27; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='A'; M=23,-2,-17,-5,14,-22,-10,-13,-17,-3,-13,-13,-5,-7,0,-12,8,3,-10,-25,-19,7; MA /M: SY='E'; M=-10,1,-30,6,39,-23,-25,-7,-12,1,-11,-11,-5,-5,11,-7,-5,-10,-16,-28,-15,24; MA /M: SY='D'; M=-20,36,-30,52,15,-35,-12,0,-38,7,-28,-25,15,-12,2,8,-2,-10,-28,-35,-18,8; MA /M: SY='S'; M=-1,10,-17,15,5,-25,-5,-6,-26,-2,-29,-21,11,-11,1,1,24,9,-16,-37,-19,2; MA /M: SY='G'; M=-5,4,-30,8,-11,-32,52,-15,-40,-15,-30,-22,5,-18,-15,-18,0,-18,-30,-25,-28,-13; MA /M: SY='N'; M=-5,25,-19,13,1,-21,-3,3,-21,5,-30,-19,40,-16,1,2,14,3,-24,-37,-19,1; MA /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,51,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,5,-2,15,-2,0,-10,-30,-32,-20,33; MA /M: SY='S'; M=3,-5,-15,-5,-5,-9,-7,-3,-15,-10,-23,-15,3,-15,-2,-10,26,13,-10,-24,3,-5; MA /M: SY='E'; M=-12,22,-30,34,37,-33,-6,-2,-35,3,-25,-23,7,-6,8,-6,0,-11,-30,-32,-21,23; MA /M: SY='G'; M=2,-8,-25,-8,-15,-28,54,-18,-35,-18,-30,-20,2,-18,-15,-18,9,-11,-25,-25,-28,-15; MA /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; MA /M: SY='D'; M=-15,42,-24,50,13,-31,-7,2,-31,0,-26,-24,27,-11,0,-7,2,-7,-26,-35,-18,7; D=-5; MA /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='A'; M=14,-7,-16,-12,-10,-18,10,-16,-18,-7,-14,-11,-3,-12,-9,-6,7,5,-9,-20,-17,-10; D=-5; MA /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='E'; M=-9,9,-26,18,53,-26,-18,0,-26,9,-18,-18,0,0,18,0,0,-9,-26,-26,-18,35; D=-5; MA /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27; MA /M: SY='E'; M=-12,-3,-35,3,32,-20,-20,-8,-28,7,-21,-19,-10,-8,9,-2,-11,-15,-29,16,-7,22; MA /M: SY='L'; M=-10,-21,-23,-20,-3,0,-29,-17,12,-21,30,11,-22,-22,-11,-17,-22,-10,3,-22,-5,-7; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; MA /M: SY='Q'; M=2,6,-18,8,13,-25,-8,-3,-20,-1,-21,-13,5,-7,15,-4,14,2,-17,-27,-15,14; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='E'; M=6,-1,-20,-2,10,-22,-3,-11,-21,7,-17,-12,-2,-7,1,-1,2,-1,-14,-21,-15,6; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='L'; M=-7,-16,-16,-15,-15,0,-23,-15,13,-18,22,14,-19,-23,-15,-15,-17,-6,13,-22,-4,-15; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='M'; M=-4,-17,-16,-19,-12,-6,-13,-12,10,-11,5,19,-17,-18,-10,-12,-10,-6,14,-22,-8,-11; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='E'; M=-12,22,-26,34,38,-29,-14,0,-29,5,-21,-21,7,-3,10,-3,0,-9,-26,-29,-17,24; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-27,-18,3,-20,-8,13,-14,20,34,-22,-21,-7,-12,-22,-11,4,1,3,-12; D=-3; MA /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; MA /M: SY='G'; M=-1,-15,-20,-15,-20,-15,26,-20,-12,-18,-8,-6,-10,-21,-20,-17,-6,-12,-3,-20,-18,-20; D=-3; MA /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; MA /M: SY='H'; M=-9,-9,-24,-8,-5,-14,-17,35,-15,-15,-7,-2,-2,-11,-1,-9,-2,-7,-16,-30,1,-5; MA /M: SY='H'; M=-6,-12,-22,-11,-7,-7,-16,10,-12,-16,-7,-5,-5,-4,-7,-12,2,-2,-12,-28,-4,-8; MA /M: SY='H'; M=1,5,-22,3,-2,-21,-12,16,-18,-5,-18,-10,8,-15,0,-1,3,-6,-15,-29,-8,-3; MA /M: SY='P'; M=-8,-15,-31,-12,-6,-21,-2,-18,-18,-2,-13,-9,-13,14,-9,-8,-12,-12,-19,-23,-19,-9; MA /M: SY='W'; M=-13,-29,-29,-31,-25,19,-9,-22,-5,-26,10,-1,-24,-28,-25,-20,-24,-16,-9,25,8,-22; MA /M: SY='D'; M=-20,43,-30,61,16,-33,-12,2,-36,-1,-27,-27,16,-12,-1,-10,-2,-10,-28,-33,-10,7; MA /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; MA /M: SY='I'; M=-5,-4,-19,-11,-12,-12,-8,-11,5,-11,-7,-1,3,-18,-6,-11,-4,-5,3,-24,-11,-10; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=-4,13,-24,14,1,-25,1,-7,-23,-5,-24,-19,11,11,-5,-11,1,-7,-23,-28,-21,-3; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='B'; M=-14,31,-24,31,4,-24,-9,3,-20,-2,-19,-6,24,-16,0,-7,-1,-7,-21,-35,-15,2; MA /M: SY='W'; M=-15,-32,-27,-35,-25,26,-28,-22,6,-28,24,6,-30,-30,-25,-20,-30,-15,-2,29,14,-22; MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105; //