CLUSTAL format seed alignment for MF_00306

_____________________________________________________________________________

Features found in the protein:_____________________________________________________________________________

SRP54_HALSA      -MVLDDLGSSLRGTLDTLRGKSRISE-EDVDKVVKEIQRSLLQADVDVDLVMDLSESITE
SRP54_HALS3      -MVLDDLGSSLRGTLDTLRGKSRISE-EDVDKVVKEIQRSLLQADVDVDLVMDLSESITE
SRP54_HALVD      -MVLDNLGSSLRGSLDKLRGKSRLDE-DDVQEIVKEIQRSLLSADVDVSLVMDLSDSIKT
SRP54_HALWD      -MVLDNLGSSLRGSLDKLQGKSRLDE-DDVEEIVKEIQRSLLSADVEVSLVMELSSSIED
SRP54_HALLT      -MVLDDLGTSLRSSLDKLQGKSRLSE-SDVEEIVKEIQRSLLSADVDVSLVMELSDSIKT
SRP54_NATPD      -MVLDDLGSSLRGTLDKLQGKTTLSE-DDVEEIVKEIQRSLLSADVDVDLVMDLSDSIRE
SRP54_HALMA      -MVLDDLGSSLRGTLDDLRGKSRLSE-EDIEDIVKEIQRSLLQADVDVGLVQDLSNSIET
SRP54_METAC      -MVMEKLGDSLQGALKKLIGAGRIDE-RTVNEVVKDIQRALLQADVNVKLVMGMSQRIKE
SRP54_METMA      -MVMEKLGDSLQGALKKLIGAGRIDE-RTVNEVVKDIQRALLQADVNVKLVMGMSQRIKE
SRP54_METBF      -MVMEKLGDSLQGALKKLIGAGRIDE-RTVNEVVKDIQRALLQADVNVKLVMGMSQRIKE
SRP54_METBU      -MVMDKLGSSLQDALKKLVGAGRIDE-KTVTEVVKDIQRALLQADVNVKLVMQMSSHIKE
SRP54_METAR      -MVLDNLGTSLKDALRKIANSGKIDK-EVIDEVVKDIQRAMIQADVNVKLVMKLSSTIKN
SRP54_METTP      -MVLDNLGGSLRGALKKIASATRVDK-ALVDDAVRDIQRALLQADVNVKLVMSLSNRIRE
SRP54_METLZ      -MGLDTLSNSLKDAMKKLAGKTVIDR-AAVDELVRDLQRALLSSDVNVKLVMELSKQIKA
SRP54_ARCFU      -MALE----SLKEVARKIAGSSSIDK-KFVEEMVKEIQRALIKADVNVRQVKEISDAIKK
SRP54_THEAC      -MVLESFSASLRETIRKITGSSYIDK-ETVKEISKDLQRILLKADVNVKTVLQVTKEMER
SRP54_THEVO      -MVLESLSSSLRETIRKITGSTYIDK-NTVKEISKDLQRILLKADVNVQTVLNITKEMER
SRP54_METKA      ---MIGFADRLAEITKKIKGASIIDE-DFVKEVVRDVQRALLEADVDVKLVLELSKRIEK
SRP54_METTH      --MLGNLGRSLSKTMKKLAGMTIVDE-EVVREVIKDIQRALIQSDVNIKLVFNLSKSIEE
SRP54_METST      --MLEGLSESLTQTMKKLAGMSIIDK-KTLKDVTKDIQRALIQSDVNVKVVFGLTKKIEK
SRP54_METS3      --MLGNLGENLTKTMKKLVGISVIDK-KTIEEVVKEIQRALIQSDVNIALVLDLSKKIKK
SRP54_METMP      --MLDKLGQNLSDALNKLKNATFVDK-KLVKEVIKDIQKALIQSDVNVKLVFNMSKEIER
SRP54_METM5      --MLDKLGQNLSDALNKIKNATFVDK-KLVKEVIKDIQKALIQSDVNVKLVFNMSKEIER
SRP54_METM7      --MLDKLGQNLSEALNKIKNATFVDK-KLVKEVIKDIQKALIQSDVNVKLVFNMSKEIER
SRP54_METM6      --MLDKLGQNLSEALNKIKNATFVDK-KLVKEVIKDIQKALIQSDVNVKLVFNMSKEIER
SRP54_METVS      --MLDKLGQNLSEALNKIKNATFVDK-KLVKEVIKDIQKALIQSDVNVKLVFNMSKEIER
SRP54_META3      --MLDKLGSNINNALSKIKNATFVDK-KLVKEVIKDIQKALIQADVNVKLVFAMSKEIER
SRP54_METJA      --MLDKLGENLNKALNKLKAAAFVDK-KLIKEVIKDIQRALIQADVNVKLVLKMSKEIER
SRP54_PYRAB      -MVLDSLGKALSNALKKIARAGSVDE-ALVKEVVRDIQRALIQADVNVRLVLKLTKEIQR
SRP54_PYRHO      -MVLDSLGRALSNALKKIARAGSVDE-ALVKEVVRDIQRALLQADVNVRLVLKLTKEIQR
SRP54_PYRFU      -MVLDNLGKALANTLKKIARASSVDE-ALIKELVRDIQRALIQADVNVRLVLQLTREIQR
SRP54_THEKO      -MALEKLGQALNSALKKLARSSTVDE-ATIKEIVRDIQRALLQADVNVKLVLQLTKQIQK
SRP54_THEON      -MALEKLGKALNNALRKLARSSTVDE-ATIKEVVRDIQRALIQADVNVRLVLDLTKRIEK
SRP54_THEGJ      -MALEKLGKALNSALRKLARSSTVDE-ALIREVVRDIQRALIQSDVNVRLVLQLTKRIQE
SRP54_AERPE      ------MMEGVRRAVAKFLRGGGVYE-KAVDAFVKDLQRELIKADVNVKLVLNVTRRIKE
SRP54_HYPBU      ----MPGLDDIRRAVSKLLKRSGPYE-NIVNEFIRDLQRALISADVNVRLVFNLTKRIRE
SRP54_STAMF      -----MVLDGVRKALSRFLSGKGDYE-RAVKEFIRDLQKELIKADVNVKLVLELTKKIRE
SRP54_SULIL      ------MLENIRDAVRKFLTGSTPYE-KAVDEFIKELQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKE
SRP54_SULIY      ------MLENIRDAVRKFLTGSTPYE-KAVDEFIKELQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKE
SRP54_SULIN      ------MLENIRDAVRKFLTRSTPYE-KAVDEFIKELQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKE
SRP54_SULIM      ------MLENIRDAVRKFLTGSTPYE-KAVDEFVKELQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKE
SRP54_SULIA      ------MLENIRDAVRKFLTGSTPYE-KAVDEFVKELQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKE
SRP54_SULIK      ------MLENIRDAVRKFLTGSTPYE-KAVDEFVKELQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKE
SRP54_SACS2      ------MLENIRDAVRKFLTGSTPYE-KAVDEFIKDLQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKE
SRP54_METS5      ------MLDGIRDAVRKFLGGNTSYE-VAVEEFIKDIQKALISSDVQVKLVFSLTNKIKE
SRP54_SULAC      ------MLDGLRDAVRKFLG-SSDYE-KAVNEFIKELQIILIKADVNVRLVKDLTDRIKK
SRP54_SULTO      ------MLDNLKDAVRKFLG-SSNYD-KAVNDFIKELQISLIKSDVNVKLVSNLTQKIKD
SRP54_PYRAE      ---MKALTEIFGKLLEKIRGVDYIDE-ATLQELSREIQRTLLKADVPLDLVKSFTENAVK
SRP54_PYRAR      ---MKALTELFSKLVEKIRDVEYIDE-ATLQEIAREIQRTLLKADVPLDLVKTFTDNAVK
SRP54_PYRIL      ---MKALGEVFSKLVEKIRGVSYIDE-ATLQELSREIQRALLKADVPLDMVKTFTENAVK
SRP54_PYRNV      ---MKALSEVFGKLVEKIRGVSYIDE-ATLQDLSREIQRALLKADVPLDMVKAFTDAAVK
SRP54_PYRCJ      ----MKLSEVFSKLIEKIRGVDYIDE-AVLQELSREIQRSLLKADVPLELVKAFTDSAVK
SRP54_BOVIN      -MVLADLGRKITSALRSLSNATIINE-EVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKS
SRP54_CANLF      -MVLADLGRKITSALRSLSNATIINE-EVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKS
SRP54_PONAB      -MVLADLGRKITSALRSLSNATIINE-EVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKS
SRP54_HUMAN      -MVLADLGRKITSALRSLSNATIINE-EVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKS
SRP54_MACFA      -MVLADLGRKITSALRSLSNATIINE-EVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKS
SRP54_MOUSE      -MVLADLGRKITSALRSLSNATIINE-EVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKS
SRP54_RAT        -MVLADLGRKITSALRSLSNATIINE-EVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKS
SRP54_GEOCY      -MVLADLGRKITTALLP-RQRTVINE-EVLQAMLKEICTALLEADVNVKLVGKLRQNVRA
SR542_ARATH      -MVLAELGGRIMSAIQKMNNVTIIDE-KALNDCLNEITRALLQSDVSFPLVKEMQTNIKK
SR543_ARATH      -MVLAELGGRITRAIQQMSNVTIIDE-KALNECLNEITRALLQSDVSFPLVKEMQSNIKK
SR541_ARATH      -MVLAELGGRITRAIQQMNNVTIIDE-KVLNDFLNEITRALLQSDVSFGLVEKMQTNIKK
SR541_SOLLC      -MVLAQLGGSISRALQQMSNATIIDE-KVLNECLNEITRALLQADVQFKLVRDMSTNIKK
SR542_SOLLC      -MVLAELGGSISRALQQMSNATIIDE-KVLNECLNEITRALLQADVQFKLVRDMTTNIKK
SR541_HORVU      -MVLAQLGGSISRALAQMSNATVIDE-KVLGECLNEISRALLQSDVQFKMVRDMQTNIRK
SR542_HORVU      -MVLAQLGGSISRALAQMSNATVIDE-KVLGECLNEISRALLQSDVQFKMVRDMQTNIRK
SR543_HORVU      -MVLADVGGSISRALA-MSSAAVVDE-SVLRECLNEIARALMQSDVRFKTVCDLQANIRK
SRP54_DICDI      -MVLADLGNQLSSALRSLNETTIVNE-DTINQLLKEVGNALSKSDVSMSLIIQMRKNIKD
SRP54_ENTH1      -MVLSQLGSSLVTALRKMTSSTVVDE-EVINTLLKEIETSLLGEDVNPIFIRQMVNNIKK
SRP54_ASPNG      -MVLQDLGRRINAAVNDLTRSNNLDEKQAFDDMIKEICAALLSADVNVRLVQSLRKSIKS
SRP54_SCHPO      -MVFADLGRRLNSALGDFSKATSVNE-ELVDTLLKNICTALLETDVNVRLVQELRSNIKK
SRP54_YARLI      -MVLEDLGKRINGAFANLSKG--GDIDEALDAMLKEVCSALLESDVNIKLVSQLRQKVKN
SRP54_YEAST      -MVLADLGKRINSAVNNAISNTQDDFTTSVDVMLKGIVTALLESDVNIALVSKLRNNIRS
SRP54_CANAX      -MVLADLGSRLRGALSSVESG----SDDEIQQMIKDICSALLESDVNVKLVAKLRGNIKN
SRP54_ECO57      --MFDNLTDRLSRTLRNISGRGRLTE-DNVKDTLREVRMALLEADVALPVVREFINRVKE
SRP54_ECOL6      --MFDNLTDRLSRTLRNISGRGRLTE-DNVKDTLREVRMALLEADVALPVVREFINRVKE
SRP54_ECOLI      --MFDNLTDRLSRTLRNISGRGRLTE-DNVKDTLREVRMALLEADVALPVVREFINRVKE
SRP54_HAEIN      --MFENLSDRLSKTLRNITGKGRLTE-DNIKETLREVRMALLEADVALPVVREFIAKVKE
SRP54_BUCAI      --MFNNLTQRLSDSLKKILNKGRLTE-ENIKETIREVRKALLEADVALSVIKKFIENVKK
SRP54_BUCAP      --MFNNLTERLSQSLRKIINKGRLTE-ENIKDTIREVRKALLEADVTLSVIKKFIQNVSK
SRP54_BUCBP      --MFNNLTQRFLKIIKKISNKGRLTE-KNIKETLREIRIALLEADVALPVVKNFIPSIQK
SRP54_RICCN      --MFKTLTQNLTKIFDKLVSSGILTE-AQIDAAMRDIRVALLESDVALPVIKDFIAEVKQ
SRP54_RICFE      --MFKTLTQNLTKIFDKLVSSGILTE-AQIDAAMRDIRVALLESDVALPVIKDFIAEVKQ
SRP54_RICBR      --MFKTLTQNLMKIFDRLVSSGLLTE-EQIDAALRDIRVALLESDVALPVIKNFVAEVKQ
SRP54_RICPR      --MFKTLTQNLTKIFDKLVNSGILTE-NQIDTAMRDVRVALLESDVALPVIKGFIEEVKQ
SRP54_RICTY      --MFKTLTQNLTKIFDRLVNSGILTE-NQIDTAMRDVRVALLESDVALPVIKGFIAEVKQ
SRP54_BACSU      -MAFEGLADRLQQTISKIRGKGKVSE-QDVKEMMREVRLALLEADVNFKVVKDFVKKVSE
SRP54_STRMU      -MAFESLTERLQGVFKNLRGKRKLSE-KDVQEVTKEIRLALLEADVALPVVKEFIKRVRK
SRP54_SYNE7      --MFDALAERLEQAWTKLRGQDKISE-SNVQEALKEVRRALLEADVNLGVVKEFIAQVQE
SRP54_SYNY3      --MFDALADRLEDAWKKLRGQDKISE-SNIKEALQEVRRALLAADVNLQVVKGFIKDVEQ
SRP54_MYCTU      --MFESLSDRLTAALQGLRGKGRLTD-ADIDATTREIRLALLEADVSLPVVRAFIHRIKE
SRP54_MYCBO      --MFESLSDRLTAALQGLRGKGRLTD-ADIDATTREIRLALLEADVSLPVVRAFIHRIKE
SRP54_MYCLE      --MFESLSNRLTGVIQGLRGKGRLTD-ADIEATTREIRLALFEADVSLPVVRAFVHRIKE
SRP54_THEAQ      --MFQQLSARLQEAIGRLRGRGRITE-EDLKATLREIRRALMDADVNLEVARDFVERVRE
SRP54_AQUAE      --MLELLTEKFSHALEKLTNARKITE-KNINQTLREIRLALLEADVDYQVAKDFIKRIRE
SRP54_HELPY      --MFQALSDGFKNALNKIRFQD--DE-KALDRALDELKKTLLKNDVHHKVARELLKKVES
SRP54_HELPJ      --MFQALSDGFKNALNKIRFQD--DE-KALDRALDELKKTLLKNDVHHKVARELLKKVES
SRP54_MYCGE      -MFKAMLSSIVMRTMQKKINAQTITE-KDVELVLKEIRIALLDADVNLLVVKNFIKAIRD
SRP54_MYCPN      -MFKSMISSIVMRSMQKKINAQTISE-TDVQAVLKEIRIALLDADVNLLVVKNFIKAIRE
SRP54_MYCMY      MGFGDFLSKRMQKSIEKNMKNSTLNE-ENIKETLKEIRLSLLEADVNIEAAKEIINNVKQ
                           .                  .      :   :   **       .      

SRP54_HALSA      RSLEEE----PPGGTSARDHVLRIVYEELVGLVGDS------------------TPIPLE
SRP54_HALS3      RSLEEE----PPGGTSARDHVLRIVYEELVGLVGDS------------------TPIPLE
SRP54_HALVD      RALEEE----PPGGTSARDHVLKIVYEELVDLIGES------------------TEIPLE
SRP54_HALWD      RATGEE----PPAGTSARDHVLRIVYEELVDLVGDS------------------TDLPLK
SRP54_HALLT      RALEEE----PPGGTTAKDHVLKIVYEEMVELVGDS------------------TELPLE
SRP54_NATPD      RALDEE----PPAGTTARDHVLKIVYEEMVELVGES------------------TALPLE
SRP54_HALMA      RALDEE----PPAGTTPRDWVLRIVYEELVDLVGES------------------TELPLE
SRP54_METAC      RAMKEE----PPAGMNPREHVIRIVYQELMEIIGKG------------------AEIQLK
SRP54_METMA      RAMKED----PPAGMNPREHVIRIVYQELMEIIGKG------------------ADIQLK
SRP54_METBF      RAMKEA----PPAGMNPREHVIRIVYQELMEIIGKG------------------AEIQLK
SRP54_METBU      RALKEE----VPPGMNPREHVIKIVYQELISIVGRS------------------ADIPLK
SRP54_METAR      RALTEA----PPAGMNSKEHVLRIVYTELVNIVGKA------------------TPVALQ
SRP54_METTP      RALNEK----PPAGMNPREHVINIVYQELINLIGRG------------------TDIPLK
SRP54_METLZ      RSLDED----LPKGINAREHVLRIVYQELVNLVGKE------------------AEFSLK
SRP54_ARCFU      RALSED----VLPALNAKEQILKIVYEELLRGVGEG------------------LEIPLK
SRP54_THEAC      RALEEK----PPAGMAHQDYMVRIIYEELLKILGEP------------------SNVKLK
SRP54_THEVO      RALEEK----PPVGMAHQDYMVKIIYEELLKILGEP------------------SNVELK
SRP54_METKA      RALEEE----PPAGVPKRDYLLRIVYEELVELLGGEKTEGLD------------IDLSRD
SRP54_METTH      RALNEE----PPKGITPKEHIISIVYDEMVKLLGEKS-----------------HELVID
SRP54_METST      RALEEE----LPKGLSPKEHVMRIVYQELVNLIGEKP-----------------EELKIN
SRP54_METS3      RALEEE----PPKGITPREHVITIIYEEMVNLLGGEA-----------------PGLDID
SRP54_METMP      KAIDEA----PPKGLSKKEHIVKIVYDELVKLLGETT-----------------QKLELD
SRP54_METM5      KAIEEA----PPKGLSKKEHIVKIVYDELVKLLGETT-----------------QKLELD
SRP54_METM7      KAIEEA----PPKGLSKKEHIVKIVYDELVNLLGETT-----------------QKLELD
SRP54_METM6      KAIEEA----PPKGLSKKEHIVKIVYDELVKLLGETI-----------------QKLELD
SRP54_METVS      KAIEEA----PPKGFSKKEHIIKIVYDELVKLLGENP-----------------QKLELD
SRP54_META3      KAIYES----APKGLSKKDHIIKIVYDELVKLLGEEG-----------------QKLELD
SRP54_METJA      RALEEK----TPKGLSKKEHIIKIVYEELVKLLGEEA-----------------KKLELN
SRP54_PYRAB      RALEEK----PPAGISKKEHIIKIVYEELTKFLGTEA-----------------KPIEIK
SRP54_PYRHO      RALEEK----PPAGISKKEHIIKIVYEELTKFLGTEA-----------------KPIEIK
SRP54_PYRFU      RALEEK----PPAGISKKEHIIKIVYEELTKFLGTEA-----------------KPIEIK
SRP54_THEKO      RALEEE----PPAGVSKKEHIIKIVYEELTKFLGTEA-----------------KPLEIK
SRP54_THEON      RALEEE----PPTGVSKKEHIIKIVYEELTKFLGTEA-----------------KPIEIK
SRP54_THEGJ      RALNEK----PPAGVSPREHVIKIVYEELTKLLGKEA-----------------VPLEIR
SRP54_AERPE      RALKEE----PPPGVTRRDWMIKIVYEELVKLFGGDQE----------------PQVDPP
SRP54_HYPBU      RALKEQ----PPPGLSRREWLVKLTYDELVKLFGGEYE----------------PEVKPP
SRP54_STAMF      RALKEE----PPPGITRREWFVNIVYEELSKFFGGDKK----------------PDIKPK
SRP54_SULIL      RLNKEK----PPSVLERKEWFISIVYDELSKLFGGDKE----------------PNVNPT
SRP54_SULIY      RLNKEK----PPSVLERKEWFISIVYDELSKLFGGDKE----------------PNVNPT
SRP54_SULIN      RLNKEK----PPSVLERKEWFISIVYDELSKLFGGDKE----------------PNVNPT
SRP54_SULIM      RLNKEK----PPSVLERKEWFISIVYDELSKLFGGDKE----------------PNVNPT
SRP54_SULIA      RLNKEK----PPSVLERKEWFISIVYDELSKLFGGDKE----------------PNVNPT
SRP54_SULIK      RLNKEK----PPSVLERKEWFISIVYDELSKLFGGDKE----------------PNVNPT
SRP54_SACS2      RLNKEK----PPSVLERKEWFISIVYDELSKLFGGDKE----------------PNVNPT
SRP54_METS5      RLKKET----PPSNLERREWFIKIVYDELSALFGGDKE----------------PEVNPK
SRP54_SULAC      RITEEK----PPSAIEKREWFISIVYDELSRLFGGDKE----------------PEVMPK
SRP54_SULTO      RLEKEK----PPTAIERREWFISIVYDELSKLFGGDIN----------------PEVMPK
SRP54_PYRAE      RIKEEK----PPAGIPPREYLIYVLYEELVKLLGGEQP----------------AEFKPT
SRP54_PYRAR      RIREEK----PPAGIPPREYLIYVLYEELVKLMGGEQP----------------AEFKPT
SRP54_PYRIL      RMREEK----PPAGIPPREYVLYILYDELVKLLGGEQP----------------AEFKPV
SRP54_PYRNV      RIKEEK----PPAGIPPREYLLYVLYEELVKLLGGEQP----------------PEFKPT
SRP54_PYRCJ      RIREEK----PPAGIPPREYLVYVLYEELVKLLGGEQP----------------AEFKPT
SRP54_BOVIN      AIDLEE----MASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVK-----------------AWTPT
SRP54_CANLF      AIDLEE----MASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVK-----------------AWTPT
SRP54_PONAB      AIDLEE----MASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVK-----------------AWTPT
SRP54_HUMAN      AIDLEE----MASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVK-----------------AWTPT
SRP54_MACFA      AIDLEE----MASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVK-----------------AWTPT
SRP54_MOUSE      AIDLEE----MASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVK-----------------AWTPT
SRP54_RAT        AIDLEE----MASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVK-----------------AWTPT
SRP54_GEOCY      AIDFED----MGAGLSKRRIIQTSVFNELCKLLDPGVP-----------------VWHPT
SR542_ARATH      IVNLED----LAAGHNKRRIIEQAIFSELCKMLDPGKS-----------------AFAPK
SR543_ARATH      IVNLED----LAAGHNKRRIIEQAIFSELCKMLDPGKP-----------------AFAPK
SR541_ARATH      IVNLDD----LAAGHNKRLIIEQAIFKELCRMLDPGKP-----------------AFAPK
SR541_SOLLC      IVNLED----LAAGHNKRRIIQQAVYNELCKILDPGKP-----------------AFTLK
SR542_SOLLC      IVNLDD----LAAGHNKRRIIQQAVFNELCKILDPGKP-----------------SFTPK
SR541_HORVU      IVNLET----LAAGTNKRRIIQQAVFTELCNMLDPGKP-----------------AFTTK
SR542_HORVU      IVNLET----LAAGTNKRRIIQQAVFTELCNMLDPGKP-----------------AFTPK
SR543_HORVU      TVNLEA----LAAGTNKRRIIETSVGKELCKMLDTGKP-----------------AFVPK
SRP54_DICDI      KIKLDQ----MAAGLNKRKIIKQVVFDELIRLLDPGVP-----------------LWKPT
SRP54_ENTH1      KINSED----IPDGIDKRKLIKDSVFEELINLVDPKTE-----------------AFKPK
SRP54_ASPNG      SVNFAS----LPPAVNKKRLIQKAVFDELVSLVDPHAE-----------------PFRPK
SRP54_SCHPO      KINVST----LPQGINGKRIVQKAVFDELCSLVDPKVD-----------------AFTPK
SRP54_YARLI      SVKA------TPNGASKKKVIQKALFDELVNLVGVDESAASAA------------KFKPQ
SRP54_YEAST      QLLSENRSEKSTTNAQTKKLIQKTVFDELCKLVTCEGSEEKA--------------FVPK
SRP54_CANAX      KIDESN-VSKETSAMNKRKKLQKIIFDELCALVDSNVEPPKPKKLSTSTKTINGKKVRLS
SRP54_ECO57      KAVGHE----VNKSLTPGQEFVKIVRNELVAAMG--EENQ---------------TLNLA
SRP54_ECOL6      KAVGHE----VNKSLTPGQEFVKIVRNELVAAMG--EENQ---------------TLNLA
SRP54_ECOLI      KAVGHE----VNKSLTPGQEFVKIVRNELVAAMG--EENQ---------------TLNLA
SRP54_HAEIN      SALGEE----VNKSLTPGQEFLKIVQRELEKAMG--EANE---------------SLNLA
SRP54_BUCAI      KSIGHE----INKSLTPGQEFIKIVKHELIFAMG--EKNH---------------SLNFS
SRP54_BUCAP      KAIGHE----INKSLTPGQEFIKIVKNELILSMG--EKNH---------------DLNLS
SRP54_BUCBP      SVIGNQ----VNKSLTPGQELIKIVKKELTLILG--KENH---------------SLNLS
SRP54_RICCN      KALGQE----VIKSVSPGQMIIKIIHEEMINLLASSKSET---------------KLNLN
SRP54_RICFE      KALGQE----VIKSVSPGQMIIKIIHEEMINLLASSESET---------------KLNLN
SRP54_RICBR      KALGQE----VIKSVSPGQMIIKIIHEEMINILSSSEDEI---------------KLNLN
SRP54_RICPR      KALGQE----VIKSVSPGQMIIKIIHEEMINLLASTESTT---------------KLNLN
SRP54_RICTY      KALGQE----VIKSVSPGQMIIKIIHEEMINLLASSESTT---------------KLNLN
SRP54_BACSU      RAVGQD----VMKSLTPGQQVIKVVQEELTELMG--GEES---------------KIAVA
SRP54_STRMU      RAVGHE----VIDTLDPSQQIIKIVNEELTAVLG--SETA---------------EIEKS
SRP54_SYNE7      KAVGTQ----VISGIRPDQQFIKVVYDELVQVMG--ETHV---------------PLAQA
SRP54_SYNY3      KALGAD----VISGVNPGQQFIKIVYDELVNLMG--ESNV---------------PLAQA
SRP54_MYCTU      RARGAE----VSSALNPAQQVVKIVNEELISILG--GETR---------------ELAFA
SRP54_MYCBO      RARGAE----VSSALNPAQQVVKIVNEELISILG--GETR---------------ELAFA
SRP54_MYCLE      RARGTE----VSAALNPAQQIVKIVNEELIGILG--GETR---------------QLAFA
SRP54_THEAQ      EALGKQ----VLESLTPAEVILATVYEALKEALG--GEAR---------------LPVLK
SRP54_AQUAE      KVVGKE----VPKNLSPAEFVIKTVYEELVDILG--GEK--------------------A
SRP54_HELPY      QTKLNG----IGK-----QQFLDALEKSLLEILSA-KGSS---------------GFTFA
SRP54_HELPJ      QTKAGG----IGK-----QQFLDALEKSLLEILSA-KGSS---------------GFTFA
SRP54_MYCGE      KTVGQT----IEPGQDLQKSLLKTIKTELINILS---QPN---------------QELNE
SRP54_MYCPN      QTVGQT----VEPGQDLQKWLLKVIKQELINILS---QPN---------------QEITS
SRP54_MYCMY      KALGGY----ISEGASAHQQMIKIVHEELVNILG---KEN---------------APLDI
                                     .       :   .                           

SRP54_HALSA      ---EQTIMLAGLQGS--GKTTTAAKMAWWFSKK-GLRPAIVQTDTFRPGAYEQAAEMADR
SRP54_HALS3      ---EQTIMLAGLQGS--GKTTTAAKMAWWFSKK-GLRPAIVQTDTFRPGAYEQAAEMADR
SRP54_HALVD      ---SQTIMLAGLQGS--GKTTTSAKMAWWFSKK-GLRPAVIQTDTFRPGAYDQAKQMCER
SRP54_HALWD      ---SQTILLAGLQGS--GKTTSAAKMAWWFSTK-GLRPAVIQTDTFRPGAYDQAEQMCER
SRP54_HALLT      ---NQTILLAGLQGS--GKTTSAAKMAWWFSKK-GLRPAVIQTDTFRPGAYDQAKQMCER
SRP54_NATPD      ---EQTIVLAGLQGS--GKTTTAAKMAWWFSKK-GLRPAVIQTDTFRPGAYDQAKEMCER
SRP54_HALMA      ---EQTIMLAGLYGS--GKTTTAAKMAWWFSTK-GLRPAIIQTDTDRPGAYDQSKEMAER
SRP54_METAC      ---PQTIMMVGLQGS--GKTTSAAKLARYFQRK-GLKAGVVAADTFRPGAYHQLKTLAEK
SRP54_METMA      ---PQTIMMVGLQGS--GKTTSAAKLARYFQRK-GLKAGVVAADTFRPGAYHQLKTLSEK
SRP54_METBF      ---PQIIMMVGLQGS--GKTTSTAKLARYFQRK-GLKAGVVAADTFRPGAYHQLKTLCEK
SRP54_METBU      ---PQTIMMIGLQGS--GKTTTTSKLSRYFQRK-GLKPAVICADTFRPGAYQQLKTLCDK
SRP54_METAR      ---SQTIMMVGLQGS--GKTTTSAKIARYFARK-GLKPAVICADTYRPGAYDQLKQLCDK
SRP54_METTP      ---KQTIMLVGLQGS--GKTTTAAKLATYFQRR-GLRTAVICADTFRAGAYDQLKALCDR
SRP54_METLZ      ---PQKILMAGLQGS--GKTTTTGKLCRYFQRK-GLKVGAIGADNFRPGAYAQLETLCKK
SRP54_ARCFU      ---KAKIMLVGLQGS--GKTTTTAKMAKYFKDR-GMKVAVVAADTWRPAAYEQLRQLAEE
SRP54_THEAC      ---PQTIMLVGLYGN--GKTTTAGKLARFFAKK-GLNSGLIAADVHRYAAYDQLKQIASE
SRP54_THEVO      ---PQTIMLVGLYGH--GKTTSAGKLSRFFMKK-GLSAGLIAADVHRYAAYEQLQQIAES
SRP54_METKA      ---VNVIMLVGLYGM--GKTTTAAKLARYLQRK-GYRVGLVGADPYRPAAGEQLRQLAEE
SRP54_METTH      -DKPYRILFLGLQGS--GKTTTIGKLARYLRKK-GFTVGVVCTDTWRPAALEQLKQYTEG
SRP54_METST      -RKPYKIMMLGLQGS--GKTTTTAKLVKHLKKK-GHTSAIVCTDTWRPAAYEQLRQLTEP
SRP54_METS3      -VKPYKILFLGLQGS--GKTTTIGKLCRYLQKK-GFNPAVVCTDTWRPAAYEQLRQLTEE
SRP54_METMP      PSKKSVILLIGIQGS--GKTTSAAKLARYIQKK-GLRPGLIAADVYRPAAYQQLKQLSEK
SRP54_METM5      PSKKSVILLIGIQGS--GKTTSAAKLARYIQKK-GLRPGLIAADVYRPAAYQQLKQLSEK
SRP54_METM7      PSKKSVILLIGIQGS--GKTTSAAKLARYIQKK-GLRPGLIAADVYRPAAYQQLKQLSEK
SRP54_METM6      ASKKSVILLIGIQGS--GKTTSAAKLARYIQKK-GLRPGLIAADVYRPAAYQQLKQLSEK
SRP54_METVS      PSKKSVILLVGIQGS--GKTTSSAKLARYIQKK-GMKPALIAADIYRPAAYQQLKQLSEK
SRP54_META3      PKNKNIILLVGIQGS--GKTTSAAKLARTLQKR-GFKPALIAADVYRPAAYQQLKQLSEK
SRP54_METJA      PKKQNVILLVGIQGS--GKTTTAAKLARYIQKR-GLKPALIAADTYRPAAYEQLKQLAEK
SRP54_PYRAB      -EKPTILLMVGVQGS--GKTTTVAKLARHFQKR-GYKVGVVCSDTWRPGAYHQLKQLLDP
SRP54_PYRHO      -EKPTVLLTVGVQGS--GKTTTVAKLARYFQKR-GYKVGVVCSDTWRPGAYHQLKQLLDP
SRP54_PYRFU      -EKPTILLMVGIQGS--GKTTTVAKLARYFQKR-GYKVGVVCSDTWRPGAYHQLRQLLDR
SRP54_THEKO      -HKPTVILTVGIQGS--GKTTSVAKLARYLQKR-GYKVGVVCSDTWRPGAYYQLRQLLDP
SRP54_THEON      -EKPTVLLTVGIQGS--GKTTSIAKLARYFQKR-GYKVGLVCSDTWRPGAYQQLKQLVEP
SRP54_THEGJ      -EKPTILLTVGIQGS--GKTTTIAKLARHLQKR-GYKVGLVCTDTWRPGAYYQLKQLVEP
SRP54_AERPE      -KTPWIVLLVGVQGS--GKTTTAGKLAYYYVRR-GYKVGLVSSDTHRPGAYEQLKRLAEE
SRP54_HYPBU      -YTPYVIMMVGVQGS--GKTTTVGKLAKFYRGM-GYRVGVVAADTYRPGAYEQLKQLADR
SRP54_STAMF      -KKPWVMLLVGLQGS--GKTTTAAKLAYYYKLE-GYRVGLVAADTYRPAAYDQLKQLGEQ
SRP54_SULIL      -RLPFIIMLVGVQGS--GKTTTAGKLAYFYKRR-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQ
SRP54_SULIY      -KLPFIIMLVGVQGS--GKTTTAGKLAYFYKRR-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQ
SRP54_SULIN      -KLPFIIMLVGVQGS--GKTTTAGKLAYFYKRR-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQ
SRP54_SULIM      -KLPFIIMLVGVQGS--GKTTTSGKLAYFYKRR-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQ
SRP54_SULIA      -KLPFIIMLVGVQGS--GKTTTSGKLAYFYKRR-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQ
SRP54_SULIK      -KLPFIIMLVGVQGS--GKTTTSGKLAYFYKRR-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQ
SRP54_SACS2      -KLPFIIMLVGVQGS--GKTTTAGKLAYFYKKR-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQ
SRP54_METS5      -SIPWVIMLVGVQGT--GKTTTAGKLAYFYKKR-GYKVALVGADVYRPAALEQLQQIGKQ
SRP54_SULAC      -KLPYIIMLVGVQGS--GKTTTSGKLALFYKKK-GYKVGLVAADIYRPAAYEQLIQIGQQ
SRP54_SULTO      -KIPYVIMLVGVQGS--GKTTTAGKLALFYKKK-GYKVGLVAADVYRPAAYDQLVQIGKQ
SRP54_PYRAE      -KKPYIVLLLGVEGS--GKTTTAAKLAKYLAKR-GYKVGLVETDTIRPAAFDQLRQLAEK
SRP54_PYRAR      -KKPYIVLLLGVEGS--GKTTTSAKLARYLMKR-GYKVGMVETDTIRPAAFDQLRQLAEK
SRP54_PYRIL      -KKPYLVLLLGVEGS--GKTTTAAKLARYLVKR-GYRVGLVETDTIRPAAFDQLKQLAEK
SRP54_PYRNV      -KKPYVVLLLGVEGS--GKTTTAAKLAKLLVKR-GYKVGLVETDTVRPAAFDQLRQLAEK
SRP54_PYRCJ      -KKPYVVLLLGVEGS--GKTTTAAKLAKYLAKR-GYKVGLVETDTIRPAAFDQLKQLAEK
SRP54_BOVIN      KGKQNVIMFVGLQGS--GKTTTCSKLAYYYQRK-GWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_CANLF      KGKQNVIMFVGLQGS--GKTTTCSKLAYYYQRK-GWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_PONAB      KGKQNVIMFVGLQGS--GKTTTCSKLAYYYQRK-GWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_HUMAN      KGKQNVIMFVGLQGS--GKTTTCSKLAYYYQRK-GWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_MACFA      KGKQNVIMFVGLQGS--GKTTTCSKLAYYYQRK-GWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_MOUSE      KGKQNVIMFVGLQGS--GKTTTCSKLAYYYQRK-GWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_RAT        KGKQNVIMFVGLQGS--GKTTTCSKLAYFYQRK-GWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_GEOCY      KGHSNVIMFVGLQGS--GKTTTCTKLAYHYQKK-GWKTCLVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR542_ARATH      KAKPSVVMFVGLQGEVLEKPQLVPSMLIIIRRK-GYKPALVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR543_ARATH      KAKASVVMFVGLQGA--GKTTTCTKYAYYHQKK-GYKPALVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR541_ARATH      KAKPSVVMFVGLQGA--GKTTTCTKYAYYHQKK-GYKAALVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR541_SOLLC      KGKPSVVMFVGLQGS--GKTTTCTKYAYHHQKR-GWKPALVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR542_SOLLC      KGKPSIVMFVGLQGS--GKTTTCTKYAYYHQKK-GWKPALVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR541_HORVU      KGKPSVVMFVGLQGS--GKTTTCTKYAYYHQRK-GFKPSLVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR542_HORVU      KGKPSVVMFVGLQGS--GKTTTCTKYAYYHQRK-GFKPSLVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SR543_HORVU      KGKPNVVMFVGLQGS--GKTTTCTKYAHYHQRK-GFKPSLVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_DICDI      KGKSNIVMFVGLQGA--GKTTSVTKLAYFYKKK-GFSTAIVCADTFRAGAFDQVRHNAAK
SRP54_ENTH1      KGKTCVLMMVGLQGA--GKTTTITKLALYYKNR-GYKPAVVGADTFRAGAYEQLQMNAKR
SRP54_ASPNG      KGRSNVIMFVGLQGA--GKTTTCTKLARHYQMR-GFKTALVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_SCHPO      KGRPSVIMMVGLQGS--GKTTTCSKLALHYQRR-GLKSCLVAADTFRAGAFDQLKQNAIK
SRP54_YARLI      KGKSNVVMFVGLQGS--GKTTSCTKLAVYYQRR-GFKVGLVCADTFRAGAFDQLKQNATK
SRP54_YEAST      KRKTNIIMFVGLQGS--GKTTSCTKLAVYYSKR-GFKVGLVCADTFRAGAFDQLKQNAIR
SRP54_CANAX      KESSHVIMFVGLQGA--GKTTSCTKLAVYYKKR-GFKVGLVCADTFRAGAFDQLKQNAIK
SRP54_ECO57      AQPPAVVLMAGLQGA--GKTTSVGKLGKFLREKHKKKVLVVSADVYRPAAIKQLETLAEQ
SRP54_ECOL6      AQPPAVVLMAGLQGA--GKTTSVGKLGKFLREKHKKKVLVVSADVYRPAAIKQLETLAEQ
SRP54_ECOLI      AQPPAVVLMAGLQGA--GKTTSVGKLGKFLREKHKKKVLVVSADVYRPAAIKQLETLAEQ
SRP54_HAEIN      TQPPAVILMAGLQGA--GKTTSVGKLAKFLRERHKKKVLVVSADVYRPAAIKQLETLAQS
SRP54_BUCAI      IEPPAVILVVGLQGS--GKTTSLAKLGKWIKNKYKKKILITSTDTYRAAAIEQLKILSDQ
SRP54_BUCAP      IQPPAIILVVGLQGV--GKTTTLVKLAKWIKEKYKKKILTVSTDIYRAAAIKQLQILSDQ
SRP54_BUCBP      VTPPAIILMIGLQGS--GKTTTTAKLGQLIRTKYKKKVIVTSIDIYRLAAIKQLKMLSKQ
SRP54_RICCN      SKPPVNFLMVGLQGS--GKTTASSKLALRLRNQ-NKKVLLVSLDTYRPAAQEQLAILANS
SRP54_RICFE      SKPPVNFLMVGLQGS--GKTTASSKLALRLKNQ-NKKVLLVSLDTYRPAAQEQLAILANS
SRP54_RICBR      AKPPVNLLMVGLQGS--GKTTASGKLALCLKNQ-NKKVLLVSLDTYRPAAQEQLEILANS
SRP54_RICPR      AKPPVNLLIVGLQGG--GKTTASGKLALRLKNQ-NKKVLLVSLDTYRPAAQEQLAIIANS
SRP54_RICTY      SKPPVNLLMVGLQGG--GKTTASGKLALLLKNQ-NKKVLLVSLDTYRPAAQEQLAIIANS
SRP54_BACSU      KRPPTVIMMVGLQGA--GKTTTSGKLANLLRKKHNRKPMLVAADIYRPAAIKQLETLGKQ
SRP54_STRMU      SKIPTIIMMVGLQGA--GKTTFAGKLANKLVKEENARPLMIAADIYRPAAIDQLKTLGQQ
SRP54_SYNE7      AKAPTVILMAGLQGA--GKTTATAKLALHLRKE-GRSTLLVATDVYRPAAIDQLITLGKQ
SRP54_SYNY3      EQAPTVILMAGLQGT--GKTTATAKLALYLRKQ-KRSALMVATDVYRPAAIDQLKTLGQQ
SRP54_MYCTU      KTPPTVVMLAGLQGS--GKTTLAGKLAARLRGQ-GHTPLLVACDLQRPAAVNQLQVVGER
SRP54_MYCBO      KTPPTVVMLAGLQGS--GKTTLAGKLAARLRGQ-GHTPLLVACDLQRPAAVNQLQVVGER
SRP54_MYCLE      KTPPTVVMLAGLQGS--GKTTLAGKLAVRLRRQ-GHTPLLVACDLQRPAAVNQLQVVGER
SRP54_THEAQ      DR--NLWFLVGLQGS--GKTTTAAKLALYYKGK-GRRPLLVAADTQRPAAREQLRLLGEK
SRP54_AQUAE      DLKKGTVLFVGLQGT--GKTTTIGKIANLLKKG-GHKVAVSSTDLRRPAAMLQLQRLAER
SRP54_HELPY      QTPPTVVLMAGLQGS--GKTTTTAKLAHYLKTK-NKKVLLCACDLQRLAAVEQLKVLGEQ
SRP54_HELPJ      QTPPTVVLMAGLQGS--GKTTTTAKLAHYLKTK-NKKVLLCACDLQRLAAVEQLKVLGEQ
SRP54_MYCGE      -KRPLKIMMVGLQGS--GKTTTCGKLAYWLEKKYKQKTMLVGLDIYRPAAIEQLETLSQQ
SRP54_MYCPN      -KRPLKVMVVGLQGS--GKTTTCGKLAVWLKKQFQQKAMLVALDIYRPAAIDQLATLAEQ
SRP54_MYCMY      NKKPSVVMMVGLQGS--GKTTTANKLAYLLNKKNKKKVLLVGLDIYRPGAIEQLVQLGQK
                        .  *: *    *.    .                  *  * .*  *       

SRP54_HALSA      AEVDFYGEP-DSDDPVQI------ARDGLAATAD--ADVHIVDTAGRHAL--EDDLIAEI
SRP54_HALS3      AEVDFYGEP-DSDDPVQI------ARDGLAATAD--ADVHIVDTAGRHAL--EDDLIAEI
SRP54_HALVD      AEVDFYGDP-DCDDPVQI------AREGLEATED--ADVHIVDTAGRHAL--EDDLIDEI
SRP54_HALWD      AEVSFYGDP-DCDDPVKI------AREGIEATAD--ADIHIVDTAGRHAL--EADLIDEI
SRP54_HALLT      AEVDFYGDP-DNDDPVAI------AREGLEATAD--ADVHIVDTAGRHAL--EDDLIAEI
SRP54_NATPD      AEVDFYGNP-DSDDPVEI------AERGLEETAD--ADVHIVDTAGRHAL--EEALIDEL
SRP54_HALMA      AEVDFYGDP-DEDDPVKI------ARDGLEATEN--ADVRIVDTAGRDGL--NEELIEQI
SRP54_METAC      LNVGFYGEE-GNPDAVEI------TKNGLKALEK--YDIRIVDTAGRHAL--EADLIEEM
SRP54_METMA      LNVGFYGEE-GNPDAVEI------TIHGLKALEK--YDIKIVDTAGRHAL--EADLIEEM
SRP54_METBF      LNVAFYGEE-NNPDAVEI------TRNGLKALEK--YDVKIVDTAGRHAL--EADLIEEM
SRP54_METBU      LNVPFYGEV-GNPDAVGI------VERGLAELGK--NDVLIVDTAGRHSL--EADLIDEM
SRP54_METAR      LGVGFYGEA-GNKDAVAI------VRNGLKEMAK--YDVKIVDTAGRHAL--ETDLIQEM
SRP54_METTP      QGIFFYGEK-GNENAPEV------AKNGLEATKK--YDVRIVDTAGRHAL--ESDLIQEM
SRP54_METLZ      INVPSYGDP-KEKDAVKI------VKDGLAALKD--VDVIIVDTAGRHAL--EDDLIDEI
SRP54_ARCFU      YGITFYGEK-GEKDAVKI------VKNALEKLKD--HDMIIIDTAGRHAL--EDELIDEM
SRP54_THEAC      VNAKFYGDQ-SEKDPVRL------IKHGLEQLKD--VAVKIIDTSGRDSM--DAELFDEI
SRP54_THEVO      VNAKFYGDP-KEKDPVKI------IKNGLEVLKD--AQVKIIDTSGRDSL--DSDLIEEI
SRP54_METKA      VDVPVHVE--DVDDAVEM------AVKGVEALKDE-CDVVIVDTAGRDRL--SEDLIDEL
SRP54_METTH      QDVSIYGDP-QNRDALDL------AEKGLARFQKK--DVIIFDTAGRHKE--EKDLLREM
SRP54_METST      LDVPVFGDP-ENKDAIDL------AKKGLEKCGSKY-DVILVDTAGRHKE--EKDLLDEM
SRP54_METS3      MQVPLYGDP-DNKDALDL------AQKGLKEFKNR--KVIIFDTAGRHKQ--EEDLIAEM
SRP54_METMP      INVPLFGDETRTKTPVEI------TKEGMEKLKKV--DVIIIDTAGRHKE--EEGLLAEM
SRP54_METM5      INVPLFGDETRTKTPVDI------TKEGMEKLKKV--DVIIIDTAGRHKE--EESLLAEM
SRP54_METM7      INVPLFGDETRTKTPVEI------TKEGMEKLKKV--DVIIIDTAGRHKE--EEGLLAEM
SRP54_METM6      INVPLFGDETRTKTPVDI------TKEGMEKLKKV--DVIIIDTAGRHKE--EEGLLAEM
SRP54_METVS      INVPLFGDETKTKTPVEI------VKEGIEKLKKS--DVLIIDTAGRHKE--EESLLEEM
SRP54_META3      IHIPLHGDPTKTKTPMEI------TEEGLKQFKKN--DVIIIDTAGRHKE--ESGLLEEM
SRP54_METJA      IHVPIYGDETRTKSPVDI------VKEGMEKFKKA--DVLIIDTAGRHKE--EKGLLEEM
SRP54_PYRAB      YHIEVFGDP-NEKDAIKL------AKEGVEHFKAKGVDLIIVDTAGRHKE--EKDLIEEM
SRP54_PYRHO      YHIEVFGDP-NEKDAVKL------AKEGVEYFKTRDVDLIIVDTAGRHKE--EKDLIEEM
SRP54_PYRFU      YHIEVFGNP-QEKDAIKL------AKEGVDYFKSKGVDIIIVDTAGRHKE--DKALIEEM
SRP54_THEKO      FGIEVFGDP-EEKDAVKL------AREGVEHFREKGVDVIIVDSAGRHKE--EKGLIEEM
SRP54_THEON      FGIEVFGDP-EEKDAIKL------AKEGVEHFREKGVDIIIVDSAGRHKE--EKSLIEEM
SRP54_THEGJ      YNIEVFGDP-GEKDAIKL------AREGVEYFKDKGVDVIIVDTAGRHKE--ESGLIEEM
SRP54_AERPE      AGAMFYGER-EG-DPAEI------ARRGLEDLLSRGAEIVIVDTAGRHGHGEEARLLDEM
SRP54_HYPBU      AGAMFYGEP-GSKDPVGI------ARRGVEELKQRGADIVIVDTAGRHGYGEEEALLDEM
SRP54_STAMF      IGVPVYGEP-DNKDAVEI------ARRGVEYFVSRGFDIVIVDTAGRHHR--EEDLLREM
SRP54_SULIL      IGVPVYGEP-NNQNAIEI------AKKGVDTFVKNKMDIIIVDTAGRHGYGEETKLLEEM
SRP54_SULIY      IGVPVYGEP-NNQNAIEI------AKKGVDTFVKNKMDIIIVDTAGRHGYGEETKLLEEM
SRP54_SULIN      IGVPVYGEP-NNQNAIEI------AKKGVDTFVKNKMDIIIVDTAGRHGYGEETKLLEEM
SRP54_SULIM      IGVPVYGEP-NNQNAIEI------AKKGVDTFVKNKMDIIIVDTAGRHGYGEETKLLEEM
SRP54_SULIA      IGVPVYGEP-NNQNAIEI------AKKGVDTFVKNKMDIIIVDTAGRHGYGEETKLLEEM
SRP54_SULIK      IGVPVYGEP-NNQNAIEI------AKKGVDTFVKNKMDIIIVDTAGRHGYGEETKLLEEM
SRP54_SACS2      IGVQVYGEP-NNQNPIEI------AKKGVDIFVKNKMDIIIVDTAGRHGYGEETKLLEEM
SRP54_METS5      INVPVYGEP-GSQDAVGI------AKRGVEKFLSERYELVIVDTAGRHGYGEEVKLLEEM
SRP54_SULAC      INIPVYGEP-GNKNPIEI------ATNGLEKFLKEKMNIVIIDTAGRHGYGEEASLLEEM
SRP54_SULTO      INVPVYGEP-NNTDAVGI------AKRGVEKFLSEKYDIIIVDTAGRHGYGEEVKLLEEM
SRP54_PYRAE      IGVPFYGER-DGKDAVEI------AKRGVQNF--KNMDVIIVDTAGRHRN--EEALLKEV
SRP54_PYRAR      IGAPFYGER-DGKDAVEI------ARRGVANL--KGVDVLIIDTAGRHRN--EEALLQEV
SRP54_PYRIL      IGVPFYGER-DSKDAVEI------ARRGVQNF--KNMDVVIIDTAGRHKN--EEALLQEV
SRP54_PYRNV      IGVPFYGER-DGKDAVEI------ARRGVQNL--KNLDVVIVDTAGRHRN--EEALLQEV
SRP54_PYRCJ      IGVPFYGER-DGKNAVEI------AVRGVQNF--KNMDVVIIDTAGRHRN--EEELLKEV
SRP54_BOVIN      ARIPFYGS-YTEMDPVII------ASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQ--EDSLFEEM
SRP54_CANLF      ARIPFYGS-YTEMDPVII------ASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQ--EDSLFEEM
SRP54_PONAB      ARIPFYGS-YTEMDPVII------ASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQ--EDSLFEEM
SRP54_HUMAN      ARIPFYGS-YTEMDPVII------ASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQ--EDSLFEEM
SRP54_MACFA      ARIPFYGS-YTEMDPVII------ASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQ--EDSLFEEM
SRP54_MOUSE      ARIPFYGS-YTEMDPVII------ASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQ--EDSLFEEM
SRP54_RAT        ARIPFYGS-YTEMDPVII------ASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQ--EDSLFEEM
SRP54_GEOCY      ARVPFYGS-YTEMDPVVI------AQEGVEKFKEDSFEVIIVDTSGRHKQ--EESLFEEM
SR542_ARATH      SKIPYYGS-YTGSDPVKI------AVEGVDRFKKENCDLIIVDTSGRHKQ--QASLFEEM
SR543_ARATH      AKIPFYGS-YTESDPVKI------AVEGVDTFKKENCDLIIVDTSGRHKQ--EASLFEEM
SR541_ARATH      AKIPFYGS-YTESDPVKI------AVEGVDRFKKEKCDLIIVDTSGRHKQ--AASLFEEM
SR541_SOLLC      AKIPFYGSSYTESDPVKI------AVDGVETFKKENCDLIIVDTSGRHKQ--EAALFEEM
SR542_SOLLC      AKIPFYGS-YTESDPVKI------AVDGVETFKKENCDLIIVDTSGRHKQ--EAALFEEM
SR541_HORVU      AKIPFYGS-YMESDPVKI------AVEGLERFRKENSDLIIIDTSGRHKQ--EAALFEEM
SR542_HORVU      AKIPFYGS-YMESDPVKI------AVEGLERFRKENSDLIIIDTSGRHKQ--EAALFEEM
SR543_HORVU      AKIPFYGS-YMESDPVKI------AVEGLEKFRQEKSDLIIIDTSGRHMQ--EAALFEEM
SRP54_DICDI      AKIHYYGS-ETEKDPVVV------ARTGVDIFKKDGTEIIIVDTSGRHKQ--DSELFEEM
SRP54_ENTH1      AGVPFFGI-KEESDPVKV------ASEGVRTFRKEKNDIILVDTSGRHKQ--DKELFKEM
SRP54_ASPNG      AKIPYYGS-LTQTDPAIV------AAEGVAKFKKERFEIIIVDTSGRHKQ--EEELFTEM
SRP54_SCHPO      ARVPYFGS-YTETDPVVI------AKEGVDKFKNDRFDVIIVDTSGRHQQ--EQELFAEM
SRP54_YARLI      AKIPFFGS-YTETDPVAV------AAEGVAKFKKEKFEIIIVDTSGRHRQ--ESELFTEM
SRP54_YEAST      ARIPFYGS-YTETDPAKV------AEEGINKFKKEKFDIIIVDTSGRHHQ--EEELFQEM
SRP54_CANAX      ANIPYYGS-YLEPDPVKI------AFEGVQKFKQEKFDIIIVDTSGRHRQ--EEQLFTEM
SRP54_ECO57      VGVDFFPSDVGQKPVD-------IVNAALKEAKLKFYDVLLVDTAGRLHV--DEAMMDEI
SRP54_ECOL6      VGVDFFPSDVGQKPVD-------IVNAALKEAKLKFYDVLLVDTAGRLHV--DEAMMDEI
SRP54_ECOLI      VGVDFFPSDVGQKPVD-------IVNAALKEAKLKFYDVLLVDTAGRLHV--DEAMMDEI
SRP54_HAEIN      VGVDFFPSDVKQNPVD-------IAKSALADAKLKFYDVLIVDTAGRLHV--DTEMMDEI
SRP54_BUCAI      IEIDFFESDKHHTPIE-------ITKNAIKYAKLKLYDVLLIDTAGRLHI--DKKMMNEI
SRP54_BUCAP      VKIDFYLSDTTQTPIN-------ITKEAIEHAKLKLYDLLLIDTAGRLHI--NTEMMNEI
SRP54_BUCBP      AKISFFPSNNTQSPKD-------IVQHAIQHAKLKFYDVLLIDTAGRLQI--DKKMMNEL
SRP54_RICCN      VQINSLPIVQGEKPLD-------IVKRAIAEAKISAYDVVIYDTAGRTQI--DKAMMEEA
SRP54_RICFE      VQINSLPIVQGEKPLD-------IVKRAIAEAKISAYGVVIYDTAGRTQI--DKEMMEEA
SRP54_RICBR      VKINSLPIVKGEKPLD-------IVKRAMAEAKLSAYDIVIYDTAGRTQI--DQEMMNEA
SRP54_RICPR      VNIDSLPIVKGEKPLD-------IVKRAIGEAQISAYDVVIYDTAGRIQI--DNVMMEEA
SRP54_RICTY      VNIDSLPIVQGEQPLD-------IVKRAISEAKIFAYDVVIYDTAGRIQI--DNVMMEEA
SRP54_BACSU      LDMPVFSLGDQVSPVE-------IAKQAIEKAKEEHYDYVILDTAGRLHI--DHELMDEL
SRP54_STRMU      INVPVFDMGTEHSAVE-------IVSQGLAQAKENRNDYVLIDTAGRLQI--DEKLMTEL
SRP54_SYNE7      IDVPVFELGSDANPVE-------IARQGVEKARQEGIDTVIVDTAGRLQI--DTEMMEEL
SRP54_SYNY3      IDVPVFDLGSDANPVE-------IARQGVEKAKELGVDTVLIDTAGRLQI--DPQMMAEL
SRP54_MYCTU      AGVPVFAPHPGASPESGPGDPVAVAAAGLAEARAKHFDVVIVDTAGRLGI--DEELMAQA
SRP54_MYCBO      AGVPVFAPHPGASPESGPGDPVAVAAAGLAEARAKHFDVVIVDTAGRLGI--DEELMAQA
SRP54_MYCLE      AGVPVFAPHPGASPDSGPGDPVAVASAGLVEARAKHFDVVIVDTAGRLGI--DDELMAQA
SRP54_THEAQ      VGVPVLEVMDGESPES-------IRRRVEEKARLEARDLILVDTAGRLQI--DEPLMGEL
SRP54_AQUAE      VGVPYYEFEEGLGAVE-------IARRAVKRAKEESVDYLLLDTAGRLHV--DEELMKEL
SRP54_HELPY      VGVEVFYE-ENKSVKE-------IASNALKRAKEAQFDVLLVDSAGRLAI--DKELMQEL
SRP54_HELPJ      VGVEVFHE-ENKSVKE-------IANNALKRAKEAQFDVLIVDSAGRLAI--DKELMQEL
SRP54_MYCGE      TNSVFFAQGTQPVAKT--------TKAALSAFKTAKCQTIICDTAGRLQT--NETLMDEL
SRP54_MYCPN      TESVFFAKGTQAPDQT--------TKEAVKTFKESGCQAIICDTAGRLQT--NQELMDEL
SRP54_MYCMY      TNTQVFEKGKQDPVKT--------AEQALEYAKENNFDVVILDTAGRLQV--DQVLMKEL
                                                         : *::**        :: : 

SRP54_HALSA      EEIEGVVEPDRSLLVLDAAIGQGAKQQARQFDAS-IGIDGVAITKLDGTAKGGGSLTAVN
SRP54_HALS3      EEIEGVVEPDRSLLVLDAAIGQGAKQQARQFDAS-IGIDGVAITKLDGTAKGGGSLTAVN
SRP54_HALVD      EEIEGVVQPDLNLLVLDAAIGQGAKEQAQQFDES-IGIGGVVITKLDGTAKGGGALTAVN
SRP54_HALWD      EAIDSTVAPDRSLLVLDAAIGQGAKQQAREFNNA-IGIDGVVVTKLDGTAKGGGALTAVN
SRP54_HALLT      EEIERAVDPDRSLLVLDAAIGQGAKEQARQFEKS-IGIEGVMITKLDGTAKGGGALTAVN
SRP54_NATPD      EAIESAVDPDRNLLVLDAAIGQGAKDQAERFHDA-VGIDGVAITKLDGTAKGGGALAAVD
SRP54_HALMA      ERIEQEVQPDRDLLVLDAAMGQSAKSQAADFEAA-IGIDGVVITKLDGTAKGGGALAAVN
SRP54_METAC      ERIHAVAKPDHKFMVLDAGIGQQASQQAHAFNDS-VGITGVIITKLDGTAKGGGALSAVS
SRP54_METMA      ERIHAVAKPDHKFMVLDAGIGQQASQQAHAFNDS-VGITGVIITKLDGTAKGGGALSAVS
SRP54_METBF      EQINAVAKPDHKFMVLDAGIGQQASQQAHAFNDS-VGITGVIITKLDGTAKGGGALSAVS
SRP54_METBU      EQIHEIAQPDYKLLVLDGAIGQQASEQARAFNDS-VGISGVVISKLDGTAKGGGALSAVS
SRP54_METAR      KDIYGLTKFDHKLLVLDAAIGQQASEQARAFNDA-IGITGVVITKLDGTAKGGGALSAVS
SRP54_METTP      KDIHAVVNADHKLLVMDAAIGQQASEQARAFNEA-VGITGVIITKLDGTAKGGGALSAVA
SRP54_METLZ      TQVNAYLNPDHRWLVIDAALGQAARDQAKRFHEA-IGIDGVIVTKMDGTAKGGGAMSAVA
SRP54_ARCFU      IKIAEVARPDYKLLVLDAAIGQLASKQAQAFHEA-IGINGIIITKFDGTAKGGGALSAAR
SRP54_THEAC      RRIKEAVAPDEVLMIIDATMGQQAGPEAKAFNDA-IGVTGIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_THEVO      RRIKEAVKPDQVLMVIDATMGQQAGPESKAINDA-VGVTGIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_METKA      REMAERIEPHEVLLVLDATVGQKAGDHAEAFHEA-VQLTGVVITKLDTAAKGGGALSAVA
SRP54_METTH      EELSAIVEPHEAILVIDGTIGQQAREQALAFRKA-TDIGSIIVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_METST      AELSQIVQPDEVILVIDGTIGQQARSQAETFKKT-TDIGSIIVSKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_METS3      DTLDDIIQPTESILVIDGTIGQQAGEQAKAFSQA-TDVGSIIITKLDGSAKGGGAMSAVA
SRP54_METMP      KEMKDLTNPNEIILVIDGTLGQQAKNQAKAFKESVSEIGSILVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_METM5      KEMKDLTNPNEIILVIDGTLGQQAKNQAKAFKESVSEIGSILVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_METM7      REMKDLTNPTEIILVIDGTLGQQAKNQAKAFKESVSEIGSILVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_METM6      KEMKDLTNPNEIILVIDGTLGQQAKNQAKAFKDSVSEIGSILVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_METVS      KQMKEITNPNEIILVIDGTLGQQAKNQAKAFKDAVSEIGSILVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_META3      KEMKEKFNPEEIILVIDGTLGQQAKNQAKAFKDAVENIGSILITKMDGSAKGGGALSAVA
SRP54_METJA      KQIKEITNPDEIILVIDGTIGQQAGIQAKAFKEAVGEIGSIIVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_PYRAB      RMISNEIKPHEVILVIDGTIGQQAYNQALAFKEA-TPIGSIIVTKLDSSAKGGGALSAVA
SRP54_PYRHO      RMISEEIRPHEVILVIDGTIGQQAYNQALAFKEA-TPIGSIIVTKLDSSAKGGGALSAVA
SRP54_PYRFU      KQISNVIHPHEVILVIDGTIGQQAYNQALAFKEA-TPIGSIIVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_THEKO      RQISEAIKPHEVILVIDGTIGQQAYNQAMAFKEA-TPIGSIIVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_THEON      KQISAAIKPHEVILVIDGTIGQQAYNQALAFKEA-TPIGSIIVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_THEGJ      KQISEAIKPHEVILVIDGTIGQQAYHQALAFKEA-TPIGSIIVTKLDGSAKGGGALSAVA
SRP54_AERPE      KAIASKVRPDEVALVIDASIGQKAMGLAERFHKS-TPIGSIIVTKMDGTARGGGALTAAA
SRP54_HYPBU      KRIAEAIKPDEVVLVIDAAMGQKSYDLAKRFHEA-TPVGSIIVTKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_STAMF      REIAENIKPDEVVLVIDAAIGQQAHDLAKKFHEA-TPIGSIIVTKLDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SULIL      KEIYEALKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SULIY      KEIYEALKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SULIN      KEIYEALKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SULIM      KEIYEALKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SULIA      KEIYEALKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SULIK      KEIYEALKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SACS2      KEMYDVLKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSVIITKMDGTAKGGGALSAVV
SRP54_METS5      KDIYEKIKPNEVILVIDASLGQKAYDLAKRFHEA-SNVGSIIITKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_SULAC      KSMYDKIHPDEVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSLIVSKMDGTAKGGGALSAVI
SRP54_SULTO      KNMYSEIKPDEVILVIDASIGQKAYDLASRFHQA-SPIGSIIVTKMDGTAKGGGALSAVA
SRP54_PYRAE      RAIYDAVSPDEVVLVIDATVGKMAAAQAEAFMKY-LPIHSVIITKMDSTARGGGALAAVA
SRP54_PYRAR      KAIYDAVNPDEVVLVVDATVGKLAAAQAEAFMKY-LPIHTVIITKMDSTARGGGALAAVA
SRP54_PYRIL      KMIYEAVNPDEVILVIDATVGKLAAAQAEAFMKY-LPIHSVIITKMDSTARGGGALAAVI
SRP54_PYRNV      KAIYEAVSPDEVVLVIDATVGKLAAAQAEAFMRY-LPIHSVIITKMDSTARGGGALAAVA
SRP54_PYRCJ      KAIYDAVKPDEVFLVIDATVGKLAAAQAEAFMKY-LPIHSVIITKMDSTARGGGALAAVA
SRP54_BOVIN      LQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_CANLF      LQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_PONAB      LQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_HUMAN      LQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_MACFA      LQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_MOUSE      LQVSNAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_RAT        LQVSNAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_GEOCY      LQVSQAIDPDNIIFVMDGTIGQACESQARAFKEK-VDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SR542_ARATH      RQISEATKPDLVIFVMDSSIGQTAFEQARAFKQT-VAVGAVIITKMDGHAKGGGTLSAVA
SR543_ARATH      RQVAEATKPDLVIFVMDSSIGQAAFDQAQAFKQS-VAVGAVIITKMDGHAKGGGALSAVA
SR541_ARATH      RQVAEATEPDLVIFVMDSSIGQAAFEQAEAFKET-VSVGAVIITKMDGHAKGGGALSAVA
SR541_SOLLC      RQVSEAQKPDLVIFVMDSSIGQAAFDQAQAFRQS-VAVGAVIVTKMDGHAKGGGALSRVA
SR542_SOLLC      RQVAEATKPDLVIFVMDSSIGQAAFDQAQAFKQS-VAVGAVIVTKMDGHAKGGGALSAVA
SR541_HORVU      RQVAEATKPDLVIFVMDGSIGQAAFDQAQAFKQS-ASVGAVIITKLDGHAKGGGALSAVA
SR542_HORVU      RQVAEATKPDLVIFVMDGSIGQAAFDQAQAFKQS-ASVGAVIITKLDGHAKGGGALSAVA
SR543_HORVU      RQVAEATKPDLVIFVMDGSIGQAAFDQAQAFKQS-ASVGAVIVTKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_DICDI      KQIETAVKPDNCIFVMDSSIGQAAYEQATAFRSS-VKVGSIIITKMDGNSMGGGAISAVA
SRP54_ENTH1      QSVRDAIKPDSIIFVMDGAIGQAAFGQAKAFKDA-VEVGSVIITKLDGHSNGGGALSAVA
SRP54_ASPNG      TQIQTAVTPDQTILVLDSTIGQAAEAQSSAFKAT-ADFGAIIITKTDGHAAGGGAISAVA
SRP54_SCHPO      VEISDAIRPDQTIMILDASIGQAAESQSKAFKET-ADFGAVIITKLDGHAKGGGALSAVA
SRP54_YARLI      VDIGAAVKPDSTIMVLDASIGQAAEPQSRAFKDA-SDFGSIILTKMDGHAKGGGAISAVA
SRP54_YEAST      IEISNVIKPNQTIMVLDASIGQAAEQQSKAFKES-SDFGAIILTKMDGHARGGGAISAVA
SRP54_CANAX      VQIGEAVQPTQTIMVMDGSIGQAAESQARAFKES-SNFGSIILTKMDGHAKGGGAISAVA
SRP54_ECO57      KQVHASINPVETLFVVDAMTGQDAANTAKAFNEA-LPLTGVVLTKVDGDARGGAALSIRH
SRP54_ECOL6      KQVHASINPVETLFVVDAMTGQDAANTAKAFNEA-LPLTGVVLTKVDGDARGGAALSIRH
SRP54_ECOLI      KQVHASINPVETLFVVDAMTGQDAANTAKAFNEA-LPLTGVVLTKVDGDARGGAALSIRH
SRP54_HAEIN      KQVHAALNPIETLFTVDAMTGQDAANTAKAFNEA-LPLTGVILTKVDGDARGGAALSIRQ
SRP54_BUCAI      QQIQVISKAIETLLIVDSMMGQDAINMAKIFNND-LLISGIILTKTDGDSRSGIALSMRY
SRP54_BUCAP      NTIQNISKPIETLLIVDSMMGQDAINIAKKFSAS-LSISGIVITKTDSDARSGVALSIRH
SRP54_BUCBP      LDVYNISHPIETFFVADAMFGQDSINVINEFNKY-LPVSSFIITKTDSDTRAGIILSIKY
SRP54_RICCN      LAIKKIVEPTETLLVIDSMTGQDAVVTASSFNEK-LAISGLILSRIDGDSKGGAALSVKY
SRP54_RICFE      LAIKKIVEPTETLLVIDSMTGQDAVVTANSFNEK-LEISGLILSRIDGDSKGGAALSVKY
SRP54_RICBR      IAIKKIVEPTETLLVIDSMTGQDAVVTASSFNEQ-LEISGLILSRIDGDSKGGAALSVKY
SRP54_RICPR      LAIKKILNPTETLLVIDSMTGQDAVITAKTFSEK-LEISGLILSRIDGDTKGGAALSVKY
SRP54_RICTY      LAIKKILNPTETLLVIDSMTGQDAVVTARSFSDK-LEISGLILSRIDGDTKGGAALSVKY
SRP54_BACSU      TNVKEIANPEEIFLVVDSMTGQDAVNVAKSFNEQ-LGLTGVVLTKLDGDTRGGAALSIRA
SRP54_STRMU      RDIKALANPNEILLVVDSMIGQEAANVAREFNQQ-LEVTGVILTKIDGDTRGGAALSVRQ
SRP54_SYNE7      AQVKEAIAPHEVLLVVDSMIGQEAASLTRSFHER-IGITGAILTKLDGDSRGGAALSIRR
SRP54_SYNY3      AEIKQVVKPDDTLLVVDAMTGQEAANLTHTFHEQ-IGITGAILTKLDGDTRGGAALSVRQ
SRP54_MYCTU      AAIRDAINPDEVLFVLDAMIGQDAVTTAAAFGEG-VGFTGVALTKLDGDARGGAALSVRE
SRP54_MYCBO      AAIRDAINPDEVLFVLDAMIGQDAVTTAAAFGEG-VGFTGVALTKLDGDARGGAALSVRE
SRP54_MYCLE      GAIREAINPDEVLFVLDAMIGQDAVTTAAAFGAG-VGFTGVVLTKLDGDARGGAALSVRE
SRP54_THEAQ      ARLKEVLGPDEVLLVLDAMTGQEALSVARAFDEK-VGVTGLVLTKLDGDARGGAALSARH
SRP54_AQUAE      QEIKEVTNPSEILYVADAMQGQTALETAKTFHER-LGLTGVVITKMDGDARGGLALSVKE
SRP54_HELPY      KEVKEILNPHEVLYVADALSGQDGVKSANTFNEE-IGVSGVVLSKFDSDSKGGIALGITY
SRP54_HELPJ      KEVKEVLNPHEVLYVADALSGQDGVKSANTFNEE-IGVSGVVLSKFDSDSKGGIALGITY
SRP54_MYCGE      VSVKNELNPDEIIMVVDGLSGQEIINVAQTFHKR-LKLTGFIISKLDSDARAGAALSLAS
SRP54_MYCPN      VAIKNELHPDEILMVVDGLSGQEIINVAKEFHNR-LKLTGFIITKLDSDARAGAALSLTS
SRP54_MYCMY      DNLKKKTSPNEILLVVDGMSGQEIINVTNEFNDK-LKLSGVVVTKLDGDARGGATLSISY
                   :             *.  *:        :      .    ::: *  : .*  :    

SRP54_HALSA      ETDSTIAFLGSGETVQDIERFEPDSFISRLLGMGDLKQLTERVERAMEETQDDD-EDWDP
SRP54_HALS3      ETDSTIAFLGSGETVQDIERFEPDSFISRLLGMGDLKQLTERVERAMEETQDDD-EDWDP
SRP54_HALVD      ETDSSIAFLGMGETVQDIERFEPNGFISRLLGMGDLKQLSERVERAMSETQAED-EDWDP
SRP54_HALWD      ETDSSIAFLGTGETVQDVERFEPNGFISRLLGMGDLKQLSERVERAMAETQEAD-DDWDP
SRP54_HALLT      ETDSSIAFLGTGETVQDIERFEPSGFISRLLGMGDLKQLSERVERAMAEAQEED-EDWDP
SRP54_NATPD      QTDSSIAFLGTGEEVKDIERFEPSGFISRLLGMGDLKQLSERVERAMEETQAE--EDWDP
SRP54_HALMA      ETDSTIAFLGSGETVKDIERFEPSGFISRLLGMGDLKQLTERVERAMEETQEGDEEDWDP
SRP54_METAC      ETKAPIAFIGVGETPEDFEKFEADRFISRLLGMGDLKSLMEKAEESLSE------EDVNV
SRP54_METMA      ETKAPIAFIGVGETPEDFEKFEADRFISRLLGMGDLKSLMEKAEESLSE------EDVNV
SRP54_METBF      ETKAPIAFIGVGETPEDFEKFEADRFISRLLGMGDLKSLMEKAEETLSE------EDVNV
SRP54_METBU      ETNSAIAFIGVGETPDDLEKFEPDRFISRLLGMGDIKSLIEKAEETLSE------EDIDM
SRP54_METAR      DTNTSIAFIGVGETPDDMERFDPDGFISRLLGMGDLRALVERANEVLQK------DDVNV
SRP54_METTP      ETKTSVAFIGVGETASDLEKFEADRFISRLLGMGDIKGLIEKAQEVQIE------SDVDV
SRP54_METLZ      ETQSGIVFIGNGETIDDLERFDPNGFISRLLGMGDLKALVEKAEESMNA------EDVDV
SRP54_ARCFU      QIGIPIAFIGTGEKVEDFERFDPAGFVSRLLGMGDIKALMEKIERIASE------EELDP
SRP54_THEAC      EIHVPIYFIGTGEHMDDLEVFDPKKFLSRLLGLGDLESLFETVQEADITEEE---AQESF
SRP54_THEVO      KMRVPIYFIGTGEHMDDMEIFDPKKFLSRLLGLGDLETLFETVKEANITEEE---AQKSF
SRP54_METKA      RTGAPIKFVGTGERVDDLEEFNPRSFVARLLGIGDIDELLRRTEEMLEE-------EEKA
SRP54_METTH      EIGAPIKFIGTGERIDDLEVFDPERFISRLLGMGDLRSLLEKVEEVS-EEEI---AEESL
SRP54_METST      EIRAPIKFIGTGERVDDFEAFDPERFISRLLGMGDLDTLIEKAAEVT-SEKS---DKEMI
SRP54_METS3      ETGAPIKFIGTGERIDDFELFDPARFISRLLGMGDIQTLIEKAEDSI-DEDM---AEKTM
SRP54_METMP      EINAPIKFIGTGEGVDNLEQFDPKKFISRILGLGDLDSLLEKTEDIM-DES----TEESI
SRP54_METM5      EINAPIKFIGTGEGVDNLEQFDPKKFISRILGLGDLDSLLEKTEDIM-DES----TEESI
SRP54_METM7      EINAPIKFIGTGEGVDNLEQFDPKKFISRILGMGDLDSLLEKTEDIM-DES----TEESI
SRP54_METM6      EINAPIKFIGTGEGVDNLEQFDPKKFISRILGFGDLDSLLEKTEDIM-DES----AEESI
SRP54_METVS      EINAPIKFIGTGEGVDNLETFDPKKFISRLLGMGDLDSLLEKTEDVM-DES----TEESI
SRP54_META3      EIGAPIKFIGTGEKVDDLEPFDPKKFISRLLGMGDLDSLLEKTEDII-DDD----TEESL
SRP54_METJA      ETKAPIKFIGIGEGIDDLEPFDPKKFISRLLGMGDLESLLEKAEDMV-DEK----TEESI
SRP54_PYRAB      ATGAPIKFIGTGEKIDDLEPFDPARFVSRLLGLGDIQGLLEKFKELEKEVEF---TEEDL
SRP54_PYRHO      ATGAPIKFIGVGEKIDDLEPFDPARFVSRLLGLGDIQGLLEKFKELEKEVEF---TEEDI
SRP54_PYRFU      ATGAPIKFIGTGEKIDDIEPFDPPRFVSRLLGLGDIQGLLEKFKELEKEVEI---KEEDI
SRP54_THEKO      ATGAPIKFIGTGERIDDLEPFDPKRFVSRLLGLGDIQGLLEKIEELQKEQEF---REEDM
SRP54_THEON      ATGAPIKFIGVGERIDDLEPFDPKRFVSRLLGLGDIQGLLEKFEELQKQQEF---REEDL
SRP54_THEGJ      ATGAPIKFIGVGEKIDDLEPFDPKRFVSRLLGLGDIQGLLEKIEELQKEQEF---KEEDV
SRP54_AERPE      VTGARIKFIGTGETLGELEPFAPRRFVARILGMGDLESLLERIKSLEEAGE----LDRAA
SRP54_HYPBU      ATGARIKFIGTGEDIDEIEVFRPKRFVARLLGMGDLESLLEKIERLRGVEE----FEKTV
SRP54_STAMF      VTGATIKFIGTGEKIDELEVFRPPRFVARILGIGDLEGLIEKVRRIK-VEF----TEKDV
SRP54_SULIL      ATGATIKFIGTGEKIDELEIFNAKRYVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYEK----IQKKM
SRP54_SULIY      ATGATIKFIGTGEKIDELEIFNAKRYVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYEK----IQKKM
SRP54_SULIN      ATGATIKFIGTGEKIDELEIFNAKRYVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYEK----IQKKM
SRP54_SULIM      ATGATIKFIGTGEKIDELEIFNAKRYVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYEK----IQKKM
SRP54_SULIA      ATGATIKFIGTGEKIDELEIFNAKRYVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYEK----IQKKM
SRP54_SULIK      ATGATIKFIGTGEKIDELEIFNAKRYVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYEK----IQKKM
SRP54_SACS2      ATGATIKFIGTGEKIDELETFNAKRFVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYDK----IQKKM
SRP54_METS5      ATGAPIKFIGVGEKIDELEVFNPRRFVARILGMGDLEAIIEKMKAMEDYEG----IQKKM
SRP54_SULAC      ATGAQIKFIGTGEKLDELEVFNPRRFVSRLLGLGDIESIIEKIKSVEDYEN----LEKRM
SRP54_SULTO      ATGAAIKFIGTGEKLDELEVFNPRRFVSRILGMGDIESIIEKIKGMEEYEQ----IQKKM
SRP54_PYRAE      KTGAKVKFIGVGEDVDEFEQFSPRKFVARVLGMGDLDTLLEKIKAVFEEEE----VLEEI
SRP54_PYRAR      KTGARVKFIGVGEDVEELEPFNPRKFVARLLGMGDLDALLEKIKAVFEEEE----VLEEI
SRP54_PYRIL      KTGARVKFIGVGEDVDEFDLFNPRKFVARVLGMGDLDALVEKIKAVFEEEK----VLQEI
SRP54_PYRNV      KTGAKVKFIGVGEDVDELEMFIPRKFVARVLGMGDLDALVERIKAVFEEEQ----VIQEI
SRP54_PYRCJ      KTGARVKFIGVGEDVDEFELFNPRKFVARVLGMGDLDALVEKIKAVFEEDK----VLEEL
SRP54_BOVIN      ATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNE-----ALI
SRP54_CANLF      ATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNE-----ALI
SRP54_PONAB      ATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNE-----ALI
SRP54_HUMAN      ATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNE-----ALI
SRP54_MACFA      ATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNE-----ALI
SRP54_MOUSE      ATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNE-----ALI
SRP54_RAT        ATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNE-----ALI
SRP54_GEOCY      ATRSPIIFIGTGEHIDEMEPFKTKPFVSKLLGMGDLEGLMEKVSDLKLDENE-----ELM
SR542_ARATH      ATKSPVIFIGTGEHMDEFEVFDAKPFVSRLLGNGDMSGFVNKLQEVVPKDQQP----ELL
SR543_ARATH      ATKSPVIFIGTGEHMDEFEVFDVKPFVSRLLGMGDWSGFVDKLQEVVPKDQQP----ELL
SR541_ARATH      ATKSPVIFIGTGEHMDEFEVFDVKPFVSRLLGKGDWSGLVDKLQEVVPKDLQN----ELV
SR541_SOLLC      ATKSPVIFIGTGEHMDEFEVFDVKPFVSRLLGMGDLSGLVNKIQDVVPMDQQP----ELL
SR542_SOLLC      ATKSPVIFIGTGEHMDEFEVFDVKPFVSRLLGMGDWSGFMDKIHEVVPMDQQP----ELL
SR541_HORVU      ATKSPVIFIGTGEHIDEFEIFDVKPFVSRLLGMGDLSGLMDKIQDVMPADQQP----ELL
SR542_HORVU      ATKSPVIFIGTGEHIDEFEIFDVKPFVSRLLGMGDLSGLMDKIQDVMPADQQP----ELL
SR543_HORVU      ATKSPVIFIGTGEHIDDFDVFNVEPFVARLLGRGDLPGLIDKMESIVPADQQS----ELV
SRP54_DICDI      ATNTPIIFIGTGEHLTDLELFDPSTFVSKLLGYGDMKGMLEKIKEVIPEDST------SL
SRP54_ENTH1      ATKSPIIFIGTGEKVNEIEEFDAESFVRKLLGMGDLKGIAKLAKDFAENAEYK----TMV
SRP54_ASPNG      ATHTPIIYLGTGEHLMDLERFEPKAFIQKLLGMGDMAGLVEHVQAVTKDSASA---KETY
SRP54_SCHPO      ATKTPIVFIGTGEHINDLERFSPRSFISKLLGLGDLEGLMEHVQSLDFDK------KNMV
SRP54_YARLI      ATNTPIIFIGTGEHIHDLEAFSPKQFISKLLGIGDLQGLMETMQSLNLDQ------KKTM
SRP54_YEAST      ATNTPIIFIGTGEHIHDLEKFSPKSFISKLLGIGDIESLFEQLQTVSNKEDA----KATM
SRP54_CANAX      ATKTPIVFIGTGEHVGDLEIFKPTTFISKLLGIGDIQGLIEHVQSLNLHQDEGH--KQTI
SRP54_ECO57      ITGKPIKFLGVGEKTEALEPFHPDRIASRILGMGDVLSLIEDIESKVDRAQ-----AEKL
SRP54_ECOL6      ITGKPIKFLGVGEKTEALEPFHPDRIASRILGMGDVLSLIEDIESKVDRAQ-----AEKL
SRP54_ECOLI      ITGKPIKFLGVGEKTEALEPFHPDRIASRILGMGDVLSLIEDIESKVDRAQ-----AEKL
SRP54_HAEIN      ITGKPIKFLGVGEKTEALEPFHPDRVASRILGMGDVLSLIEDLERSVDREK-----AEKM
SRP54_BUCAI      ITGKPIKFIGTGEKIISLEPFHPERIADRILGMNDIMSLIEDIEEKVDQSQ-----IQKL
SRP54_BUCAP      ITGKPIKFIGTGEKLHQLEPFHPERIADRILGMNQVISLIKDIEEKVNQSQ-----VKNL
SRP54_BUCBP      LTKKPIKFIGTGEKLEELELFYPDRIASRILGMGDMLSLIENIENKIDKKH-----IKKF
SRP54_RICCN      ITKKPIKFLSSGENLIDLEEFDAERLASRILDMGDIISFVEKAASIVDREE-----AEKT
SRP54_RICFE      ITKKPIKFLSSGEKLTDLEEFDAERLASRILDMGDIISFVEKAASIVDREE-----AEKT
SRP54_RICBR      ITQRPIKFLSSGEKLTDLEEFDAKRIASRILDMGDIISFVEKAASIVDREQ-----AEKT
SRP54_RICPR      FTQKPIKFLSSGEKLTDLEEFNAERLASRILDMGDIISFVKKAASIVDREE-----AEKT
SRP54_RICTY      LTQKPIKFLSCGEKLTDLEEFDAERLASRILDMGDIISFVKKAASIVDREE-----AERT
SRP54_BACSU      VTNTPIKFAGLGEKLDALEPFHPERMASRILGMGDVLTLIEKAQASVDEDK-----AKEL
SRP54_STRMU      ITGKPIKFTGTGEKITDIETFHPDRMSSRILGMGDLLTLIEKASQDYDEQK-----SAEL
SRP54_SYNE7      VSGQPIKFVGLGEKVEALQPFHPERMASRILGMGDVLTLVEKAQEEIDLAD-----VEKM
SRP54_SYNY3      ISGQPIKFVGVGEKVEALQPFYPDRLASRILNMGDVLTLVEKAQEAIDVGD-----VEKL
SRP54_MYCTU      VTGVPILFASTGEKLEDFDVFHPDRMASRILGMGDVLSLIEQAEQVFDAQQ-----AEEA
SRP54_MYCBO      VTGVPILFASTGEKLEDFDVFHPDRMASRILGMGDVLSLIEQAEQVFDAQQ-----AEEA
SRP54_MYCLE      VTGVPILFATTGEKLDDFDVFHPDRMASRILGMGDVLSLIEQAEQVFDAEQ-----AEAA
SRP54_THEAQ      VTGKPIYFAGVSEKPEGLEPFYPERLAGRILGMGDVASLAEKVRAA----------GLEA
SRP54_AQUAE      VLGVPIKFIGVGEKIEDIEPFYPDRIAQRILGLGDIQSLVEKAQEVITEDK-----AQVM
SRP54_HELPY      QLGLPLRFIGSGEKIPDLDVFVPERIVGRLMGAGDIVSLAEKTASVLNPNE-----AKDL
SRP54_HELPJ      QLGLPLRFIGSGEKIPDLDVFMPERIVGRLMGAGDIISLAEKTASVLNPNE-----AKDL
SRP54_MYCGE      LLQVPIKLIGVSEKLDGLEQFHPERIANRILGLGDVMSLVEKAEQVFDKKD-----LTKT
SRP54_MYCPN      LLEVPIKLMGTSEKLTGLEQFHPERIASRILGLGDVMTLVEKAEEVFDKQS-----LTKT
SRP54_MYCMY      LTKLPIKFIGEGEGYNALAAFYPKRMADRLMGMGDIETLFERAVENIDERS-----IQKT
                      :     .*    .  *       :::. .:   :                     

SRP54_HALSA      EDLMKG--EFTLHDMRKQMQAMDNMGPLDQVMDMIPGMGGGLMD-ELPDDAMDVTQERMR
SRP54_HALS3      EDLMKG--EFTLHDMRKQMQAMDNMGPLDQVMDMIPGMGGGLMD-ELPDDAMDVTQERMR
SRP54_HALVD      EEMMKG--NFTLKDMQKQMEAMDKMGPLDQVLDMIPGFGGGIKD-QLPDDAMDVTKDRMR
SRP54_HALWD      EDIMEG--SFTLKDMRKQMEAMDRMGPLDQVMDMIPGLGGGLKD-QLPDDAMDVTQNRMR
SRP54_HALLT      EDMLQG--EFTLKDMKRQMDAMNRMGPLDQVMDMIPGMGGGMMD-QLPDDAMDVTQDRMR
SRP54_NATPD      EDLMKG--EFTLKDMRNQMNAMNKMGPLDQVMDMIPGLGGGIKD-QLPDDAMDMTQERLR
SRP54_HALMA      EDMLEG--QFTLKDMRKQMQTMNNMGPLDQVMDMIPGLGGGLMD-QLPDDAMDVTQERMQ
SRP54_METAC      EALMQG--RFTLKDMYKQLEAMNKMGPLKQIMSMLPMGMGGM---KFSDEMFQATSDKMK
SRP54_METMA      EALMQG--RFTLKDMYKQLEAMNKMGPLKQIMSMLPMGMGGLGGVKLSDEMFQATSDKMK
SRP54_METBF      EALMQG--RFTLKDMYKQLEAMNKMGPLKQIMSMLPLGMGGMGGVKLSDEMFQATSDKMK
SRP54_METBU      EAMMRG--RFTLKDMYSQLEAMNKMGPMKQIMQMLPLGGMGA---KLSDDAYKVTEDKMK
SRP54_METAR      EKMMQG--KFTLNDMYDQLEAINKMGPLKQIMSMLPLGGLGG---NITDDMYKMTQDKLK
SRP54_METTP      DAMMKG--KFTLKDMYKQLEAMNKMGPLKQIMQMLPFGGIGI---ELSDKEYQVTKERLE
SRP54_METLZ      NAMLRG--KFTLNDMYKQLEAVQKMGPLKQVLSMLPMGNMNV-----PSDALEGTADKMK
SRP54_ARCFU      EAFLKG--TFTLKDIYKQIEAMNKMGPVRKIFEMLPFGLGLK----VDNDVMEMTQEKMK
SRP54_THEAC      EKLMTG--KFNLKDMYDVWEKFSKPGLMKKLVDALPLARIPGSQ-KIDDSKIQSAEDKLR
SRP54_THEVO      EKLMTG--KFNLKDMYDVWEKFSRPGLMKKLVDSLPLAKLPGSQ-KINDDQILTAEQKLQ
SRP54_METKA      EDVLEG--EFTLKDLYEQLEALSKMGPVDKLLQYVPGMGGGR----NVRKISQITEERLK
SRP54_METTH      DAILSG--KFTLRDMRVQFEMMGKMGPLQQVMSMLPGAG------KLPKDASRMTEETIR
SRP54_METST      DSIISG--KFTLKDMENQLEMMNKMGPIQQIMKLIPGLGN-----QLPANASKVTEEKLG
SRP54_METS3      KNMMSG--KFTLVDMKNQFEMMNSMGPMQQVLSMIPGLGN-----KVSKEASKMTEDKID
SRP54_METMP      DSILKG--KFTLIELYAQLETISKMGPMKQILSMIPGMGG-----NMPKEAAQLTEAKLK
SRP54_METM5      DSILKG--KFTLIELYAQLETISKMGPMKQILSMIPGMGG-----NLPKEAAQLTEDKLK
SRP54_METM7      DSILKG--KFTLIELYAQLETISKMGPMKQILSMIPGMGG-----NLPKEAAQLTEDKLK
SRP54_METM6      DSILKG--KFTLIELYAQLETISKMGPMKQILSMIPGMGG-----NMPKEAAQLTEDKLK
SRP54_METVS      DSILKG--KFTLVELYAQLETISKMGPMKQIMGMIPGFGG-----NMPKEAAQLTEQKLK
SRP54_META3      DAMMRG--KFTLNELYSQLEAISKMGSMKQLMAMIPGMGT-----NLPKGAADITEHKLK
SRP54_METJA      DAIMRG--KFTLNELMTQLEAIENMGSMKKILSMIPGFGG-----AMPKELSHLTEAKIK
SRP54_PYRAB      ERFLKG--KFTLKDMYAQLEAMRKMGPLKQILRMIPGLGY-----SLPDEVISVGEERLR
SRP54_PYRHO      DRFLRG--KFTLKDMYAQLEAMRKMGPLKQILRMIPGLGY-----SLPDELISVGEERLR
SRP54_PYRFU      ERFLRG--KFTLKDMYAQLEAMRKMGPLKQILRMIPGLGY-----SLPDDVISIGEERLK
SRP54_THEKO      EKFLRG--KFNLKDMYAQLEAMQKMGPLKQILQMIPGLGY-----SLPEDAVRVGEEKLK
SRP54_THEON      EKFLKG--KFNLKDMYAQLEAMQKMGPLKQILQMIPGMGY-----SLPDDAVRVGEERLK
SRP54_THEGJ      EKFLRG--KFNLKDMYAQLEAMQKMGPLKQILQMIPGLGY-----SLPDEAVRVGEEKLR
SRP54_AERPE      EDVLKG--RITMRTIYRQLRAMRKLGPLGKVLQMLPGASMLA--SID-EGALKLGEEKMK
SRP54_HYPBU      AEMMSG--KITFRTIYKQLQQVTKLGPFRKILQMIPGISTML--ESL-DEAARLSEEKVK
SRP54_STAMF      EEFLSG--RLNMRLVYKQLVSLRKMGPLRKILQMIPGLSLKI--PLE-IEAGKA-EEKIK
SRP54_SULIL      EDVMEGKGKLTLRDVYAQIMALRKMGPLSKVLQHIPGLGVML--PTPSEDQLKLGEEKIR
SRP54_SULIY      EDVMEGKGKLTLRDVYAQIMALRKMGPLSKVLQHIPGLGVML--PTPSEDQLKLGEEKIR
SRP54_SULIN      EDVMEGKGKLTLRDVYAQIMALRKMGPLSKVLQHIPGLGVML--PTPSEDQLKLGEEKIR
SRP54_SULIM      EDVMEGKGKLTLRDVYAQIMALRKMGPLSKVLQHIPGLGVML--PTPSEDQLKLGEEKIR
SRP54_SULIA      EDVMEGKGKLTLRDVYAQIMALRKMGPLSKVLQHIPGLGVML--PTPSEDQLKLGEEKIR
SRP54_SULIK      EDVMEGKGKLTLRDVYAQIMALRKMGPLSKVLQHIPGLGVML--PTPSEDQLKLGEEKIR
SRP54_SACS2      EDVMEGKGKLTLRDVYAQIIALRKMGPLSKVLQHIPGLGIML--PTPSEDQLKIGEEKIR
SRP54_METS5      GEVMTGKSKLTLRDMYKQIVAVRKMGPLSKILQLIPGMNMMG--DIP-EDQVKVGEQKMQ
SRP54_SULAC      EDVISGKTKLTLRDIYKQLIALRKMGPLGKIFQMLPGAGILS--QVP-EEQLKLGEEKIR
SRP54_SULTO      EEVMSGKAKLTLRDIYKQLTALRKMGPLNKILQMLPGFGVFS--QIP-EEQLKLGEEKIK
SRP54_PYRAE      E---SG--RLDLLTFKKQIDSLLKLGPLSKVFQLLPGNLAAK--ISE--EQIELSQRNLK
SRP54_PYRAR      E---SG--RLDLLTFKKQIDSLMKLGPLSKVFQLLPGGLAAK--ISE--EQIELSQKNLK
SRP54_PYRIL      E---SG--RLDLLTFKKQIEGLLKLGPLSKVLQLLPGGFAAK--ISE--EQVELSQKNLK
SRP54_PYRNV      E---SG--KLDLLTFKKQIDGLLKLGPLSKVFQMLPGGLAAK--ISE--EQIELSQKNLK
SRP54_PYRCJ      E---SG--RLDLLTFKKQIDSLLKLGPLSKVFQLLPSNFAIK--VSE--EQIELSQKNLR
SRP54_BOVIN      EKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDF----MSKGNEQESMARLK
SRP54_CANLF      EKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDF----MSKGNEQESMARLK
SRP54_PONAB      EKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDF----MSKGNEQESMARLK
SRP54_HUMAN      EKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDF----MSKGNEQESMARLK
SRP54_MACFA      EKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDF----MSKGNEQESMARLK
SRP54_MOUSE      EKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDF----MSKGNEQESMARLK
SRP54_RAT        EKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDF----MSKGNEQESMARLK
SRP54_GEOCY      DKLKHG--QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFNQIIGMIPGFSPDF----MSKGNERESMAKLK
SR542_ARATH      EMLSHG--KFTLRIMYDQFQNMLNMGPLKEVFSMLPGMRAEM----MPEGHEKESQAKIK
SR543_ARATH      EKLSQG--NFTLRIMYDQFQNILNMGPLKEVFSMLPGISAEM----MPKGHEKESQAKIK
SR541_ARATH      ENLSQG--NFTLRSMYDQFQCSLRI-PLNQLFSMLPGISAEM----MPKGHGEESRVKMK
SR541_SOLLC      QKLSEG--HFTLRIMYEQFQSMLKMGPLG-VFSMLPGFSAEM----MPQGREKESQAKFK
SR542_SOLLC      QKLSEG--HFTLRIMYEQFQNILKMGPIGQVFSMLPGFSAEL----MPKGRENESQAKIK
SR541_HORVU      AKLAEG--TFTLRLLYEQFQNLLKMGPIGQVFSMLPGFSSEL----MPKGHEKEGQAKIK
SR542_HORVU      AKLAEG--TFTLRLLYEQFQNLLKMGPIGQVFSMLPGFSSEL----MPKGHEKEGQAKIK
SR543_HORVU      AKLSEG--AFTLRLLYEQFQNLLKMGPMSQIFSMLPGFSSEL----MPKGQEKQSKEKFK
SRP54_DICDI      KEIAQG--KFTLRSMQQQFQQIMQLGPIDKLVQMIPGMNQLP----QLQGN--EGGLKLK
SRP54_ENTH1      KHLQEG--TLTVRDWKEQLSNLQKMGQLGNIMQMI-GLNHPM----FQGGN---IEKKFK
SRP54_ASPNG      KHISEG--IYTLRDFRENITSIMKMGPLSKLSGMIPGLSNLT----AGLDDE-DGSMKLR
SRP54_SCHPO      KNLEQG--KFTVRDFRDQLGNIMKLGPLSKMASMIPGMSNMM----NGMNDE-EGSLRMK
SRP54_YARLI      EHIQEG--IFTLADLRDQMGNMLKMGSLSSIAGMIPGLSGMA----SSISDE-EGTRRIK
SRP54_YEAST      ENIQKG--KFTLLDFKKQMQTIMKMGPLSNIAQMIPGMSNMM----NQVGEE-ETSQKMK
SRP54_CANAX      EHIKEG--KFTLRDFQNQMNNFLKMGPLTNIASMIPGLSNIM----SQVGDE-ETSKKIK
SRP54_ECO57      ASKLKKGDGFDLNDFLEQLRQMKNMGGMASLMGKLPGMGQIP---DN-VKSQMDDK-VLV
SRP54_ECOL6      ASKLKKGDGFDLNDFLEQLRQMKNMGGMASLMGKLPGMGQIP---DN-VKSQMDDK-VLV
SRP54_ECOLI      ASKLKKGDGFDLNDFLEQLRQMKNMGGMASLMGKLPGMGQIP---DN-VKSQMDDK-VLV
SRP54_HAEIN      AQKFKKGDDFTLDDFREQLIEMKKMGGMMSMLEKLPGAKNLS---EH-VKNQVDDK-MFV
SRP54_BUCAI      TKKLKKGHDFNLNDFLTQIKQMKKIGGLNYFANKFSINHQLS---NNISLLNTDKN-TLK
SRP54_BUCAP      TKKFRKGDDFNLNDFLIQLKEMKNMGNLNYFIEKFSKNKILS---NN-PLLGENKN-TLN
SRP54_BUCBP      SNTIKKYNTFNFNDMLLHINQIKKIGGVNSILGKLPKTQTIF---NS-FQNNIDEN-ILL
SRP54_RICCN      AAKLKKGK-FDLNDYLQQMRSIKKMGGFGSILSMLPGSGKIM---DQIDQSKLNSK-IIE
SRP54_RICFE      AAKLKKGK-FDLNDYLQQMRSIKKMGGFGSILSMLPGSGKIM---DQIDQSKLNSK-IIE
SRP54_RICBR      AAKLKKGK-FDLNDYLQQMKSIKKIGGFGSILSMLPGSGKIM---DQIDQSKLNSK-IIE
SRP54_RICPR      AIKLKSGK-FDLNDYLQQMRSIKKMGGFGSILSMLPGSGKIF---DQIDQSKLNSK-IIE
SRP54_RICTY      AIKLKSGK-FDLNDYLKHMRSIKKMGGFGSILSMLPGSGKII---DQIDQSKLDSR-IIE
SRP54_BACSU      EQKMRTMS-FTLDDFLEQLGQVRNMGPLDELLQMMPGAGKMK---GL-KNIQVDEK-QLN
SRP54_STRMU      AEKMRENS-FDFNDFIEQLDQVQNMGSMEDILKMIPGMANNP---AL-ANVKVDEG-EIA
SRP54_SYNE7      QEKILAAK-FDFTDFLKQMRLLKNMGSLAGFIKLIPGLGGKI---ND-EQLRQGER-QLK
SRP54_SYNY3      QNKILEAT-FDFDDFIKQMRFMKNMGSLGGLLKMIPGMN-KL---SS-GDIEKGEK-ELK
SRP54_MYCTU      AAKIGAGE-LTLEDFLEQMLAVRKMGPIGNLLGMLPGAAQMK---DA--LAEVDDK-QLD
SRP54_MYCBO      AAKIGAGE-LTLEDFLEQMLAVRKMGPIGNLLGMLPGAAQMK---DA--LAEVDDK-QLD
SRP54_MYCLE      AAKIVAGE-LTLEDFLEQMLAVRKMGLIGNLLGMLPGAGQVK---EV--LEQVDDK-QLD
SRP54_THEAQ      EAPKSAKE-LSLEDFLKQMQNLKRLGPFSEILGLLPGVPQG---------LKVDEK-AIK
SRP54_AQUAE      ATKVMTGE-FDLEDLREMLRMIQQMGPLDKLLSMIPGVAPQL---KH---LKVDEK-QFK
SRP54_HELPY      SKKLKKGQ-FTFNDFLNQIEKVKKLGSMSSLISMIPGLGNMA---SALKDTDLESSLEVK
SRP54_HELPJ      SKKLKKGQ-FTFNDFLNQIEKVKKLGSMSSLISMIPGLGNMA---SALKDTDLESSLEVK
SRP54_MYCGE      ISKMFLGK-MDLEDLLIYMQQMHKMGSVSSLIKMLPANFSVS---EE---NAELIENKIE
SRP54_MYCPN      VSKMFLGK-MDLEDLLLYMEQMNQMGSVSSIVKMLPGNLTVS---DD---HVESIEAKVK
SRP54_MYCMY      MNRMFLGQ-FDLEDLRNQLAQIAKMGSLNKLMKMLPIN-KVS---ES---QIQEAQRKLA
                            .               .  .   .                       . 

SRP54_HALSA      GFEVIMDSMTEAEMADPR----SVGAS-QIRRIARGSGQPEDRVRELLDQHKMMAQTMQQ
SRP54_HALS3      GFEVIMDSMTEAEMADPR----SVGAS-QIRRIARGSGQPEDRVRELLDQHKMMAQTMQQ
SRP54_HALVD      SFEVIMDSMTEEELENPR----KVGAS-RVRRIAQGSGQDEETIQELLEQHRMMEQTIKQ
SRP54_HALWD      DFDVIMDSMTEAELEDPR----SVGAS-RVRRIARGSGTDEETVRELLQQHKMMERTIKQ
SRP54_HALLT      RFERIMDSMTDEELEQPR----VVGQS-RTERIARGSGTDEETVRQLLEQHSMMEQTISQ
SRP54_NATPD      DFEVIMDSMSEAELENPR----AIGQS-QIERIARGSGTDEDTVRELLEQHKMMSRMMKQ
SRP54_HALMA      DFDVIMDSMTEEELENPR----VVGQS-RTKRICRGSGKPEERVRELLQQHKQMEQMLKQ
SRP54_METAC      NYKVIMDSMTEEEMTDPR----VIGGS-RIKRISKGSGCSSEDVRELLKYHKTMQTALKG
SRP54_METMA      NYKVIMDSMTEDEMADPK----LIGGS-RIKRISRGSGCSPEDVRELLKYHKTMQTALKG
SRP54_METBF      NYKTIMDSMTEEEMTDPK----LIGGS-RIKRISRGSGCSPEEVRELLKYHKTMQTALKG
SRP54_METBU      GYRVLMDSMTEEELLNPR----LLGSS-RIKRISLGSGSSPDAVRELLKYYKMMQNAMKG
SRP54_METAR      GYKVIMDSMTAAERDDPK----LIGSS-RIARVAHGSGKSPEEVRELLKYHKMMQKAMKG
SRP54_METTP      AYRFIMDSMTDEELEDPK----IINAS-RIKRIARGSGTRPELVKELLKSHAAMQKAIKG
SRP54_METLZ      KFRIIMDSMTPQELDEPA----LINTS-RMIRVAKGSGSSVEEVRDLIKYYKMMQKTLKG
SRP54_ARCFU      KFRVIMDSMTEEELLNPK----IIDSS-RIRRIAIGSGTSPQEVKELLNYYKTMKNLMKK
SRP54_THEAC      MYRIIMDSMTFEELENPE----IINAK-RITRIARGAGVREEDVRMLLKEFKAMKNNMKM
SRP54_THEVO      RYRIIMDSMTFQELENPE----IINAK-RITRIARGAGVREEDVRMLLKEFKAMKNNMKL
SRP54_METKA      KYKVIMDSMTEKELENPE----ILNKS-RIRRIAIGSGTSERDVIELLNHYRMMKDVIED
SRP54_METTH      KYLIIMDSMTEEELEKPD----IIKHS-RIRRIARGSGTRNEDVKELLKYYRVTKKAMKG
SRP54_METST      MYKILMNSMTTYELENPE----VIKKS-RINRISRGAGLTNDDVKDLLKYYNVTKKALKG
SRP54_METS3      GYKVIMSSMTKKEMENPK----LIKQS-RIRRIAMGAGVEESEVRDLLKYYNNTKKTMKG
SRP54_METMP      RYKIMMDSMTMEEKENPE----LIKTS-RLQRIAKGAGVKQEEIKDLLKYYSTTKNAFGN
SRP54_METM5      RYKIMMDSMTLEEKENPE----LIKTS-RLQRIAKGAGVKQDEIKDLLKYYSTTKNAFGN
SRP54_METM7      RYKIMMDSMTMEEKENPE----LIKAS-RLQRIAKGAGVKQEEIKDLLKYYSTTKNAFGN
SRP54_METM6      RYKIMMDSMTMEEKENPE----LIKTS-RLQRIARGAGVKPEEIKDLLKYYSTTKNAFGN
SRP54_METVS      RYKIMMDSMTMEEKENPE----LIKTS-RLQRIAKGAGVKQDEIKDLLKYYATTKNAFGN
SRP54_META3      KYKIIMDSMTSTEKENPD----IIKTS-RMKRIAKGAGVKQEEIKELLKYYSTTKNAFQN
SRP54_METJA      KYKVIISSMTKEERENPK----IIKAS-RIRRIARGSGTTENDVREVLRYYETTKNAIDK
SRP54_PYRAB      KFKVIMDSMTEEELMNPD----IINYS-RIKRIARGSGTSVKDVKELLNQYNQMKKFFKS
SRP54_PYRHO      KFKVIMDSMTEEELMNPE----IINYS-RIKRIARGSGTSIKDVKELLTQYNQMKKFFKS
SRP54_PYRFU      KFKVIMDSMTEEELLNPE----IINYS-RIKRIARGSGTSTKDVKELLDQYRQMKKLFKS
SRP54_THEKO      RYKVIMDSMTEEELENPE----IINYS-RIKRIARGSGATTAEVRELLNQYNQMKKMFKS
SRP54_THEON      KFKVIMDSMTEEELEHPE----IINYS-RIKRIARGSGTSIQEVRELLHQYNQMKKMFKS
SRP54_THEGJ      RYRIIMDSMTEEELENPD----IINYS-RIKRIARGSGTSTREVRELLAQYNQMRKMFKN
SRP54_AERPE      RWMAIIESMTYEELDRPE----IIDKR-RMRRIAIGSGTSVDDVRELLVYYKNLKTMMKK
SRP54_HYPBU      KWLTIMNSMTYEELDNPN----LLEERSRVKRIAVGAGVEPSEVRELYNYYKSVKKMMRQ
SRP54_STAMF      KWLAIINSMTYEELDKPE----IIDRR-RIRRIAYGAGVKPEDVRELLKQYEMMKKLSKQ
SRP54_SULIL      RWLAALNSMTYKELENPS----IIDKS-RMRRIAEGSGLEVEDVRELLEWYNNMNKLLKM
SRP54_SULIY      RWLAALNSMTYKELENPS----IIDKS-RMRRIAEGSGLEVEDVRELLEWYNNMNKLLKM
SRP54_SULIN      RWLAALNSMTYKELENPS----IIDKS-RMRRIAEGSGLEVEDVRELLEWYNNMNKLLKM
SRP54_SULIM      RWLAALNSMTYKELENPS----IIDKS-RMRRIAEGSGLEVEDVRELLEWYNNMNKLLKM
SRP54_SULIA      RWLAALNSMTYKELENPS----IIDKS-RMRRIAEGSGLEVEDVRELLEWYNNMNKLLKM
SRP54_SULIK      RWLAALNSMTYKELENPS----IIDKS-RMRRIAEGSGLEVEDVRELLEWYNNMNKLLKM
SRP54_SACS2      RWLAALNSMTYKELENPN----IIDKS-RMRRIAEGSGLEVEEVRELLEWYNNMNRLLKM
SRP54_METS5      RWLSIMNSMTYQELDNPS----IIDKQ-RMRRIAMGSGTEVEEVRELIEHFNTVQRTLKM
SRP54_SULAC      TFMAIMNSMTYKELDNPS----IIDKA-RMRRIAKGAGVTVEEVKELLKQYQMTNNLLKM
SRP54_SULTO      KFLVIMNSMTYKELDNPS----IIDKS-RIRRIAKGSGTSPEEVKELLKQYQVTNNLLKM
SRP54_PYRAE      KWRAILSSMTLEELKNPE----ILNAS-RIRRIALGAGVAPKDVKEMLTVYENLRKMSKT
SRP54_PYRAR      KWRAILSSMTMEELKNPD----ILNAS-RIRRIALGAGVTPKDVKEMLTVYENLKKMSKT
SRP54_PYRIL      KWYAILSSMTIEELKNPD----ILNAS-RIRRIALGAGVTPKDVKEMLTVYENLKKMSKT
SRP54_PYRNV      KWRAILSSMTVEELKNPE----LLNAS-RIRRIALGAGVTPRDVKEMLTVYENLKRMSKT
SRP54_PYRCJ      KWKAILSSMTMEELKHPE----VLNAS-RIRRIAMGAGVTPKDVKEMLTVFENMKKMSKM
SRP54_BOVIN      KLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK
SRP54_CANLF      KLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK
SRP54_PONAB      KLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK
SRP54_HUMAN      KLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK
SRP54_MACFA      KLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK
SRP54_MOUSE      KLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK
SRP54_RAT        KLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK
SRP54_GEOCY      RLMTMMDSMNDGELDHPNGAKLFSKQPGRAARVARGSGTSVREVNELLKQYSNFSATVKK
SR542_ARATH      RYMTMMDSMTNEELDSSN-PKVFNES--RIMRIARGSGRIVREVMEMLEEYKRLTTMWGK
SR543_ARATH      RYMTMMDSMTNDELDSSN-PKVFNES--RMMRIARGSGRQVREVMEMLEEYKRLAKIWSK
SR541_ARATH      RYMTMMDSMTNKELDSPN-PKIFNES--RIMRIARGSGRLVREVMEMLEEYKRIAK---T
SR541_SOLLC      RYMTMMDSMTDEELDSTN-PKILTES--RIMRIARGSGRLVHEVMEMLEEYKRLAKIFSK
SR542_SOLLC      RYMTMMDSMTNEELDSSN-PKLMTDS--RIMRIARGSGRQVHEVMDMMEEYKRLAKIWSK
SR541_HORVU      RYMTIMDSMTAAELDSTN-PKLMTES--RIIRIARGSGRQIRDVTDMLEEYKRLAKMWSK
SR542_HORVU      RYMTIMDSMTAAELDSTN-PKLMTES--RIIRIARGSGRQIRDVTDMLEEYKRLAKMWSK
SR543_HORVU      RYMTIMDSMTPAELDSTN-PKLMTES--RIIRVARGSGRKVKDVMEMLEEYKRLAKMWSK
SRP54_DICDI      AYINILDSLSEKELDGKK---PITQK--RIITIAQGSGRHPNEVVELLEQHKTFEKLIGK
SRP54_ENTH1      VFMVILDSMTDRELDGSAKTMLNDES--RIRRLARGSGRDIREVNELFEQIKLFQQCIDR
SRP54_ASPNG      RMIYIFDSMTAAELDGDG--KMFVEQPSRMVRIACGSGTTVREVEDLLSQHRMMAGMAKR
SRP54_SCHPO      RMLYIVDSMTEQELDSDG--LLFVEQPSRVLRVARGSGTSVLEVEETISQVRVFAQMAKK
SRP54_YARLI      RMIYILDSMNQKELDSDG--SIFKEVPSRITRVARGSGTSIREVEEVLQQQKMMASMASR
SRP54_YEAST      KMVYVLDSMTKEELESDG--RMFIEEPTRMVRVAKGSGTSVFEVEMILMQQQMMARMAQT
SRP54_CANAX      NMIYIMDSMTTKELECDG--RIFIKEPSRIVRVARGSGCAVVEVEMILQQHRMMSTMAKS
SRP54_ECO57      RMEAIINSMTMKERAKPE---IIK--GSRKRRIAAGCGMQVQDVNRLLKQFDDMQRMMKK
SRP54_ECOL6      RMEAIINSMTMKERAKPE---IIK--GSRKRRIAAGCGMQVQDVNRLLKQFDDMQRMMKK
SRP54_ECOLI      RMEAIINSMTMKERAKPE---IIK--GSRKRRIAAGCGMQVQDVNRLLKQFDDMQRMMKK
SRP54_HAEIN      KMEAIINSMTLKERANPD---IIK--GSRRRRIALGSGTQVQDVNKLLKQFDEMQRMMKK
SRP54_BUCAI      KIEAMICSMTPKERIKPI---IIK--GSRKRRIALGSGTQIQDVNKLLKNFDDIRRIMKK
SRP54_BUCAP      RIEAIIYSMTHKERMHPI---IIK--GSRKRRIALGSGTKIQDVNKLLKNFDNIKKIMKK
SRP54_BUCBP      KMKTIINSMTISERHQPE---LIK--GSRKRRISLGSGIPIPEINQLLKQFNNIKKIMKT
SRP54_RICCN      HQEAIILSMTPKERKNPD---IIN--ASRRKRIAVGAGTTVQKVNILLKQYKQISEIMKK
SRP54_RICFE      HQEAIILSMTLKERENPD---IIN--ASRRKRIAAGAGTTVQKVNILLKQYKQISEMMKK
SRP54_RICBR      HQEAIILSMTPKERRNPD---IIN--ASRRKRIALGAGTTVQKVNILLKQFKQISDMMKK
SRP54_RICPR      HQEAIILSMTLKERKNPD---IIN--ASRRKRIAAGAGMTVQKVNILLKQYKQISAVMKK
SRP54_RICTY      HQEAIILSMTLKERKNPD---IIN--ASRRKRIAAGAGMTVQKVNILLKQYKQISAVMKK
SRP54_BACSU      HVEAIIKSMTVLEKEQPD---II--NASRRKRIAKGSGTSVQEVNRLLKQFDEMKKMMKQ
SRP54_STRMU      RKRAIVSSMTPEERENPD---LL--TPSRRRRIASGSGNTFVNVNKFIKDFNQAKKMMQG
SRP54_SYNE7      RVEAMINSMTPQERRDPD---LLSNSPSRRHRIAKGCGQTEAEIRQIIQQFQQMRTMMQQ
SRP54_SYNY3      RTEAMISSMTTEERKNPD---LLAKSPSRRRRIAQGSGHSETDVSKLITNFTKMRTMMQQ
SRP54_MYCTU      RVQAIIRGMTPQERADPK---IIN--ASRRLRIANGSGVTVSEVNQLVERFFEARKMMSS
SRP54_MYCBO      RVQAIIRGMTPQERADPK---IIN--ASRRLRIANGSGVTVSEVNQLVERFFEARKMMSS
SRP54_MYCLE      RLQAIIRGMTPQERADPK---IIN--ASRRLRIANGSGVTVSEVNQLVDRFFEARKMMSS
SRP54_THEAQ      RLEAIVLSMTPEERKDPR---ILN--GSRRKRIAKGSGTSVQEVNRFIKAFEEMKALMKS
SRP54_AQUAE      KIEAIINSMTPEERRNPK---IIN--MSRKKRIARGSGTTVSDVNKLLKRYEEMKKMMRK
SRP54_HELPY      KIKAMVNSMTKKEQENPE---ILN--GSRRKRIALGSGLEVSEINRIIKRFDQASKMAKR
SRP54_HELPJ      KIKAMVNSMTKKERENPE---ILN--GSRRKRIALGSGLEVSEINRIIKRFDQASKMAKR
SRP54_MYCGE      LWKVLINSMTREERRHPK---LINRDPNRKQRIIKGSGRKMDELNKLMKEWNKMQLKATE
SRP54_MYCPN      LWKVLINSMTREERRHPK---LINRDPSRKQRIIKGSGRKMDELNKLMKEWSKLQTKTAE
SRP54_MYCMY      VFSILMDSMTLKERRDPR---VL-KAISRKNRIIKGSGRSEKEFNELINSFEKGKKQVLE
                      . .:.  *               :   :  *.*     .                

SRP54_HALSA      FQGMG-------------------------------------------------------
SRP54_HALS3      FQGMG-------------------------------------------------------
SRP54_HALVD      FQNMG-------------------------------------------------------
SRP54_HALWD      FQGMG-------------------------------------------------------
SRP54_HALLT      FQGMG-------------------------------------------------------
SRP54_NATPD      FQGMG-------------------------------------------------------
SRP54_HALMA      FQGMG-------------------------------------------------------
SRP54_METAC      FRGG--------------------------------------------------------
SRP54_METMA      FRGG--------------------------------------------------------
SRP54_METBF      FRGG--------------------------------------------------------
SRP54_METBU      LRGG--------------------------------------------------------
SRP54_METAR      MKGGGP------------------------------------------------------
SRP54_METTP      MRGGM-------------------------------------------------------
SRP54_METLZ      FRGN--------------------------------------------------------
SRP54_ARCFU      MKKN--------------------------------------------------------
SRP54_THEAC      MKGNR-------------------------------------------------------
SRP54_THEVO      MKGNR-------------------------------------------------------
SRP54_METKA      IQSGRIP-----------------------------------------------------
SRP54_METTH      LGRRK-------------------------------------------------------
SRP54_METST      MGKRN-------------------------------------------------------
SRP54_METS3      IGKRGRF-----------------------------------------------------
SRP54_METMP      LKRGKMP-----------------------------------------------------
SRP54_METM5      LKRGKMP-----------------------------------------------------
SRP54_METM7      LKRGKMP-----------------------------------------------------
SRP54_METM6      LKRGKMP-----------------------------------------------------
SRP54_METVS      LKRGKMP-----------------------------------------------------
SRP54_META3      MKSGKML-----------------------------------------------------
SRP54_METJA      LRKGKML-----------------------------------------------------
SRP54_PYRAB      MNKRQLL-----------------------------------------------------
SRP54_PYRHO      MNKRQLS-----------------------------------------------------
SRP54_PYRFU      MNKRQLS-----------------------------------------------------
SRP54_THEKO      LNKRKLA-----------------------------------------------------
SRP54_THEON      MDKRKLS-----------------------------------------------------
SRP54_THEGJ      LDKRKLA-----------------------------------------------------
SRP54_AERPE      LKRDKRL-----------------------------------------------------
SRP54_HYPBU      LKKRKDL-----------------------------------------------------
SRP54_STAMF      LRKRRDL-----------------------------------------------------
SRP54_SULIL      VKRRRGS-----------------------------------------------------
SRP54_SULIY      VKRRRGS-----------------------------------------------------
SRP54_SULIN      VKRRRGS-----------------------------------------------------
SRP54_SULIM      VKRRRGS-----------------------------------------------------
SRP54_SULIA      VKRRRGS-----------------------------------------------------
SRP54_SULIK      VKRRRGS-----------------------------------------------------
SRP54_SACS2      VKRRRGN-----------------------------------------------------
SRP54_METS5      LKRRKKD-----------------------------------------------------
SRP54_SULAC      VKRRKG------------------------------------------------------
SRP54_SULTO      VKRRKG------------------------------------------------------
SRP54_PYRAE      LRRQLRL-----------------------------------------------------
SRP54_PYRAR      LKRQMRL-----------------------------------------------------
SRP54_PYRIL      LKRQLRM-----------------------------------------------------
SRP54_PYRNV      LKRQLRM-----------------------------------------------------
SRP54_PYRCJ      LKRQMRM-----------------------------------------------------
SRP54_BOVIN      MG--------------------GIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SRP54_CANLF      MG--------------------GIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SRP54_PONAB      MG--------------------GIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SRP54_HUMAN      MG--------------------GIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SRP54_MACFA      MG--------------------GIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SRP54_MOUSE      MG--------------------GIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SRP54_RAT        MG--------------------GIKGLFKGGDMSKNVSQSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SRP54_GEOCY      MG--------------------GIKGLFKGGDLGKNVNPSQMAKLNQQMAKMMDP-----
SR542_ARATH      VK--------------------GLKN-LEKGNMSALSKN----KNSQQLSKVLPA-----
SR543_ARATH      MK--------------------GLKI-PKNGDMSALSRN----MNAQHMSKVLPP-----
SR541_ARATH      MK--------------------GIKI-PKNG----------------DMSKVIPP-----
SR541_SOLLC      MK--------------------GLKI-PKKGDMSSLSRN----MNAQNMSKVLPP-----
SR542_SOLLC      MK--------------------GLKI-PKKGEMSALSRN----MNAQHMSKVLPP-----
SR541_HORVU      MK--------------------GLKM-PKNGKMSDLSQN----LNIQQMTKALPP-----
SR542_HORVU      MK--------------------GLKM-PKNGKMSDLSQN----LNIQQMTKALPP-----
SR543_HORVU      RN--------------------VSKLIPQNGKMSAQA--------IQKMLKVMPP-----
SRP54_DICDI      GGPGGGLGSLMAGKGGPKNMEQAMKQMNANGGMQGLMNSLKGMGGMGDLAKMFGGGGGGG
SRP54_ENTH1      LP---------------------KAMRAQLGNCNAQPNE---AAMMQQMQRMLPK-----
SRP54_ASPNG      VGGQK-----------------KQMQRAQNMLKGGNKE--QQLAAMQKRMAAMGGAGG--
SRP54_SCHPO      IGGKD-----------------GILGKLGGNPAAALKKDPRQLAAMQKRMQAMGMGGGMP
SRP54_YARLI      MGGKNG-------------MMSRMQN-AQNNPAQMAAAQRRAQQMMGGGAGGMPGMGGM-
SRP54_YEAST      ATQQQ----------------PGAPG-ANARMPGMPNMPGMPNMPGMPNMPGMPKVTPQ-
SRP54_CANAX      AMAAQG-------------GQPGQPGNPMANNPQMQRMMQQAQSNPNFMQQAMNMLGG--
SRP54_ECO57      MK----------------------------------------------------------
SRP54_ECOL6      MK----------------------------------------------------------
SRP54_ECOLI      MK----------------------------------------------------------
SRP54_HAEIN      MR----------------------------------------------------------
SRP54_BUCAI      IK----------------------------------------------------------
SRP54_BUCAP      IK----------------------------------------------------------
SRP54_BUCBP      IK----------------------------------------------------------
SRP54_RICCN      VS----------------------------------------------------------
SRP54_RICFE      AS----------------------------------------------------------
SRP54_RICBR      AS----------------------------------------------------------
SRP54_RICPR      TS----------------------------------------------------------
SRP54_RICTY      AS----------------------------------------------------------
SRP54_BACSU      ------------------------------------------------------------
SRP54_STRMU      VMSGDMNKVMKQMGINP--------------------NNMPKNMD---------------
SRP54_SYNE7      MS----------------------------------------------------------
SRP54_SYNY3      MG----------------------------------------------------------
SRP54_MYCTU      MLGGMGIPGIGRKSATR--------------------KSKGAKGKSGKKSKKGTRGPTPP
SRP54_MYCBO      MLGGMGIPGIGRKSATR--------------------KSKGAKGKSGKKSKKGTRGPTPP
SRP54_MYCLE      VLGGMGIPGMGRKSATR--------------------KSKGGKGK------KRARGPTSP
SRP54_THEAQ      LE-----------------------------------KKKG-------------------
SRP54_AQUAE      LQ-----------------------------------KAGGM------------------
SRP54_HELPY      LTN---------------------------------------------------------
SRP54_HELPJ      LTN---------------------------------------------------------
SRP54_MYCGE      MG----------------------------------------------------------
SRP54_MYCPN      MG----------------------------------------------------------
SRP54_MYCMY      IT----------------------------------------------------------
                                                                             

SRP54_HALSA      ------------DGDMQRMMSKMQQQGGGGG--GGFGGMF--------------------
SRP54_HALS3      ------------DGDMQRMMSKMQQQGGGGG--GGFGGMF--------------------
SRP54_HALVD      ------------DGDMQRMMKKLQNQGGGGG--GGMGGLGGMGPF---------------
SRP54_HALWD      ------------EGDMQRMMKKMQQQGGGGM--GGLGGGGGLGPFG--------------
SRP54_HALLT      ------------EGDMQRMMKKMGGGEGGGL--GDMMG-GGKGPF---------------
SRP54_NATPD      ------------DGDMQRMMKQMQQGGGGGG--GGGGGLGGMGPFGD-------------
SRP54_HALMA      ------------DGDMERMMKQMQQGGGGGGGMGGMGG-GGMGPFGD-------------
SRP54_METAC      ------------KFNIQKMMKKK----------MGM------------------------
SRP54_METMA      ------------KFNIQKMMKKK----------MGM------------------------
SRP54_METBF      ------------KFNIQKMMKKR----------LGM------------------------
SRP54_METBU      ------------KFNIQKMMKK-----------MGM------------------------
SRP54_METAR      ----------GGKMNMQKIMKQ-----------MGMK-----------------------
SRP54_METTP      -----------GRMNMKKLMKRL----------GQPKV----------------------
SRP54_METLZ      ------------RMAMGKMMKQMQK--------GGMGPMGPM------------------
SRP54_ARCFU      ------------KLPIKGLGKLGF------------------------------------
SRP54_THEAC      --------------GLKKMLQANFRSGNFGLEDLGIKE----------------------
SRP54_THEVO      --------------GFKKILQSNFRSGNFGLDDLGLK-----------------------
SRP54_METKA      ----------RIGGELGRVIRNVLRG----------------------------------
SRP54_METTH      -----------MGGPMGQLMRQFMR-----------------------------------
SRP54_METST      -----------MSGPMGKLMRHMQR-----------------------------------
SRP54_METS3      -----------GNNSMNRMMGQFMK-----------------------------------
SRP54_METMP      ----------KMGGQMGQIMRQLMYKD---------------------------------
SRP54_METM5      ----------KMGGQMGQIMRQLMYKD---------------------------------
SRP54_METM7      ----------KMGGQMGQIMRQLMYKD---------------------------------
SRP54_METM6      ----------KMGGQMGQIMRQLMYKD---------------------------------
SRP54_METVS      ----------KMGGKMGQIMRQLMYKE---------------------------------
SRP54_META3      ----------KMGGPMGKIMRQLMYKE---------------------------------
SRP54_METJA      ----------RIGGPLGQIMRQLMFKEG--------------------------------
SRP54_PYRAB      ----------RLARRFGM------------------------------------------
SRP54_PYRHO      ----------RLARRFGM------------------------------------------
SRP54_PYRFU      ----------RLARRFGM------------------------------------------
SRP54_THEKO      ----------KMAKKFNFGGLGI-------------------------------------
SRP54_THEON      ----------KMARKFNLGGFGL-------------------------------------
SRP54_THEGJ      ----------KMAKKFNFGGLGI-------------------------------------
SRP54_AERPE      ----------LRRLGMEL------------------------------------------
SRP54_HYPBU      ----------LERFARLGGV----------------------------------------
SRP54_STAMF      ----------LEKLQLGFKP----------------------------------------
SRP54_SULIL      ----------IDKLFGGKIG----------------------------------------
SRP54_SULIY      ----------IDKLFGGKIG----------------------------------------
SRP54_SULIN      ----------IDKLFGGKIG----------------------------------------
SRP54_SULIM      ----------IDKLFGGKIG----------------------------------------
SRP54_SULIA      ----------IDKLFGGKIG----------------------------------------
SRP54_SULIK      ----------IDKLFGGKIG----------------------------------------
SRP54_SACS2      ----------IDKLFGGKIG----------------------------------------
SRP54_METS5      ----------VEKLFGQMGG----------------------------------------
SRP54_SULAC      ----------LAKLFGGSNQ----------------------------------------
SRP54_SULTO      ----------LAKLFEDRNSK---------------------------------------
SRP54_PYRAE      ----------RMAK----------------------------------------------
SRP54_PYRAR      ----------RMAR----------------------------------------------
SRP54_PYRIL      ----------RIPK----------------------------------------------
SRP54_PYRNV      ----------KMPR----------------------------------------------
SRP54_PYRCJ      ----------KMR-----------------------------------------------
SRP54_BOVIN      -------RVLHHMGGMAG-LQSMMRQF----------QQGAAGNMKGMMGFNNM------
SRP54_CANLF      -------RVLHHMGGMAG-LQSMMRQF----------QQGAAGNMKGMMGFNNM------
SRP54_PONAB      -------RVLHHMGGMAG-LQSMMRQF----------QQGAAGNMKGMMGFNNM------
SRP54_HUMAN      -------RVLHHMGGMAG-LQSMMRQF----------QQGAAGNMKGMMGFNNM------
SRP54_MACFA      -------RVLHHMGGMAG-LQSMMRQF----------QQGAAGNMKGMMGFNNM------
SRP54_MOUSE      -------RVLHHMGGMAG-LQSMMRQF----------QQGAAGNMKGMMGFNNM------
SRP54_RAT        -------RVLHHMGGMAG-LQSMMRQF----------QQGAAGNMKGMMGFNNM------
SRP54_GEOCY      -------RVLQQMGGMSG-LQNMMRQF----------QQGAS-NMPGFKGK---------
SR542_ARATH      -------QMLKQIGGMSG-LQSLMKQ------------MGSGKDLMGMFGG---RDE---
SR543_ARATH      -------QMLKQIGGMGG-LQSLMKQ------------MGSGKDMMGMFGG---GDK---
SR541_ARATH      -------QMLKQMGGMSG-LQSLMKQ------------MGSAKDMMGMFGG---GGK---
SR541_SOLLC      -------QMLKQIGGMGG-LQNLMKQ------------MGSAKDMMGMFGG--GGGE---
SR542_SOLLC      -------QMLKQIGGMGG-LQNLMKQ------------MGSAKDMMGGMGGMFGGGDK--
SR541_HORVU      -------QVLKQMGGMGG-LQALMKQ------------MGG-KDMSKMLGGMGLGGD---
SR542_HORVU      -------QVLKQMGGMGG-LQALMKQ------------MGG-KDMSKMLGGMGLGGD---
SR543_HORVU      -------QVVQQMGGKSG-LEALLKQ------------LGGGKDTSKMLAGMRGGA----
SRP54_DICDI      GGMPSMGDLAKMMGGMGGGGRGGGGMP----------NMGDLAKMMGGMGGGAGKGGQNG
SRP54_ENTH1      -------------GVNQAQLQQLMKQ----------------MNAAGLGGTGKKGKK---
SRP54_ASPNG      ----GGFPGMPGMGDMAKMMQMLQGQGGGGGGGLPGLGGMDLQSMMSQMSGLMGGGGGGG
SRP54_SCHPO      ----GLNPGSMNFGDISKMANMLMGGGGPGG-----AGGMDFSGMLNQFQNMQK------
SRP54_YARLI      ----PGMGGMPGMGGMPGMGGGMPDM--SALQGMFPGGMPDMGQMMNMVQNNPQMKAMAR
SRP54_YEAST      ----MMQQAQQKLKQNPGLMQNMMNMFGGGMGGGMGGGMPDMNEMMKMMQD-PQMQQMAK
SRP54_CANAX      -----AGGGAGGAGGLAGMMNNPAMM--QQAQQMMRSNPQMMQQAQQMMKNPGMMQKMMQ
SRP54_ECO57      ------------KGGMAKMMRSMKGMMPPGFPGR--------------------------
SRP54_ECOL6      ------------KGGMAKMMRSMKGMMPPGFPGR--------------------------
SRP54_ECOLI      ------------KGGMAKMMRSMKGMMPPGFPGR--------------------------
SRP54_HAEIN      ------------KGGMAKMMRGMQGLMGGGLGGLGGLGGMFKR-----------------
SRP54_BUCAI      ------------TDGIAKVIRGIKNMLPKKF-----------------------------
SRP54_BUCAP      ------------KGGIGKMIRNISNILPKNF-----------------------------
SRP54_BUCBP      ------------KGGVTKIMQGINNIIKNKF-----------------------------
SRP54_RICCN      ------------KMNPKNLLRSGIGKLFS-------------------------------
SRP54_RICFE      ------------KMNPKNLLRNGIGKLFS-------------------------------
SRP54_RICBR      ------------NMNPKNLLRSGLGKLFS-------------------------------
SRP54_RICPR      ------------KMNPKNLLRSGIGKLFS-------------------------------
SRP54_RICTY      ------------KMNPQNLFRSGISKLFS-------------------------------
SRP54_BACSU      ---------------MTNMS--KGKKKGFKLPFM--------------------------
SRP54_STRMU      ---SSALEGMMGQGGMPDMS--ELSGTNMDVSQMFGGGLKGKVGEFAMKQSMKKMAKRMK
SRP54_SYNE7      ------------QGGFPGMGGMGMPGFGGGMPGFGGGAPAPQPG--FRGYGPPKKQKKGS
SRP54_SYNY3      ------------MGGMPG----GMPGMGA-MPGMGGGMFGGQPGPGFRGYRGGGGKPKKK
SRP54_MYCTU      KVKSPFGV--PGMPGLAGLPGGLPDLSQMPKGLDELPPGLADFDLSKLKFPGKK------
SRP54_MYCBO      KVKSPFGV--PGMPGLAGLPGGLPDLSQMPKGLDELPPGLADFDLSKLKFPGKK------
SRP54_MYCLE      KVRSPFGPARPGMPDMMNMPPSFPDLSQMPDGLNELPPGLAAFDLSKLKFPGKT------
SRP54_THEAQ      -------------RGLMGMFRR--------------------------------------
SRP54_AQUAE      ----------PAIPKMPKMPRFPSEASSFNLFLFLST-----------------------
SRP54_HELPY      ------------KKGISDLMNLMSQAKNQTPPKMR-------------------------
SRP54_HELPJ      ------------KKGISDLMNLMSQAKNQTPPKMR-------------------------
SRP54_MYCGE      --------------KLLKTGSNPFGGFGQFF-----------------------------
SRP54_MYCPN      --------------RMLKGGKNPFSGFGGLGGLGF-------------------------
SRP54_MYCMY      --------------KMIKSGRMPNLSKGGFKF----------------------------
                                                                             

SRP54_HALSA      ---------
SRP54_HALS3      ---------
SRP54_HALVD      ---------
SRP54_HALWD      ---------
SRP54_HALLT      ---------
SRP54_NATPD      ---------
SRP54_HALMA      ---------
SRP54_METAC      ---------
SRP54_METMA      ---------
SRP54_METBF      ---------
SRP54_METBU      ---------
SRP54_METAR      ---------
SRP54_METTP      ---------
SRP54_METLZ      ---------
SRP54_ARCFU      ---------
SRP54_THEAC      ---------
SRP54_THEVO      ---------
SRP54_METKA      ---------
SRP54_METTH      ---------
SRP54_METST      ---------
SRP54_METS3      ---------
SRP54_METMP      ---------
SRP54_METM5      ---------
SRP54_METM7      ---------
SRP54_METM6      ---------
SRP54_METVS      ---------
SRP54_META3      ---------
SRP54_METJA      ---------
SRP54_PYRAB      ---------
SRP54_PYRHO      ---------
SRP54_PYRFU      ---------
SRP54_THEKO      ---------
SRP54_THEON      ---------
SRP54_THEGJ      ---------
SRP54_AERPE      ---------
SRP54_HYPBU      ---------
SRP54_STAMF      ---------
SRP54_SULIL      ---------
SRP54_SULIY      ---------
SRP54_SULIN      ---------
SRP54_SULIM      ---------
SRP54_SULIA      ---------
SRP54_SULIK      ---------
SRP54_SACS2      ---------
SRP54_METS5      ---------
SRP54_SULAC      ---------
SRP54_SULTO      ---------
SRP54_PYRAE      ---------
SRP54_PYRAR      ---------
SRP54_PYRIL      ---------
SRP54_PYRNV      ---------
SRP54_PYRCJ      ---------
SRP54_BOVIN      ---------
SRP54_CANLF      ---------
SRP54_PONAB      ---------
SRP54_HUMAN      ---------
SRP54_MACFA      ---------
SRP54_MOUSE      ---------
SRP54_RAT        ---------
SRP54_GEOCY      ---------
SR542_ARATH      ---------
SR543_ARATH      ---------
SR541_ARATH      ---------
SR541_SOLLC      ---------
SR542_SOLLC      ---------
SR541_HORVU      ---------
SR542_HORVU      ---------
SR543_HORVU      ---------
SRP54_DICDI      FPNLDLD--
SRP54_ENTH1      ---------
SRP54_ASPNG      GRGRGR---
SRP54_SCHPO      -PPRRR---
SRP54_YARLI      SMGLGI---
SRP54_YEAST      QFGMG----
SRP54_CANAX      QFGGMGGM-
SRP54_ECO57      ---------
SRP54_ECOL6      ---------
SRP54_ECOLI      ---------
SRP54_HAEIN      ---------
SRP54_BUCAI      ---------
SRP54_BUCAP      ---------
SRP54_BUCBP      ---------
SRP54_RICCN      ---------
SRP54_RICFE      ---------
SRP54_RICBR      ---------
SRP54_RICPR      ---------
SRP54_RICTY      ---------
SRP54_BACSU      ---------
SRP54_STRMU      KAKKRKK--
SRP54_SYNE7      KKKKGFGL-
SRP54_SYNY3      KKKKGFGQL
SRP54_MYCTU      ---------
SRP54_MYCBO      ---------
SRP54_MYCLE      ---------
SRP54_THEAQ      ---------
SRP54_AQUAE      ---------
SRP54_HELPY      ---------
SRP54_HELPJ      ---------
SRP54_MYCGE      ---------
SRP54_MYCPN      ---------
SRP54_MYCMY      ---------