CLUSTAL format seed alignment for MF_00551
_____________________________________________________________________________
Features found in the protein:
- The following colors are used to highlight features:
- blue indicates SIGNAL, PROPEP, TRANSMEM, DOMAIN, ZN_FING, REPEAT,
DNA_BIND and CA_BIND.
- magenta is used to display DISULFID, THIOLEST and THIOETH.
- red is used for all other features, such as INIT_MET, ACTIVE SITE,
METAL,BINDING, NP_BIND, SITE, REGION, etc.
- The ID of the sequence used as the template for feature propagation is
underlined.
- A '<' at the beginning of a sequence or '>' at the end indicate that
the protein is fused with another domain either at the N- or C-terminus.
_____________________________________________________________________________
URK_HALH5 ----MGKRPIIIGVAGGTGSGKTTVAKEIF----YQFNEK-SIVLIEQDAYYKDQSQLSL
URK_BACSU ----MGKNPVVIGIAGGSGSGKTSVTRSIY----EQFKGH-SILMIQQDLYYKDQSHLPF
URK_BORBU -------MAKIIGISGGSGSGKTTVVSKIS----EFIPE---FVLISQDNYYKSVGDYEH
URK_CHLPN ---MLMMLMMIIGITGGSGAGKTTLTQNIK----EIFG-E-DVSVICQDNYYKDRSHYTP
URK_DEIRA --MSGPGTPFVIGVAGGSGSGKTTVTRRVI----ETVGRE-GVAVLNQDNYYRDQSDIPF
URK_HALSA ----MTIPSFAIGIAGGTGAGKTTVAREIT----DNVG-E-SATLIPLDNYYEDLSDRPF
URK_ECOLI -MTDQSHQCVIIGIAGASASGKSLIASTLYRELREQVGDE-HIGVIPEDCYYKDQSHLSM
URK_SALTY -MTDQSHQCVIIGIAGASASGKSLIASTLYRELREQVGDE-HIGVIPEDSYYKDQSHLSM
URK_YERPE -MTDKAHQCVIIGIAGASASGKSLIASTLYRELREQVGDQ-HIGVIPEDGYYKDQSHLSM
URK_VIBCH --MSENNQCVIVGIAGASASGKSLIASTIYNELRAKVGDH-QIGVITEDCYYKDQSHLSM
URK_HAEIN ---MSNPSCIIIAITGASASGKSSIASTVHKELCNELGCQ-EIGIITEDSYYKDQSHLEM
URK_PASMU MSNSSTPSCIIIAIAGASASGKSLIASTVHRELCDELGCE-EIGIISEDSYYKDQSHLDM
URK_CLOPE -----MKRPIFIGITGGTGSGKSTIAKEIY----RQFGED-CIAMIEQDSYYKDQSHLSM
URK_STAAM -----MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIM----KNLEGH-SVALLAQDYYYKDQKHLTF
URK_LACLA -----MKKTLIIGVTGGSASGKTSVSHAIL----ETFSNE-RIAMIEHDSYYKDQSHLTF
URK_STRPN ----MQNRPIIIGVTGGSGGGKTSVSRAIL----SHFPDE-KISMIEHDSYYKDQSHLTF
URK_STRP1 ----MLKKPIIIGVTGGSGGGKTSVSRAIL----DSFPNA-RIAMIQHDSYYKDQSHMSF
URK_LISIN ----MTKKPIVVGVTGGSGSGKTSVTKAIC----DHFSGH-SILMIAQDVYYHDQADISF
URK_LISMO ----MTKKPIVVGVTGGSGSGKTSVTKAIC----NHFSGH-SILMIAQDVYYHDQANISF
URK_MYCGE ----MDEKGILVAISGGSCSGKTTVAEMIY----QLLSKKLKVAIICQDNYYKSYKNKPL
URK_MYCPN ---MDSKKGILVAIGGGSCSGKTTIADMIY----QLLRKKLKVAILPQDNYYKPYKNKSM
URK_UREPA ---MNTKSPILILIAGASGSGKTTFANEII----ARIPKNTTSVVICQDSYYISNSQLNK
: : *.: .**: . : . :: * ** .
URK_HALH5 EERLQTNYDHPLAFDNDLLIEHLHSLLNGQAIEKPVYDYKLHTRSN-EVILVEPKDVIIL
URK_BACSU EERLNTNYDHPLAFDNDYLIEHIQDLLNYRPIEKPIYDYKLHTRSE-ETVHVEPKDVIIL
URK_BORBU EFS-KVNFDHPDAFDNNLFYEHLKNLKKNSPIDMPLYDFINHKRQL-KTVLVVPTPVVIV
URK_CHLPN EERANLIWDHPDAFDNDLLISDIKRLKNNEIVQAPVFDFVLGNRSKTEIETIYPSKVILV
URK_DEIRA ESRLHTNYDHPAAFDWALLREQLDALLAGVPIEMPEYDFTQHTRAA-HTTRVLPGRVVVL
URK_HALSA EERANANYDHPSAFEWELLRTHIDALLSGQSIEMPQYDFERHVRKA-DRVVVEPTDVIVL
URK_ECOLI EERVKTNYDHPSAMDHSLLLEHLQALKRGSAIDLPVYSYVEHTRMK-ETVTVEPKKVIIL
URK_SALTY EERVKTNYDHPNAMDHSLLFQHLQALKRGSAIELPVYSYVEHTRMQ-ETVRVEPKKVIIL
URK_YERPE EERVKTNYDHPSAMDHNLLLEHLQALKAGKPVELPLYSYTEHTRKK-ETVHLEPKKVIIL
URK_VIBCH EERVKTNYDHPSALDHDLLCQHLQMLARGEAVEVPEYSYTEHTRTE-QTTTMTPKKVIIL
URK_HAEIN TERVKTNYDHPNSMDRDLLIQHLKNLKNGSAVDVPVYSYVEHTRTN-ETTHFTPKRIVIL
URK_PASMU EDRIKTNYDHPNSMDRHLLIEHLKALKSGQPVDIPVYSYVEHTRTN-QVQHFEPKKVIIL
URK_CLOPE EDRVKTNYDHPNAFDNNLLVSHLESLLNGHSIQKPSYDFSIHNRIE-DTTKVEPKEIVIV
URK_STAAM DERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSD-ITIDFKPKDVIIV
URK_LACLA EERTKTNYDHPLAFDTDYLIAQLKELQYGRAVDIPIYDYAKHTRSQ-ETYRQEPVDVLIV
URK_STRPN EERVKTNYDHPFAFDTDLMIEQIKELLAGRPVDIPTYDYTEHTRSS-KTYRQEPQDVFIV
URK_STRP1 EERVKTNYDHPLAFDTDFMIQQLKELLAGRPVDIPIYDYKKHTRSN-TTFRQDPQDVIIV
URK_LISIN EERLKVNYDHPLAFDTDLLISHIAALRRYETIEKPIYDYEKYTRKQ-EVEIQEPREVIIL
URK_LISMO EDRLKVNYDHPLAFDTDLLISHIAALRRYESIEKPIYDYAKYTRKK-EVEIQEPREVIIL
URK_MYCGE LKRKTINFDHPDAFDWKLLRSHIEDLLNGSIVNVPLYDYINYTRAK-KTAKIGPIDVVIL
URK_MYCPN AQRKAINFDHPDAFDWKLLWSHLDNLLMGKTVAVPMYDYVNYTRKK-ETIEIGPLNVVIL
URK_UREPA KERRLINYDHPSSFEWELMREQLSDIKKRKKIKVPIYDYKTEIRLD-KTIDISDVDVIVL
:*** ::: : .: : : * :.: * :.::
URK_HALH5 EGILLLEDERLRELMDIKLFVDTDADIRIIRRMVRDIRERGRTLESVIEQYTKVVRPMHM
URK_BACSU EGILVLEDKRLRDLMDIKLYVDTDADLRIIRRIMRDINERGRSIDSVIEQYVSVVRPMHN
URK_BORBU EGIMIFVEERVRNLIDLKIYIDTPNDIRFIRRLRRDISKRGRTVESVIDQYLNTTRWGYY
URK_CHLPN EGILVFENQELRDLMDIRIFVDTDADERILRRMVRDVQEQGDSVDCIMSRYLSMVKPMHE
URK_DEIRA EGFFALYDEELRSRMGLKVFVDADADVRFIRRLLRDTQERGRTPESVIEQYLGFVRPMHL
URK_HALSA EGILALSDETVNDMLDLHIYVETDADVRILRRIERDVVERGRELEGVMDQYLSTVKPMHE
URK_ECOLI EGILLLTDARLRDELNFSIFVDTPLDICLMRRIKRDVNERGRSMDSVMAQYQKTVRPMFL
URK_SALTY EGILLLTDARLREEMNFSIFVDTPLDICLMRRIKRDVNERGRSMDSVMAQYQKTVRPMFL
URK_YERPE EGILLLTDIRLRQEMNFSIFVDTPLDICLMRRMKRDVNERGRSMDSVMAQYQKTVRPMFL
URK_VIBCH EGILLLTDPRLRDLMHATVFMDTPLDICLLRRVKRDVQERGRTMESVLKQYQETVRPMFM
URK_HAEIN EGILLLTDERVRQLADISVFVDTPLDICFIRRLQRDMEERGRSLQSVIDQYRATVRPMFL
URK_PASMU EGILLLTDEKLRDEVSVSVFVDTPLDICFIRRLQRDMKERGRSLESVVEQYRKTVRPMFL
URK_CLOPE EGILILEDPRIRELLDIKIYVDTDADVRIIRRMVRDINERGRTMESVINQYLNVVKPMHN
URK_STAAM EGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHD
URK_LACLA EGILVLEDERLRDLMDIKIFVDTDDDVRIIRRIRRDIEERGRTLDSVITQYLDAVKPMYH
URK_STRPN EGILVLEDKRLRDLMDIKIFVDTDDDVRIIRRIKRDMEERGRSLDSVINQYLGVVKPMYH
URK_STRP1 EGILVLEDERLRDLMDIKLFVDTDDDIRIIRRIKRDMMERGRSLESIIDQYTSVVKPMYH
URK_LISIN EGILILEDKRLRDLMDIKVYVDTDDDIRFIRRLLRDMKERGRTMDSVIDQYLSVVKPMHN
URK_LISMO EGILILEDKRLRDLMDIKVYVDTDDDIRFIRRLLRDMKERGRTMDSVIEQYLSVVKPMHN
URK_MYCGE EGLMPWFDEKLSRLSKLKIFIETNGEERLIRRIERDW-QRGRNIDSIIKQWREIVAPMYE
URK_MYCPN EGLMPWFDERIAKLCKLKIFVEATGEERLIRRIERDW-ERGRDVASIIKQWREAVSPMYE
URK_UREPA EGIYAIYDDVINQIADLKIFIETPKDECLIRRILRDVNERNRSFESVITQWRSTVSPMYD
**: : : ::::: : ::**: ** ::. :: :: . .
URK_HALH5 QFIEPTKRYADVIIPEGGQNRVAIDLMVTKIRAIIEEKAVL----------------
URK_BACSU QFVEPTKRYADIIIPEGGQNHVAIDLMVTKIQTILEQNAIL----------------
URK_BORBU RFIEPTKEYADLIIPEGGHNDKALYVLSTFLKSLSKEGLDFT---------------
URK_CHLPN KFIEPTRKYADIIVHGNYRQNVVTNILSQKIKNHLENALESDETYYMVNSK------
URK_DEIRA SFVEPTKRYADVIIPHGGMNEPALDMLAARIRVMAQRD-------------------
URK_HALSA QFIEPTKRHADIIIPEGA-NSVAVNLLEEKVQAETSEMTAWAARDDTAFEDATYNPQ
URK_ECOLI QFIEPSKQYADIIVPRGGKNRIAIDILKAKISQFFE---------------------
URK_SALTY QFIEPSKQYADIIVPRGGKNRIAIDILKAKISQFFE---------------------
URK_YERPE QFIEPSKQYADIIVPRGGKNRIAIDILKAKISQFFE---------------------
URK_VIBCH QFIEPSKQYADIIVPRGGKNRIAIDVLKAHIAKLLKS--------------------
URK_HAEIN QFIEPSKQYADIVIPRGGKNRIAINMLKAQILHLLNQK-------------------
URK_PASMU QFIEPSKQYADIVIPRGGKNRIAINMLKAQIRQLLGKR-------------------
URK_CLOPE QFTEPTKKFADIIIPEGGHNKVAIDIIVAKIKEVLGKYE------------------
URK_STAAM QFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ-------------------
URK_LACLA QFIEPTKRYADVIIPEGVSNTVGVDIITTKIASILND--------------------
URK_STRPN QFIESTKRYADIVIPEGVSNTVAIDLLTTKIAKILEEARNSK---------------
URK_STRP1 QFIEPSKRYADIVIPEGVSNVVAIDVINSKIASILGEV-------------------
URK_LISIN EFIEPTKKFADIIIPEGGENHVAIDLMTTKIESILQKHV------------------
URK_LISMO EFIEPTKKFADIIIPEGGENHVAIDLMTTKIESILQKHV------------------
URK_MYCGE IFVEKMKRNADLILPWSQRREVSTSVLDVAIEHLFHKTVEKNN--------------
URK_MYCPN IFVEKMKQKADLIIPWSERHEVSTNVLDFAIEHLFRKHVDPN---------------
URK_UREPA QFVEPSKKNANVSVLWNEHNRVALHLIHKWINNIH----------------------
* * :. *:: : . . :: :