CLUSTAL format seed alignment for MF_00683

_____________________________________________________________________________

Features found in the protein:_____________________________________________________________________________

TMAR_ECOLI       -METT-KPSFQDVLEFVRLFRRKNKLQREIQDVEKKIRDNQKRVLLLDNLSDYIKPGMSV
TMAR_ESCFE       -METT-KPSFQDVLEFVRLFRRKNKLQREIQDVEKKIRDNQKRVLLLDNLSDYIKPGMSV
TMAR_SALTY       -METT-KPSFQDVLEFVRLFRRKNKLQREIQDIEKKIRDNQKRVLLLDNLSDYIKPGMSV
TMAR_PHOLL       -MDNVNKPSFHNVLEFVRMFRRKNKLQREIADNEKKIRDNQKRVLLLDNLSEYIKPGMSI
TMAR_YERPE       -MDNASKPTFQDVLEFVRMFRRKNKLQREIVDNEKKIRDNQKRVLLLDNLSEYIKPGMSI
TMAR_BUCAI       --MSDTKKSFKNVLEFVHKFRRKNKIKREISDIEKKIRDNQKRILLLDNLIQYITLDMNY
TMAR_BUCAP       ---MNTKKTFKSALEFVHKFRRKNKIKREISDIEKKIRDNQKRILLLDNLNQYITPDMNY
TMAR_BLOFL       MNNSDIDKSFYSVLEFVRIFRRRNKLQREISDNEKKIRDNQKRVLLLRNLIDYIKSENSI
TMAR_HAEIN       -MEIVNKQSFQDVLEYVRMYRLKNRIKRDMEDNNRKIRDNQKRILLLDNLNQYIRDDMTI
TMAR_PASMU       -MENVNKQSFQEVLEYVRMYRLKNKLARDREDNNRKIRDNQKRVLLLDNLNQYIRDDMSI
TMAR_HAEDU       -MVDTKKQSFQNMLDYVHLYRLKNKLHRETADNDRKIRDNQKRVLLLDNLTQYITDAMSI
TMAR_VIBVU       ---------MNTVFEIVSQARRKNKLKRELLDNEKKVRDNRKRVELLENLLDYIKPNMSQ
TMAR_VIBVY       ---------MNTVFEIVSQARRKNKLKRELLDNEKKVRDNRKRVELLENLLDYIKPNMSQ
TMAR_VIBPA       ---------MSSVFEIVNQARRKNKLKRELLDNEKKVRDNRKRVDLLENLLDYIKPEMSH
TMAR_VIBCH       ---------MNSVFEIVSLARRKNKLQRELDDNEKKVRDNRKRVELLVNLLDYIKPNMSH
TMAR_FUSNN       ---------MDSVLELVRKERRKNQIKREIEDNDRKIRDNRKRVELLLNLKEYLKVNMSY
                          :   :: *   * :*:: *:  * ::*:***:**: ** ** :*:    . 

TMAR_ECOLI       EAIQGIIASMKGDYEDRVDDYIIKNAELSKERRDISKKLKAMGEMKNGEAK----
TMAR_ESCFE       EAIQGIIASMKSDYEDRVDDYIIKNAELSKERRDISKKLKVMGEIKNGEAKSE--
TMAR_SALTY       EAIQGIIASMKSDYEDRVDDYIIKNAEISKERRDISKKLKAMGEMKHADVKAE--
TMAR_PHOLL       EDIQSIIMNMRSDYEDRIDDHIIKNADLSKERRELSKKLKTMGELK---------
TMAR_YERPE       EEVQAIIANMRGDYEDRVDDYIIKNADLSKERRELSKKLKAMGEVK---------
TMAR_BUCAI       EEIKKIIFMMKSDYEDRIDDYIVKNAELSKEKRNLSKELKFIIK-----------
TMAR_BUCAP       EEIKKIIFMMKNDYEDRIDDYIVKNAELSKEKRSLSKELKLIVD-----------
TMAR_BLOFL       EGVQVIITNMCNDYEDRVDDYIIKNAELSKERRELSKKLKQFKQSDNN-------
TMAR_HAEIN       AEVRGIIESMRDDYESRVDDYTIRNAELSKQRREASTKMKEQKKAHAELLKNAEK
TMAR_PASMU       QDVRTIIESMREDYEKRVDDYMIRNAEISQQRREIREKMKEQKQAHEVLLKKE--
TMAR_HAEDU       EEIRAIIAHMRDDYENRVDDYMIRNAELSKQRREIRQKMAAHKQAPTVKTTD---
TMAR_VIBVU       DEIMTIIKNMKADYEDRVDDHIIKSAEISKARRDISRRIRELTEEDKQAS-GKK-
TMAR_VIBVY       DEIMTIIKNMKADYEDRVDDHIIKSAEISKARRDISRRIRELTEEDKQAS-GKK-
TMAR_VIBPA       DEIVAIIKNMKADYEDRVDDHIIKSAEISKARRDISRRIRELTEEDKQTS-GKK-
TMAR_VIBCH       EEILGIIKNMKSDYEDRVDDHIIKSAEISKERRDISRRIKDLTEHDKQMTQGKKA
TMAR_FUSNN       EEIIDIIENMQSDYEDRVDDYIIKNAELGKERREISKTIKDFK---KSVS-----
                   :  **  *  ***.*:**: ::.*::.: :*.    :