CLUSTAL format seed alignment for MF_01218_A

_____________________________________________________________________________

Features found in the protein:_____________________________________________________________________________

UPP_PYRAE       --------MPVRIIDHVYAQYLLTKLRDKNTGSIEFRKGLVRLGRIIGYELAK-TFPVKY
UPP_HALSA       --MTIEDRGDAHVITHSLAKHTLSRLRDTTTEQVSFRKGLVKLGRISGYEIIDGAMETEF
UPP_PYRFU       MIEDKRWGGVYSFEDSPYIMEILTELRDKDTDSIKFRKGLVKLGRYMGYEITK-TMDVEK
UPP_PYRAB       MIEDKRWKGVYSFEDSPFIMEILTQLRDKNTDSIEFRKGLVKLGRYMGYELTK-TMEVEK
UPP_SACS2       --------MPLYVIDKPITLHILTQLRDKYTDQINFRKNLVRLGRILGYEISN-TLDYEI
UPP_SULTO       --------MPLFVLSKPITLHFLTQLRSKNTDQITFRKTLVRLGRIIGYEILN-MLDYNI
UPP_METTH       ---MDGERMMLRVIDNLIVREKLTTIRCRGIDPASFRRGVTDIGRYMAYEFAD-TLKWRE
UPP_AERPE       ----MVAAVRVIGGETPLARYVLKVLRDRTTGFPEFRRYVRIAGSILAVYIAG-ELGWVE
                                      *. :*        **: :   *   .  :    :    

UPP_PYRAE       VEIETPLG-KAVGVDIIGLDKVVIVQVLRAAMPLVEGLVKAFPQARLGVVAAKRRE----
UPP_HALSA       TAFETPLT-ETTGERVTGLDDVVIINVLRAATPFVEGLLKAFPRAKQGVISAGRDEDA-G
UPP_PYRFU       VKVETPLE-ETEGIIVKDRRNVVIITVLRAAIPFMEGLIKVFEHARVGIVSAARGK----
UPP_PYRAB       VKVETPLE-ETEGIIVKDRRNVVIITVLRAAIPLMEGLIKVFEHARVGIVSAVRGK----
UPP_SACS2       VEVETPLGVKTKGVDITDLNNIVIINILRAAVPLVEGLLKAFPKARQGVIGASRVEVD-G
UPP_SULTO       IEVETPLGVKAKGVYIYDLENIVIISILRAATPLVEGLLKALPTARLGVIAASRKETQVN
UPP_METTH       VEVETPLG-TASGVEITDRDRIVLLSILRASLPFTEGVMKVFPEAEHGIIGARRSD----
UPP_AERPE       EEVETPLG--AKAKELAPAGPVYLVGILGASLPMVEGFASMMPEARIALVAARRVE----
                  .****   : .  :     : :: :* *: *: **. . :  *. .::.* * .    

UPP_PYRAE       --EGGVVDVDIFYSKVPKIAED-DVVIVADPMLATGITMSRVIEEVYRAGNPGR---LIV
UPP_HALSA       MDADGEFPITVDYVKLPDISEG-DTVIVADPMLATGSTMCTVLDHVTDEMPAAGVEDLFV
UPP_PYRFU       ---PPKFEIEMNYIKIPQITPE-DTVIVADPMIATGSTLLRVLEEVKKYGTPKR---TLV
UPP_PYRAB       ---APEFKIEMDYVKIPQIKPE-DTVIVADPMIATGSTLTRVLGEVKKYGEPKR---TIV
UPP_SACS2       KEVPKDMDVYIYYKKIPDIRAKVDNVIIADPMIATASTMLKVLEEVVKANPKR----IYI
UPP_SULTO       LGYPKEMEVEIFYNKIPEINIK-DNVIIADPMIATASTMLKALNIIKDKKPKR----IFI
UPP_METTH       ---EPPFRVSIDYIRVPELDD--KILVIADPMLATGNTMIGILEALEAHGSPAR---TVV
UPP_AERPE       --EPGRLKIEVYYSRLPRMFD--GPAVVLDPMLATGKTVAEAVRLARDRG-ASK---VVI
                      . : : * ::* :       :: ***:**. *:   :                :

UPP_PYRAE       VSVIATPMGIERVLSRWPSAEIYAVAVDPTLNDKAFIVPGLGDAGDRAFAT---------
UPP_HALSA       LSAVSAPDGLLRVGDQFPDADLLTVAIDDTLTDDGYIVPGLGDAGDRAFRTT--------
UPP_PYRFU       VGVLAAPEGITRIKEKFPEVEIFVAKIDRELNDKGYILPGLGDAGDRAFGEPVKITTLPQ
UPP_PYRAB       LGVLAAPEGISKIKSEFPDVEIFVAKIDRELDHKGYILPGLGDAGDRAFGEPLKLSTLPQ
UPP_SACS2       VSIISSEYGVNKILSKYPFIYLFTVAIDPELNNKGYILPGLGDAGDRAFG----------
UPP_SULTO       VSIIISEYGLKRILESYPDVNIITVSIDPELDNRGYILPGLGDAGDRAFG----------
UPP_METTH       FNIISSRMGLDRVLQR--GIDVYTCGVEEEVNDMGYIVPGLGDAGDLAFGRPSD------
UPP_AERPE       GSIIASRQGVEYISSLYGDTPIYTLALDPELDENYFIVPGLGDAGDRALGVEP-------
                 . : :  *:  : .      : .  ::  : .  :*:******** *:           

UPP_PYRAE       -----
UPP_HALSA       -----
UPP_PYRFU       VHYIE
UPP_PYRAB       VHHIE
UPP_SACS2       -----
UPP_SULTO       -----
UPP_METTH       -----
UPP_AERPE       -----