CLUSTAL format seed alignment for MF_01235

_____________________________________________________________________________

Features found in the protein:_____________________________________________________________________________

NANE_ECOLI       ------MSLLAQLDQKIAANGGLIVSCQPVPDSPLDKPE--IVAAMALAAEQAGAVAIRI
NANE_SHIFL       ------MSLLAQLDQKIAANGGLIVSCQPVPDSPLDKPE--IVAAMALAAEQAGAVAIRI
NANE_ECO57       ------MSLLAQLDQKIAANGGLIVSCQPVPDSPLDKPE--IVAAMALAAEQAGAVAIRI
NANE2_SALTY      ------MSLLEQLDKNIAASGGLIVSCQPVPGSPLDKPE--IVAAMALAAEQAGAVAVRI
NANE_KLEAE       ------MSLLAQLDQRIRHHGGLIVSCQPVPGSPLDNPA--IVAAMALAAEQAGAVALRI
NANE1_SALTY      ------MSLLARLEQSVHENGGLIVSCQPVPGSPMDKPE--IVAAMAQAAASAGAVAVRI
NANE_YERPE       ------MSNLSNLRHKLQ--NGLIASCQPVPGSAMDTPE--IVAAMACAALAGGAVGLRI
NANE_HAEIN       ------MSKLSYQEVLSQIQYGLISSCQPVDDGPMDKPE--IVSAMAQASVMGGRSGLRI
NANE_PASMU       ------MSKLSHPQVLEQIKYGLIASCQPVDNGPMDSPE--IVAAMAQASVIGGAAGLRI
NANE_VIBCH       MRPVVRKNFLNIEELKRFLNGQTVVSIQPVTGSPLDKTD--FIVAMAIAVEQAGAKALRI
NANE_VIBVU       -----------------MLSGQTVVSIQPVVGSPLDKTE--FIVAMAVAAEQAGAKALRI
NANE_THEVB       ------------MNLATQIRGGLIVSCQAPADSPLAAPE--IIAAMAKAAVLRGAVAVRI
NANE_STAAM       -----------------MLPHGLIVSCQALADEPLHSSF--IMSKMALAAYEGGAVGIRA
NANE_STAAW       -----------------MLPHGLIVSCQALPDEPLHSSF--IMSKMALAAYEGGAVGIRA
NANE_STAA3       -----------------MLPHGLIVSCQALPDEPLHSSF--IMSKMALAAYEGGAVGIRA
NANE_OCEIH       --------------MLDQIKNSLIVSCQALPDEPLHSSF--IMSKMALAAKQGGAKGIRA
NANE_LISIN       ----------MGNSVMEKIKGGLVVSCQALEDEPLHSAF--IMSKMALAAVQGGAVGIRA
NANE_LISMO       ----------MGNSVMEKIKGGLVVSCQALEDEPLHSAF--IMSKMALAAVQGGAVGIRA
NANE_LACPL       ----------MKNTFLNTVKGSLIISCQALPNEPLHSSF--IMSRMALAAKGAGAAGIRA
NANE_BORBU       ------------MIIIVKIKRGLIVSCQALENEPLHSSF--IMSKMALAAKIGGAIGIRA
NANE_FUSNN       -----------MNKILESIRGKLIVSCQALEDEPLHSSF--IMGRMAYAAYSGGAAGIRA
NANE_STRA3       -----MP-HLSKEAFKKQIKNGIIVSCQALPGEPLYTESGGVMPLLALAAQEAGAVGIRA
NANE_STRSU       -----MG-KISKEALKEQIKDGIIISCQALPGEPLYREEGGIMPLLVKAAQEAGAVGIRA
NANE2_STRPN      -----MP-QISKEALIEQIKDGIIVSCQALPHEPLYTEAGGVIPLLVKAAEQGGAVGIRA
NANE1_STRR6      -----MS-QISKEALIEQIKDGIIVSCQALPHEPLYTEAGGVIPLLVKAAEQGGAVGIRA
NANE_STRP3       -----MPDKPTKEKLMEQLKGGIIVSCQALPGEPLYSETGGIMPLLAKAAQEAGAVGIRA
NANE_STRP1       -----MPDKPTKEKLMEQLKGGIIVSCQALPGEPLYSETGGIMPLMAKAAQEAGAVGIRA
NANE_ENTFA       ---------MNKAKFLEVISGGLIVSCQALPGEPFYTEEGGLMPYFALAAKNAGAVGIRA
NANE_LACLA       ---------MKKEVFLDKVKNGIIVSCQALPGEALYSEKGGIMPLMAKAAAQAGAVGIRA
NANE1_STRPN      -----MSQIWTKEKFISQVQGGVIVSCQALPGEALYNEEFSLMPFMAKAALEAGAVGIRA
NANE_CLOPE       --------------MLDVVKGNLIVSCQALSDEPLHSSF--IMGRMAIAAKQGGAAAIRA
NANE_CALS4       ----------MQMDIIQKLENGLIVSCQALEGEPLHSPF--IMAKMAKAAEIGGAVAIRA
NANE_MALP2       ----------MKDVILRKIKNNLVVSCQAVGEETLNNDI--AITLMAKACLEGGAKVLRL
NANE_MYCPU       ----------------MFEKKLFFVSCQALKGEALYGKD--IVVKLAKAAIQGGAQGLRT
NANE_CORGL       -----MDLNTQRSKLYAQLQGQLIVSVQAPDGHAMRDTH--TLTHVAAACVDGGAPAIRC
                                        . * *.    .:       :  .. *    *   :* 

NANE_ECOLI       EGVANLQATRAVV---SVPIIGIVKRDLEDSPVRITAYIEDVDALAQAGADIIAIDGTDR
NANE_SHIFL       EGVANLQATRAVV---SVPIIGIVKRDLEDSPVRITAYIEDVDALAQAGADIIAIDGTDR
NANE_ECO57       EGVANLQATRAVV---SVPIIGIVKRDLEDSPVRITAYIEDVDALAQAGADIIAIDGTDR
NANE2_SALTY      EGIDNLRMTRSLV---SVPIIGIIKRDLDESPVRITPFLDDVDALAQAGAAIIAVDGTAR
NANE_KLEAE       EGQANLQAVRPLV---TVPVIGLIKRDLPDSPVRITPWLEDIDALAQGGADIIAIDGTQR
NANE1_SALTY      EGIENLRTVRPHL---SVPIIGIIKRDLTGSPVRITPYLQDVDALAQAGADIIAFDASFR
NANE_YERPE       EGISNIQAVRRAT---DAPIIGIIKRDLPDSEVRITPWLEDIDALSAAGADIIAFDVTCR
NANE_HAEIN       EGVDNLKATRPFV---NVPIIGIVKRDLPDSPVRITPFLQDIEDLANAGADIIAVDGTSR
NANE_PASMU       EGIENLKATRNVV---NVPIIGIVKRDLPDSPVRISPFLQDIEELAAAGADIIAFDGTDR
NANE_VIBCH       EGVNNVAAVSAAV---TIPIIGIVKRDLPDSPIRITPFVSDVDGLANAGATVIAFDATDR
NANE_VIBVU       EGVENVRHVSQAT---NVPIIGIVKRDLQDSPVRITPFVCDVDALATAGATIIAFDATDR
NANE_THEVB       NTPAHIQAVRQAV---NVPIIGLWKQTLPAYPVYITPRFADAVAVAAAGADIIALDATAR
NANE_STAAM       NTKEDILAIKETV---DLPVIGIVKRDYDHSDVFITATSKEVDELIESQCEVIALDATLQ
NANE_STAAW       NTKEDILAIKETV---DLPVIGIVKRDYNHSDVFITATSKEVDELIESQCEVIALDATLQ
NANE_STAA3       NTKEDILAIKETV---DLPVIGIVKRDYDHSDVFITATSKEVDELIESQCEVIALDATLQ
NANE_OCEIH       NTKEDIIQIKEEV---NLPVVGIVKRDYKDSEVFITATYKEIDELLESNCEMIAIDATTR
NANE_LISIN       NTAKDIRAIQSEV---DVPIIGIYKKDYDDSDVFITPTLKEVREICETGVEIVAMDATTR
NANE_LISMO       NTAKDIRAIQSEI---DVPIIGIYKKDYDDSDVFITPTLKEVREICETGVEIVAMDATTR
NANE_LACPL       NSVVDIQAIQDEV---DLPLIGLSKVDYPDSPVYITPTIKEMRAVAATGCAVVACDVTGQ
NANE_BORBU       NGVNDISQIKLEV---DLPIIGIIKKNYNNCDVFITPTMKEIDELCNEGVDIIALDATFR
NANE_FUSNN       NTVEDIKEIKKNV---SLPIIGIIKKVYNNSDVYITPTIKEVEDLINEGVQIIAIDATKR
NANE_STRA3       NSVRDIKEIQEVT---NLPIIGIIKREYPPQEPFITATMTEVDQLASLDIAVIALDCTLR
NANE_STRSU       NSVRDIKEIKEVT---TLPIIGIIKRDYPPQEPFITATMREVDELAALDIEVIALDCTKR
NANE2_STRPN      NSVRDIKEIKEVT---KLPIIGIIKRDYPPQEPFITATMKEVDELAELDIEVIALDCTKR
NANE1_STRR6      NSVRDIKEIKEVT---KLPIIGIIKRDYPPQEPFITATMKEVDELAELDIEVIALDCTKR
NANE_STRP3       NSVRDIKEIQAIT---DLPIIGIIKKDYPPQEPFITATMAEVDQLAALNIAVIAMDCTKR
NANE_STRP1       NSVRDIKEIQAIT---DLPIIGIIKKDYPPQEPFITATMTEVDQLAALNIAVIAMDCTKR
NANE_ENTFA       NSVRDIKEIKEKV---SLPIIGIIKRDYPPEEPFITATMREVDELVAIGVEVIALDCTLR
NANE_LACLA       NSVRDIKEIQKIV---DLPIIGIIKRDYPPQKPFITATMKEIDELVATSCEVIALDCTSR
NANE1_STRPN      NSVRDIKAIQKVV---DLPIIGIIKRDYPPQEPYITATMKEVDELVECGTTVIAFDATLR
NANE_CLOPE       QGVNDINEIKEVT---KLPIIGIIKRNYDDSEIYITPTMKEVDELLKTDCEMIALDATKR
NANE_CALS4       NGYEDIVAIKKEV---SIPVIGLIKKRYEGYAPYITPTMEEVDKVIEAGADIVAIDATKA
NANE_MALP2       SQYSHIKSIKSISG--KTPIIGLIKSNYENSEVIITPSIKEVDLLLSLNVDCIAIDATNR
NANE_MYCPU       SQIKNIKALIRANF--NVPIIGIIKQNYPNSDVYISPTLKEMKKLIKTGVQIIAIDATLR
NANE_CORGL       GGYGGLEDIRSISNRVDVPVFGLTKEGSEG--VYITPTRDSVRAVAESGATVVCADATFR
                      :            *:.*: *         *:.   .   :       :. * :  

NANE_ECOLI       PRPVP---VETLLARIHH-HGLLAMTDCSTPEDGLACQKLGAEIIGTTLSGYTTPETPEE
NANE_SHIFL       PRPVP---VETLLARIHH-HGLLAMTDCSTPEDGLACQKLGAEIIGTTLSGYTTPETPEE
NANE_ECO57       PRPVP---VETLLARIHH-HGLLAMTDCSTPEDGLACQKLGAEIIGTTLSGYTTPETPEE
NANE2_SALTY      QRPVA---VEALLARIHH-HHLLAMADCSSVDDGLACQRLGADIIGTTMSGYTTPDTPEE
NANE_KLEAE       QRPAS---VSALLAEIHR-LGKVAMADCSSLDDALECWQLGAEIVGTTLSGYTAEETPDE
NANE1_SALTY      SRPVD---IDSLLTRIRL-HGLLAMADCSTVNEGISCHQKGIEFIGTTLSGYTGPITPVE
NANE_YERPE       ERPVS---VADLYQRARA-TGCLTMADASNIDDGLLAHHLGIDFIGTTLSGYTQATVPTE
NANE_HAEIN       PRPVD---IESAVKKIHE-MGCLAMADCSNLEEGLYCKALGFDIVGSTMSGYTGGAVPEE
NANE_PASMU       VRPTT---REAIIKRIKE-LGCLAMADCSNFEEGMYCHNLGVEIIGSTMSGYTGGEIPAE
NANE_VIBCH       TRPES---RERIAQAIKN-TGCFAMADCSTFEDGLWANSQGVEIVGSTLSGYVGDIEPTV
NANE_VIBVU       QRPES---RETIANAIKN-SGCFAMADCSCFADGQWAAQIGVDIIGSTLSGYVGEIEPTE
NANE_THEVB       SRPEP---LQDLIQRIHNELGKPVMADIDSLENAAAAVAAGADWVGTTLFGYTETTAHTP
NANE_STAAM       QRPKE-TLDELVSYIRTHAPNVEIMADIATVEEAKNAARLGFDYIGTTLHGYTSYTQGQL
NANE_STAAW       QRPKE-TLDELVSYIRTHAPNVEIMADIATVEEAKNAARLGFDYIGTTLHGYTSYTQGQL
NANE_STAA3       QRPKE-TLDELVSYIRTHAPNVEIMADIATVEEAKNAARLGFDYIGTTLHGYTSYTQGQL
NANE_OCEIH       NRPQDIKLQDLVDYTKRLNSEVELMADIATLEEAKIAEKLGFDCISTTLHGYTSNTSNHK
NANE_LISIN       KRPHNEDLKDILSAIRKEFPNTLFMADTGSIEDVYYADSLGFDLIGTTLYGYTEETANKN
NANE_LISMO       KRPHNEDLKDILSAIRKEFPNTLFMADTASIEDVYYADSLGFDLIGTTLYGYTEETANKN
NANE_LACPL       PRPNGEKLAEIVATMRTEFPDTLLMADTDTIENVKVADKLGFDIIGTTMHGYTPATTGAN
NANE_BORBU       NRPDGVLLDDFFENIKKKYPKQCLMADISSLDEAINADKLGFDFIGTTLYGYTKNTNGLN
NANE_FUSNN       ERPDRKDLKNFIAEIKEKYPNQLFMADISSVDEALYAEKIGFDIVGTTLVGYTDYTKNYK
NANE_STRA3       ERHDGLSVVEFIQKIKRKYPEQLLMADISTFEEGKNAFEAGVDFVGTTLSGYTDYSRQEE
NANE_STRSU       ERYDGLDIVDFINQIKEKYPEQLFMADISTFEEGLTAYEAGIDFIGTTLSGYTSYSRQEE
NANE2_STRPN      ERYDGLEIQEFIRQVKEKYPNQLLMADTSIFEEGLAAVEAGIDFVGTTLSGYTSYSPKVD
NANE1_STRR6      ERYDGLEIQEFIRQVKEKYPNQLLMADTSIFEEGLAAVEAGIDFVGTTLSGYTSYSPKVD
NANE_STRP3       DRHDGLDIASFIRQVKEKYPNQLLMADISTFDEGLVAHQAGIDFVGTTLSGYTPYSRQEA
NANE_STRP1       DRHDGLDIASFIRQVKEKYPNQLLMADISTFDEGLVAHQAGIDFVGTTLSGYTPYSRQEA
NANE_ENTFA       KRHDGLSINTFIEKVKKKYPQQLLMADISTFEEGKNAYQAGVDFVGTTLSGYTKESKKQN
NANE_LACLA       ERYDGLTINEFIKSIKEKYPNQLLMADCSTFEECKNAYEAGVDFVGTTLSGYTDESPKQD
NANE1_STRPN      PRYDGLVVSEFIKKIKEKYPNQLLMADVSNLDEGLYAFKSGVDFVGTTLSGYTSTSVQSD
NANE_CLOPE       KRPNGENVKDLVDAIHAK--GRLAMADISTLEEGIEAEKLGFDCVSTTLSGYTPYSKQSN
NANE_CALS4       YKPGGLTTGEFLKRIKEKYPKILVMADISTYEEGIEAEKLGFDLISTTLSGYTEYSPELE
NANE_MALP2       KRPSETLEVIFKYC-REKSPNTLLMADCATIDDVKNADKLGFDLIGTTLRGYTKETFGKS
NANE_MYCPU       KRPKESLNQIVDYFFKHKKSHQLLMADCSSIEDVNNAIKLNFDIIGTTLRGYTEDTKNFS
NANE_CORGL       PRPDGSTFAELVTVAHDS--GILIMADCATPEEVLSAHKAGADFVSTTLAGYTEHREKTV
                  :                      *:*     :   .   . : :.:*: **.       

NANE_ECOLI       PD---LALVKTLSDA----GCRVIAEGRYNTPAQAADAMRHGAWAVTVGSAITRLEHICQ
NANE_SHIFL       PD---LALVKTLSEA----GCRVIAEGRYNTPAQAADAMRHGAWAVTVGSAITRLEHICQ
NANE_ECO57       PD---LTLVKRLSDA----GCRVIAEGRYNTPAQAADAMRHGAWAVTVGSAITRLEHICQ
NANE2_SALTY      PD---LPLVKALHDA----GCRVIAEGRYNSPALAAEAIRYGAWAVTVGSAITRLEHICG
NANE_KLEAE       PD---LALVQCLSVA----GCRVIAEGRYNTPAQAAEAMRCGAWAVTVGSAITRLEHICG
NANE1_SALTY      PD---LAMVTQLSHA----GCRVIAEGRYNTPALAANAIEHGAWAVTVGSAITRIEHICQ
NANE_YERPE       PD---LALVTQLAQA----GCRVIAEGRYHSPALAAAAISAGAYAVTVGSAITRIEHICG
NANE_HAEIN       PD---YQLVKDLKSA----GCFVMAEGRYNTPELAKVAIEIGADCVTVGSALTRLEHIVS
NANE_PASMU       PD---YQLVKDLNAA----GCRVMAEGRYNTPELAKTAIEIGAYSVTVGSALTRLEHIVS
NANE_VIBCH       PD---FQLVKAFSEA----GFFTMAEGRYNTPELAAKAIESGAVAVTVGSALTRLEVVTQ
NANE_VIBVU       PD---LELVKQFSSA----GFFTMAEGRYNTPQLAAKAIENGAVAVTVGSAITRMEVVTH
NANE_THEVB       PPS-WSLLSQLVEHL----SVPILSEGGIASPTMAAKALGLGAWAVVVGTDITGIDLKVQ
NANE_STAAM       LYQNDFQFLKDVLQS---VDAKVIAEGNVITPDMYKRVMDLGVHCSVVGGAITRPKEITK
NANE_STAAW       LYQNDFQFLKDVLQS---VDAKVIAEGNVITPDMYKRVMDLGVHCSVVGGAITRPKEITK
NANE_STAA3       LYQNDFQFLKDVLQS---VDAKVIAEGNVITPDMYKRVMDLGVHCSVVGGAITRPKEITK
NANE_OCEIH       IYDNDFSFLKNLLSE---VKIPIIAEGNILTPEMFKRCIELGAHACVVGGAITRPQEITK
NANE_LISIN       ISDHDFSHMKEVLKS---TKRPVIAEGKIDSPSKARQVLTLGCYAVVVGGAVTRPQEITT
NANE_LISMO       ISDDDFSHLKEVLKS---TKRPVIAEGKIDSPSKARQVLTLGCYAVVVGGAVTRPQEITT
NANE_LACPL       IADNDFAYLKEVLQA---TSRPVIAEGKVDTPEKMKRCLDLGCHAVVVGGAITRPLEIAQ
NANE_BORBU       IADNDFNFLRTLLNSN--LKSTLIVEGKIDTPLKAQKCFEMGVDLVVVGGAITRPAEITK
NANE_FUSNN       ALEELKKVVKVV-------KIPVIAEGNIDTPLKAKKALEIGAFAVVVGGAITRPQQITK
NANE_STRA3       GP--DIELLNKLCQ----AGIDVIAEGKIHTPKQANEINHIGVAGIVVGGAITRPKEIAE
NANE_STRSU       GP--DIELVDRLCR----AGIDVIAEGKIHYPDQVKIIHDLGVAGIVVGGAITRPKEIAE
NANE2_STRPN      GP--DFELIKKLCD----AGVDVIAEGKIHTPEQAKQILEYGVRGIVVGGAITRPKEITE
NANE1_STRR6      GP--DFELIKKLCD----AGVDVIAEGKIYTPEQAKQILEYGVRGIVVGGAITRPKEITE
NANE_STRP3       GP--DVALIEALCK----AGIAVIAEGKIHSPEEAKKINDLGVAGIVVGGAITRPKEIAE
NANE_STRP1       GP--DVALIEALCK----AGIAVIAEGKIHSPEEAKKINDLGVAGIVVGGAITRPKEIAE
NANE_ENTFA       GP--DMKLIKQLVQ----ENICVIAEGKIHTPEQARQIKKLGVAGIVVGGAITRPQEIAK
NANE_LACLA       EP--DFTLLEKLVE----EKIPVIAEGRIHSPEQAKRVYDIGVDAMVIGGAITRPFEIAT
NANE1_STRPN      EP--DFELMKKLAD----FNIPVIAEGKIHYPEQLKKAYSLGVTSVVIGGAITRPKEIAQ
NANE_CLOPE       SV--DFELLEELVKT---VKIPVICEGRINTPEELKKALDLGAYSAVVGGAITRPQQITK
NANE_CALS4       GP--DYELIERLARK---VNVPIIAEGRIWTPEEAVKALEKGAYAVVVGTAITRPHEITR
NANE_MALP2       NMDNDYSFIKECLSSI---KTPLIAEGGIWEPYQVKDLLDLGCFAVVVGSAITRPKEITK
NANE_MYCPU       NTDDNYLFLRQVLKICQQNKKYLIAEGGFNSPQNAKDALDIGANAVVVGSAITRPQFITK
NANE_CORGL       GP--DFDCLREARELV--PDAFLIGEGRFSNPADVAHGRLIGANAIIVGTAITDPGFITG
                                        : **    *         *     :*  :*       

NANE_ECOLI       WYNTAMKKAVL-------
NANE_SHIFL       WYNTAMKKAVL-------
NANE_ECO57       WYNTAMKKAVL-------
NANE2_SALTY      WYNDALKKAAS-------
NANE_KLEAE       WYNTALKAAVYPANEQ--
NANE1_SALTY      WFSHAVKR----------
NANE_YERPE       WFCDAIKQCETEKLTEY-
NANE_HAEIN       WFANSVKSAR--------
NANE_PASMU       WFADAVKSAK--------
NANE_VIBCH       WFNNATQAAGERKCAH--
NANE_VIBVU       WFNSATQAVRQNNESISY
NANE_THEVB       QYVAALKANTDLS-----
NANE_STAAM       RFVQVMED----------
NANE_STAAW       RFVQVMED----------
NANE_STAA3       RFVQIMED----------
NANE_OCEIH       RFIG--------------
NANE_LISIN       RFTNEIKKI---------
NANE_LISMO       RFTNEIQKIQEERGK---
NANE_LACPL       RFISAL------------
NANE_BORBU       KFVEKINQIKK-------
NANE_FUSNN       KFVDEMK-----------
NANE_STRA3       RFISGLS-----------
NANE_STRSU       RFISALHK----------
NANE2_STRPN      RFVASLK-----------
NANE1_STRR6      RFVAGLK-----------
NANE_STRP3       RFIEALKS----------
NANE_STRP1       RFIEALKS----------
NANE_ENTFA       RFVDALNKEEKDV-----
NANE_LACLA       RFIKAIGEK---------
NANE1_STRPN      RFINVIK-----------
NANE_CLOPE       RFTDILK-----------
NANE_CALS4       RFVTFIKERRYSNVRAK-
NANE_MALP2       YFLKALDN----------
NANE_MYCPU       MFYEKINS----------
NANE_CORGL       QFASLLH-----------
                  :