CLUSTAL format seed alignment for MF_01427
_____________________________________________________________________________
Features found in the protein:
- The following colors are used to highlight features:
- blue indicates SIGNAL, PROPEP, TRANSMEM, DOMAIN, ZN_FING, REPEAT,
DNA_BIND and CA_BIND.
- magenta is used to display DISULFID, THIOLEST and THIOETH.
- red is used for all other features, such as INIT_MET, ACTIVE SITE,
METAL,BINDING, NP_BIND, SITE, REGION, etc.
- The ID of the sequence used as the template for feature propagation is
underlined.
- A '<' at the beginning of a sequence or '>' at the end indicate that
the protein is fused with another domain either at the N- or C-terminus.
_____________________________________________________________________________
YHAM_SHOC1 MAKGIRHHRVGEAVDGYLLIKTATKQIASNSKPFLTLILGDHTGEIEAKLWGISPEDEAT
YHAM_HALH5 MSRGILYYQVGEALESYFLIKSATKAVASNGKPFLTLILSDHTGEIEAKLWGCSPEDEAT
YHAM_BACSU MAKGIMLHEVGEQVDQYLLIKSSTKGIASNGKPFLTLMLQDQSGDIEAKLWDAKQSDEVT
YHAM_BACLD MAKGIMLHEVGEQVDLYLLIKSSTKGIASNGKPFLTLMLQDQSGDIEAKLWDAKQQDEVT
YHAM_BACCR MKKKIAEYEVGEQVDIFLLIKTATKGIASNGKPFLTVILQDPSGDIEAKLWDVSPEVEKQ
YHAM_BACHK MKKKIAEYEVGEQVDIFLLIKTATKGIASNGKPFLTVILQDPSGDIEAKLWDVSPEVEKQ
YHAM_BACC1 MKKKIAEYEVGEQVDIFLLIKTATKGIASNGKPFLTVILQDPSGDIEAKLWDVSPEVEKQ
YHAM_BACCZ MKKKIAEYEVGEQVDIFLLIKTATKGIASNGKPFLTVILQDPSGDIEAKLWDVSPEVEKQ
YHAM_BACAN MKKKIAEYEVGEQVDVFLLIKTATKGIASNGKPFLTVILQDPSGDIEAKLWDVSPEVEKQ
YHAM_GEOKA MAKGIIHYEVGEQVDLFLLIKSATKGIASNGKPFLTLILQDKSGDIEAKLWDVSPDDEER
YHAM_LISMO MEKRLLDFEVGETVDLFLLIKSSVKGTASNGKPFLSLVLQDKSGELEAKLWDVKESDEAN
YHAM_LISMF MEKRLLDFEVGETVDLFLLIKSSVKGTASNGKPFLSLVLQDKSGELEAKLWDVKESDEAN
YHAM_LISIN MEKRLLDYEVGETVELFLLIKSSVKGTASNGKPFLSLVLQDKSGELEAKLWDVKESDEIN
YHAM_OCEIH MKNGIAFRTIGEEFDGFLLIKESTRGTTSNGKPFLTLILRDASGEIEAKLWDATKDDEET
* . : :** .: ::*** :.: :**.****:::* * :*::*****. . . *
YHAM_SHOC1 FVNKTIVHIQGDVIDYRGRLQLKIASIRPTSAMDGVHLNDFVRSAPLAPNDMLDEVNQYI
YHAM_HALH5 FVSGAIVHISGQLSEYRGRQQLKIGSIRPTTAMDQVKVSDFVRSAPLSPDDMLEQITQYI
YHAM_BACSU YAPQTIVKVVGDVHHYRGRTQLKLRNIRPVSEQENVNIDDFLETAPIPKNEMMDTITQYI
YHAM_BACLD YGPQTIVKVVGDIHHYRGRNQLKLRNIRPAGENENVKIDDFLETAPIPKNEMMDAVTQYI
YHAM_BACCR YVAETIVKVAGDILNYKGRIQLRVKQIRVANENEVTDISDFVEKAPVKKEDMVEKITQYI
YHAM_BACHK YVAETIVKVAGDILNYKGRIQLRVKQIRVANENEVTDISDFVEKAPVKKEDMVEKITQYI
YHAM_BACC1 YVAETIVKVAGDILNYKGRIQLRVKQIRVANENEVTDISDFVEKAPVKKEDMVEKITQYI
YHAM_BACCZ YVAETIVKVAGDILNYKGRIQLRVKQIRVANENEVTDISDFVEKAPVKKEDMVEKITQYI
YHAM_BACAN YVAETIVKVAGDILNYKGRIQLRVKQIRVANENEVTDISDFVEKAPVKKEDMVEKITQYI
YHAM_GEOKA YVPECIVKVAGDIHNYRGKLQLRIRSIRPAHPGDAVRIDDFLEKAPLGREEMKAKVMEYI
YHAM_LISMO YGVQQIVHLMGDIQNYRGRKQLKIRQIRQATALDGVSASEFMETAPINKEEMADEITQYI
YHAM_LISMF YGVQQIVHLMGDIQNYRGRKQLKIRQIRQATALDGVSASEFMETAPINKEEMADEITQYI
YHAM_LISIN YGVQQIVHLMGDIQNYRGRKQLKIRQIRQASPLDGVSASEFMETAPINKDEMADEITQYI
YHAM_OCEIH LIPEQIIQVTGEINQFRGKHQLKILSIRLSQPMDNVQVTDFLGKAPMEKEELAEKLTEAI
*::: *:: .::*: **:: .** : . :*: .**: ::: : : *
YHAM_SHOC1 FEIHNPHIQRITRFLLKKHQQAFLESPAATKNHHEFMSGLAFHVVSMLRIGKSLIELYPT
YHAM_HALH5 FEMKNPKIQRMTRHLLKKHQTAFLEYPAATTNHHEFVSGLAYHVVCMLNVAKSLAALYPT
YHAM_BACSU FEMKNPNIQRITRFLVKKHEAEFMDYPAATKNHHEFVSGLAYHVVSMLNLAKAIADLYPS
YHAM_BACLD FEMKNPNIQRITRHLVKKYGKEFIDYPAATKNHHEFVSGLAYHVVSMLNLAKSVADLYPS
YHAM_BACCR FEMRNPNIQRLTRHLLNKHQNEFLDYPAATKNHHEFVSGLAYHVVSMLDLAKAISNLYPS
YHAM_BACHK FEMRNPNIQRLTRHLLNKHQNEFLDYPAATKNHHEFVSGLAYHVVSMLDLAKAISNLYPS
YHAM_BACC1 FEMRNPNIQRLTRHLLNKHQNEFLDYPAATKNHHEFVSGLAYHVVSMLDLAKAISNLYPS
YHAM_BACCZ FEMRNPNIQRLTRHLLNKHQNEFLDYPAATKNHHEFVSGLAYHVVSMLDLAKAISNLYPS
YHAM_BACAN FEMRNPNIQRLTRHLLNKHQNEFLDYPAATKNHHEFVSGLAYHVVSMLDLAKAISNLYPS
YHAM_GEOKA FAMENPNIQRITRYLLKKYEKAFFEYPAATKNHHEFISGLAYHVVSMLELAKALIHLYPS
YHAM_LISMO FEMKNANLQRITRALLKKYQDDFYDYPAAMRHHHEFVSGLSFHVVSMLRLAKSVADLYPS
YHAM_LISMF FEMKNANLQRITRALLKKYQDDFYDYPAAMRHHHEFVSGLSFHVVSMLRLAKSVADLYPS
YHAM_LISIN FEMKNANLQRITRALLKKYQDDFYDYPAAMRHHHEFVSGLSFHVVSMLRLAKSVADLYPT
YHAM_OCEIH FEMENPKIQRLVRAFIKKYQEELLTYPAATKNHHEFASGLAYHVVSMLAIGKELHKLYPE
* :.*.::**:.* :::*: : *** :**** ***::***.** :.* : ***
YHAM_SHOC1 LDKDLLYAGIILHDLGKVRELSGAIDTTYTLEGKLLGHISIMSNEIAQAAKELEIDGEEV
YHAM_HALH5 LDTDLLYAGIILHDLGKVKELSGPIDTTYTIEGKLLGHISILVNEIGETANELGIEGEEV
YHAM_BACSU LDRDLLYAGVILHDLGKVKELSGPVSTSYTVEGNLLGHISIMVTELSKAAEELQIDSEEV
YHAM_BACLD LDRDLLYAGVILHDLGKVKELSGPVSTTYTVEGNLLGHISIMVTEIAKAAEELQIDSEEV
YHAM_BACCR LDKDLLYAGVILHDLGKVIELSGPISTTYTLEGNLLGHISIMVNEIGKAADELQIDAEEV
YHAM_BACHK LDKDLLYAGVILHDLGKVIELSGPISTTYTLEGNLLGHISIMVNEIGKAADELQIDAEEV
YHAM_BACC1 LDKDLLYAGVILHDLGKVIELSGPISTTYTLEGNLLGHISIMVNEIGKAADELQIDAEEV
YHAM_BACCZ LDKDLLYAGVILHDLGKVIELSGPISTTYTLEGNLLGHISIMVNEIGKAADELQIDAEEV
YHAM_BACAN LDKDLLYAGVILHDLGKVIELSGPISTTYTLEGNLLGHISIMVNEIGKAADELQIDAEEV
YHAM_GEOKA LNKDLLYAGVILHDLGKVIELSGPVSAAYTLEGNLLGHISIMVSEISKAAEQLGIQGEEV
YHAM_LISMO VNRDLLYAGVILHDLGKVIELSGPVSTTYTLEGNLIGHISIVVEEVSKIADELSIDGEEV
YHAM_LISMF VNRDLLYAGVILHDLGKVIELSGPVSTTYTLEGNLIGHISIVVEEVSKIADELSIDGEEV
YHAM_LISIN VNRDLLYAGVILHDLGKVIELSGPVSTTYTLEGNLIGHISIVVEEVSKIAEELSIDGEEV
YHAM_OCEIH INRDLLYAGIILHDIGKIKELSGVVSTTYTLEGKMLGHIPMMVEEIGLMANELQIEGEEV
:: ******:****:**: **** :.::**:**:::***.:: *:. *.:* *:.***
YHAM_SHOC1 LILQHLILSHHGKGEWGSPKTPVVREAEVLHLIDNIDAKINMMDRALERVQPGEFSERVM
YHAM_HALH5 IILQHLVLAHHSKGEWGSPKPPLIREAEILHMIDNIDAKMNMMDRALERVQPGEFSERIK
YHAM_BACSU LILQHLILSHHGKAEWGSPKPPMVKEAEILHYIDNLDAKMNMMDRALERVKPGEYTERVF
YHAM_BACLD LILQHLILSHHGKPEWGSPKPPMVKEAEILHYIDNLDAKINMMDRALERVKPGEYTERVF
YHAM_BACCR LILQHIVLSHHGKAEWGSPKPPLVKEAEILHYIDNLDAKMNMMDRALGRTKPGEYTERVF
YHAM_BACHK LILQHIVLSHHGKAEWGSPKPPLVKEAEILHYIDNLDAKMNMMDRALGRTKPGEYTERVF
YHAM_BACC1 LILQHIVLSHHGKAEWGSPKPPLVKEAEILHYIDNLDAKMNMMDRALGRTKPGEYTERVF
YHAM_BACCZ LILQHIVLSHHGKAEWGSPKPPLVKEAEILHYIDNLDAKMNMMDRALGRTKPGEYTERVF
YHAM_BACAN LILQHIVLSHHGKAEWGSPKPPLVKEAEILHYIDNLDAKMNMMDRALGRTKPGEYTERVF
YHAM_GEOKA VILQHLVLAHHGKAEWGSPKPPLVKEAEVLHYIDNLDAKITMIDRALEKVKPGEFTERVF
YHAM_LISMO VVLKHVLLSHHGKGEWGSPKPPLVREAEILHQIDLMDASLNMMDKVLKHTKPGEFSERVF
YHAM_LISMF VVLKHVLLSHHGKGEWGSPKPPLVREAEILHQIDLMDASLNMMDKVLKHTKPGEFSERVF
YHAM_LISIN VVLKHVLLSHHGKGEWGSPKPPLVREAEILHQIDLMDASLNMMDKVLKHTKPGEFSERVF
YHAM_OCEIH LILKHLVLSHHGKAEWGSPTPPLVREAELLHLIDLIDAKMNMLGRALEKIQPGEFTERLF
::*:*::*:**.* *****..*:::***:** ** :**.:.*:.:.* : :***::**:
YHAM_SHOC1 ALDNRSFYKPSFHKKPIEL------
YHAM_HALH5 AMDNRSFYKPNFHEPPLDLS-----
YHAM_BACSU ALENRSFYKPTFHK-----------
YHAM_BACLD ALDNRSFYKPVFHK-----------
YHAM_BACCR ALDNRSFYKPSFHN-----------
YHAM_BACHK ALDNRSFYKPSFHN-----------
YHAM_BACC1 ALDNRSFYKPSFHN-----------
YHAM_BACCZ ALDNRSFYKPSFHN-----------
YHAM_BACAN ALDNRSFYKPSFHN-----------
YHAM_GEOKA ALDNRSFYKPAFLSVSKPKNPGSKE
YHAM_LISMO GLDNRSFYNPTFE------------
YHAM_LISMF GLDNRSFYNPIFE------------
YHAM_LISIN GLDNRSFYNPTFE------------
YHAM_OCEIH AMDNRAFYKPNFEENEG--------
.::**:**:* *