CLUSTAL format seed alignment for MF_02008
_____________________________________________________________________________
Features found in the protein:
- The following colors are used to highlight features:
- blue indicates SIGNAL, PROPEP, TRANSMEM, DOMAIN, ZN_FING, REPEAT,
DNA_BIND and CA_BIND.
- magenta is used to display DISULFID, THIOLEST and THIOETH.
- red is used for all other features, such as INIT_MET, ACTIVE SITE,
METAL,BINDING, NP_BIND, SITE, REGION, etc.
- The ID of the sequence used as the template for feature propagation is
underlined.
- A '<' at the beginning of a sequence or '>' at the end indicate that
the protein is fused with another domain either at the N- or C-terminus.
_____________________________________________________________________________
SYY_METAC --------MDRLELIRRNVQEIVTEEELEGLLKNKEAPRAYVGYEPSGKIHMGHVLTVNK
SYY_METMA --------MDRLELIKRNVQEIVTEEELEGLLNKKETPRAYVGYEPSGKIHMGHVLTVNK
SYY_METBF --------MDRLDLIKRNVQEIVTEGELEELLNKKKAPRAYVGYEPSGKIHMGHVLTVNK
SYY_METHJ --------MDTYARVIRNTVEVVTDEELRSLLD-RPVRKVYAGYEPSGEIHLGHLVTINK
SYY_ARCFU -----MDITEKLRLITRNAEEVVTEEELRQLIETKEKPRAYVGYEPSGEIHLGHMMTVQK
SYY_METJA --------MDEFEMIKRNTSEIISEEELREVLK-KDEKSAYIGFEPSGKIHLGHYLQIKK
SYY_METMP MLIFVKSGENMLESILKNTSEIVSIEELTELLK-KEEKIAYIGFEPSGRIHMGHYLQIRK
SYY_METST -----MDIDASVENISKDTAEIIEVEELKELLK-KDEKRAYVGFEPSGKVHLGHALTIKK
SYY_METTH -------MDDSLKTITRDVLEVITPEELMDVLK-KDEPVVYTGYEPSGRIHLGHALTVRK
SYY_METKA -----MDVEERLKLVTRNAVEVVTEEELRQLLEEKEEPVAYVGFEPSGKVHLGHKLVIDK
SYY_HALSA --------MNAYERITRNTAEVVTEEEVRELAEDPEGKRVYVGYEPSGVLHLGHLLTANK
SYY_HALMA -----MDTAERLDLVTRHTTEVVTEDELRTLFEESD-PSAYIGYAPTGEMHIGHFTTMRK
SYY_NATPD -----MDTVERTDLVARFTEEVIERDEIETLFEEQDEPTAYIGYAPTGEMHIGHFTTMRK
: : . *:: *: : . .* *: *:* :*:** *
SYY_METAC LIDLQKAGFKITVLLADVHAYLNK-KGTLEEVRKIADYNRR----CFIALGLDEEQTDFV
SYY_METMA LIDLQKAGFKITVLLADVHAYLNR-KGTLEEVRKIADYNRR----CFIALGLDEEQTDFV
SYY_METBF LIDLQKAGFEITVLLADVHAYLNR-KGTLEEVRKIADYNKR----CFIALGLDKEKTNFV
SYY_METHJ LIDLRDAGFEVTVLLADLHAFLNR-KGTMEEVKKLAEYNRR----CFEGLGLTD--IKYV
SYY_ARCFU LMDLQEAGFEIIVLLADIHAYLNE-KGTFEEIAEVADYNKK----VFIALGLDESRAKFV
SYY_METJA MIDLQNAGFDIIILLADLHAYLNQ-KGELDEIRKIGDYNKK----VFEAMGLK---AKYV
SYY_METMP MIDLQKAGFKIVILLADLHAYLNQ-KGTMDEVRALGEENRK----VFEAMGLV---ADYV
SYY_METST MKTLQDAGFKITIFIANLHAYLNN-KGTLDELNEVAKYNIK----CFKALGLS-EDTNFI
SYY_METTH LRELQDAGFRVKILLADYHAYLNG-KGSMERIRELADYNQK----CFLALGLSPERTEFI
SYY_METKA MIDLQEAGFHVIILLADLHAYLNE-KGTLEEVRELADYNRR----CFLAMGLDPNKTEFV
SYY_HALSA LMDLQDAGMEVVVLLADVHAYLND-KGSFEEIRATADQMKA----QFLAYGLDEDQTEFV
SYY_HALMA LADFLRAGVDVTVLIADLHAHLDDNKSPFDLLDARSAYYETAIEGMIEAAGADPEDVTFV
SYY_NATPD LADFIDAGLDVTVLVADLHAHLDDAKSPFELLEARSEYYERAIEGMIAAAGADPDGISFI
: : **. : :::*: **.*: *. :: : . : . * ::
SYY_METAC YGSDFQLGAEYMLNVLKLSRAVTLNRAKRSMDEVGRAMDDPTVSQMVYPLMQAIDIALLE
SYY_METMA YGSDFQLGAEYMLNVLKLSRAVTLNRAKRSMDEVGRAMDDPTVSQMVYPLMQAIDIALLE
SYY_METBF YGSDYQLGAEYMLNVLKLSRSVTLNRARRSMDEVGRAMDDPTVSQMVYPLMQAIDIAMLG
SYY_METHJ LGSSFQLSPEYQILVHELSQAITLNRAKRSMDEVGRQMDNPTVSQMVYPIMQMADIAMLG
SYY_ARCFU LGSEYQLSRDYVLDVLKMARITTLNRARRSMDEVSRRKEDPMVSQMIYPLMQALDIAHLG
SYY_METJA YGSEFQLDKDYTLNVYRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNDIHYLG
SYY_METMP YGSEFQLKDEYTIDVYKLALSTTLNRARRSMEVIAREDENPKVASVVYPLMQVNDIKHLN
SYY_METST LGSD-RMTPEYITEVFKAAKLTTIQRAQRSMALVSR-NETHDVAQTLYPIMQALDIHDLD
SYY_METTH LGSSFQTEPEYTDLVYRLALITTLLRAKRSMAQITRESRDHKVAEVIYPLMQVIDMVYLG
SYY_METKA LGSEFQLDEDYALDVYRMARHTTMRRARRSMDMIARSEENPPVSQVVYPLMQALDIVHLN
SYY_HALSA LGSSFQLDEDYELDLHAMQVETSLKRAQRAMAEIQS-GETPKVSHVVYPLMQALDIEYLD
SYY_HALMA RGTDFQLDEEYTLEMYRMAAETTISRTQRAASEVVRESESPNLGGLIYPLMQTLDVKALD
SYY_NATPD RGTDFQLDEPYTLDLYRLLADTTLSRAQRAGSEVVRQSENPSLGSLVYTLMQALDVAALD
*:. : * : :: *::*: : :. :*.:** *: *
SYY_METAC VDVAVGGIDQRKIHMLARENLKSLGFETPICIHTPILLGL-DGT-KMASSKDNFISIDDT
SYY_METMA VDVAVGGIDQRKIHMLARENLKSLGFETPICIHTPILLGL-DGT-KMASSKDNFISVDDT
SYY_METBF VDIAVGGIDQRKIHMLARENLKNLGFETPICIHTPILLGL-DGT-KMASSKENFISVDDT
SYY_METHJ VDAALGGIDQRKIHMLAREYLPSKNYPSPVCIHVPILQGL-DGK-KMSSSQGNYISVAES
SYY_ARCFU VDLAVGGIDQRKIHMLARENLPRLGYSSPVCLHTPILVGL-DGQ-KMSSSKGNYISVRDP
SYY_METJA VDVAVGGMEQRKIHMLARELLP----KKVVCIHNPVLTGL-DGEGKMSSSKGNFIAVDDS
SYY_METMP ADVAVGGMEQRKIHMLSREILPSMGYKAPVCIHNPVLTGL-DGEGKMSSSKGNFIAVDDD
SYY_METST ADIAVGGMEQRKIHMLAREILPRLGYRPPVCIHIPLIHGT-DGSDKMSSSKGNFIAIDDT
SYY_METTH VDVALGGMEQRKIHMLARENLPRLGFDAPVCIHTPLLHGT-DGSEKMSSSKGNFIAVDDS
SYY_METKA VDLAVGGLEQRKIHMLARDVLPKLGYDSPTCLHTPIIHGL-DGDEKMSSSKNNFIAVDDE
SYY_HALSA LDLAIGGMDQRKVHMLAREELPSVGYEKRPVLHTPIIGDLGSGDGKMSSSEGVTISMEDS
SYY_HALMA ADIAYGGVDQRGIYMLSREILPDHGGESPICLFAPLLSGL-SGGKMSASDEASKVNLTDS
SYY_NATPD ADIAYGGIDQRGIYMLAREQLPDHGYDKPACVFAPLLSGL-SGGKMSASEAGSKINLTDD
* * **::** ::**:*: * :. *:: . .* :*. : : :
SYY_METAC GEDIYRKFKKAFCKIGDVEE----NPILALFRYHIFPRYE----TVVIERPEKFGGDITY
SYY_METMA EEEIYRKFKKAFCKMGDVEE----NPILALFRYHIFPRYE----TIVIERPEKFGGNLVY
SYY_METBF EEEIYRKLKKAYCKIGDTEE----NPILALFRYHIFPRYE----TIVIERPEKFGGNITY
SYY_METHJ EEDIRKKMKKAFCP-PEVED----NPVLQVLQHHIFPRLD----TVTIERPEKFGGNRTF
SYY_ARCFU PEEVERKIRKAYCPAGVVEE----NPILDIAKYHILPRFG----KIVVERDAKFGGDVEY
SYY_METJA PEEIRAKIKKAYCPAGVVEG----NPIMEIAKYFLEYP-------LTIKRPEKFGGDLTV
SYY_METMP EATIKKKMKNAFCPMKEVSG----NPVLEIAKYYLKYP-------ATVKRPEKFGGDLVL
SYY_METST PKEIKNKINKSFCPIGVSED----NPVMEIAHYYIFDTHE----KILIERPEKFGGNLEL
SYY_METTH PDEIREKVKKSYCPMGETEG----NPIIEIVKYFIMPEYG----MMTIRRPEKFGGDLEL
SYY_METKA PEVIREKLRKAYCPAREAEG----NPILEIYRYFIFREYD----EVTIERPEKYGGDVTY
SYY_HALSA TADIEEKVTGAFCPQTRDPEGETVNPVLELFQYHVFPRFD----EVVVQRPDEYGGDLVY
SYY_HALMA PDEVDEKINQAYCPAGEVEE----NGVLEYLQHLVFPVLDVRGDSFVVERPEEYGGDLTY
SYY_NATPD GEAIDEKIGGAYCPAGETEE----NGVLEYLEYLVFPVFDQRDTSFVVERPEKYGGDLEY
: *. ::* * :: .: : :.* ::**:
SYY_METAC HSYAEMESNFIEEKVHPMDLKNAAAKYINEILDPVRKVLL-----------------
SYY_METMA NSYSEMESGFAEEKVHPMDLKNSAAKYINEILDPVRKVLL-----------------
SYY_METBF TSYEEMENAFVAESVHPMDLKNSAAKYINEILDPVRKVLL-----------------
SYY_METHJ GSYEEMEQAYAKGEIHPADLKTAVAESLITILAPVREYLK-----------------
SYY_ARCFU ASFEELAEDFKSGQLHPLDLKIAVAKYLNMLLEDARKRLGVSV--------------
SYY_METJA NSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILEPIRKRL------------------
SYY_METMP ESYEALENAFV-EGLHPMDVKNLVSEQLIEILRPIREKMNK----------------
SYY_METST TEEELIQTYEN-EDLHPMDLKNTVSKYLIERLAPAREYMENN---------------
SYY_METTH ELDELLEMYSS-SELHPLDLKNAVSDYLVDMLEPVREYMEGV---------------
SYY_METKA TSYEELERDFVDGELHPLDLKENAAGYLSEILKPVRKAVSAPS--------------
SYY_HALSA ESYEDLADDLESGELHPADAKGALAAALDELIEPGRQRLREIRGE------------
SYY_HALMA ESYDEVESDFVSGELHPADLKPSAASAISDVIDPVRERLADKDELLAEAYPEKYGAE
SYY_NATPD GTYDELEADFVSGELHPADLKPAAAAAIDEVVAPVRELLLEDPELLASAYPERYE--
: :** * * : : : *: :