CLUSTAL format seed alignment for MF_02008

_____________________________________________________________________________

Features found in the protein:_____________________________________________________________________________

SYY_METAC       --------MDRLELIRRNVQEIVTEEELEGLLKNKEAPRAYVGYEPSGKIHMGHVLTVNK
SYY_METMA       --------MDRLELIKRNVQEIVTEEELEGLLNKKETPRAYVGYEPSGKIHMGHVLTVNK
SYY_METBF       --------MDRLDLIKRNVQEIVTEGELEELLNKKKAPRAYVGYEPSGKIHMGHVLTVNK
SYY_METHJ       --------MDTYARVIRNTVEVVTDEELRSLLD-RPVRKVYAGYEPSGEIHLGHLVTINK
SYY_ARCFU       -----MDITEKLRLITRNAEEVVTEEELRQLIETKEKPRAYVGYEPSGEIHLGHMMTVQK
SYY_METJA       --------MDEFEMIKRNTSEIISEEELREVLK-KDEKSAYIGFEPSGKIHLGHYLQIKK
SYY_METMP       MLIFVKSGENMLESILKNTSEIVSIEELTELLK-KEEKIAYIGFEPSGRIHMGHYLQIRK
SYY_METST       -----MDIDASVENISKDTAEIIEVEELKELLK-KDEKRAYVGFEPSGKVHLGHALTIKK
SYY_METTH       -------MDDSLKTITRDVLEVITPEELMDVLK-KDEPVVYTGYEPSGRIHLGHALTVRK
SYY_METKA       -----MDVEERLKLVTRNAVEVVTEEELRQLLEEKEEPVAYVGFEPSGKVHLGHKLVIDK
SYY_HALSA       --------MNAYERITRNTAEVVTEEEVRELAEDPEGKRVYVGYEPSGVLHLGHLLTANK
SYY_HALMA       -----MDTAERLDLVTRHTTEVVTEDELRTLFEESD-PSAYIGYAPTGEMHIGHFTTMRK
SYY_NATPD       -----MDTVERTDLVARFTEEVIERDEIETLFEEQDEPTAYIGYAPTGEMHIGHFTTMRK
                              : : . *::   *:  : .      .* *: *:* :*:**     *

SYY_METAC       LIDLQKAGFKITVLLADVHAYLNK-KGTLEEVRKIADYNRR----CFIALGLDEEQTDFV
SYY_METMA       LIDLQKAGFKITVLLADVHAYLNR-KGTLEEVRKIADYNRR----CFIALGLDEEQTDFV
SYY_METBF       LIDLQKAGFEITVLLADVHAYLNR-KGTLEEVRKIADYNKR----CFIALGLDKEKTNFV
SYY_METHJ       LIDLRDAGFEVTVLLADLHAFLNR-KGTMEEVKKLAEYNRR----CFEGLGLTD--IKYV
SYY_ARCFU       LMDLQEAGFEIIVLLADIHAYLNE-KGTFEEIAEVADYNKK----VFIALGLDESRAKFV
SYY_METJA       MIDLQNAGFDIIILLADLHAYLNQ-KGELDEIRKIGDYNKK----VFEAMGLK---AKYV
SYY_METMP       MIDLQKAGFKIVILLADLHAYLNQ-KGTMDEVRALGEENRK----VFEAMGLV---ADYV
SYY_METST       MKTLQDAGFKITIFIANLHAYLNN-KGTLDELNEVAKYNIK----CFKALGLS-EDTNFI
SYY_METTH       LRELQDAGFRVKILLADYHAYLNG-KGSMERIRELADYNQK----CFLALGLSPERTEFI
SYY_METKA       MIDLQEAGFHVIILLADLHAYLNE-KGTLEEVRELADYNRR----CFLAMGLDPNKTEFV
SYY_HALSA       LMDLQDAGMEVVVLLADVHAYLND-KGSFEEIRATADQMKA----QFLAYGLDEDQTEFV
SYY_HALMA       LADFLRAGVDVTVLIADLHAHLDDNKSPFDLLDARSAYYETAIEGMIEAAGADPEDVTFV
SYY_NATPD       LADFIDAGLDVTVLVADLHAHLDDAKSPFELLEARSEYYERAIEGMIAAAGADPDGISFI
                :  :  **. : :::*: **.*:  *. :: :   .          : . *       ::

SYY_METAC       YGSDFQLGAEYMLNVLKLSRAVTLNRAKRSMDEVGRAMDDPTVSQMVYPLMQAIDIALLE
SYY_METMA       YGSDFQLGAEYMLNVLKLSRAVTLNRAKRSMDEVGRAMDDPTVSQMVYPLMQAIDIALLE
SYY_METBF       YGSDYQLGAEYMLNVLKLSRSVTLNRARRSMDEVGRAMDDPTVSQMVYPLMQAIDIAMLG
SYY_METHJ       LGSSFQLSPEYQILVHELSQAITLNRAKRSMDEVGRQMDNPTVSQMVYPIMQMADIAMLG
SYY_ARCFU       LGSEYQLSRDYVLDVLKMARITTLNRARRSMDEVSRRKEDPMVSQMIYPLMQALDIAHLG
SYY_METJA       YGSEFQLDKDYTLNVYRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNDIHYLG
SYY_METMP       YGSEFQLKDEYTIDVYKLALSTTLNRARRSMEVIAREDENPKVASVVYPLMQVNDIKHLN
SYY_METST       LGSD-RMTPEYITEVFKAAKLTTIQRAQRSMALVSR-NETHDVAQTLYPIMQALDIHDLD
SYY_METTH       LGSSFQTEPEYTDLVYRLALITTLLRAKRSMAQITRESRDHKVAEVIYPLMQVIDMVYLG
SYY_METKA       LGSEFQLDEDYALDVYRMARHTTMRRARRSMDMIARSEENPPVSQVVYPLMQALDIVHLN
SYY_HALSA       LGSSFQLDEDYELDLHAMQVETSLKRAQRAMAEIQS-GETPKVSHVVYPLMQALDIEYLD
SYY_HALMA       RGTDFQLDEEYTLEMYRMAAETTISRTQRAASEVVRESESPNLGGLIYPLMQTLDVKALD
SYY_NATPD       RGTDFQLDEPYTLDLYRLLADTTLSRAQRAGSEVVRQSENPSLGSLVYTLMQALDVAALD
                 *:. :    *   :       :: *::*:   :        :.  :*.:**  *:  * 

SYY_METAC       VDVAVGGIDQRKIHMLARENLKSLGFETPICIHTPILLGL-DGT-KMASSKDNFISIDDT
SYY_METMA       VDVAVGGIDQRKIHMLARENLKSLGFETPICIHTPILLGL-DGT-KMASSKDNFISVDDT
SYY_METBF       VDIAVGGIDQRKIHMLARENLKNLGFETPICIHTPILLGL-DGT-KMASSKENFISVDDT
SYY_METHJ       VDAALGGIDQRKIHMLAREYLPSKNYPSPVCIHVPILQGL-DGK-KMSSSQGNYISVAES
SYY_ARCFU       VDLAVGGIDQRKIHMLARENLPRLGYSSPVCLHTPILVGL-DGQ-KMSSSKGNYISVRDP
SYY_METJA       VDVAVGGMEQRKIHMLARELLP----KKVVCIHNPVLTGL-DGEGKMSSSKGNFIAVDDS
SYY_METMP       ADVAVGGMEQRKIHMLSREILPSMGYKAPVCIHNPVLTGL-DGEGKMSSSKGNFIAVDDD
SYY_METST       ADIAVGGMEQRKIHMLAREILPRLGYRPPVCIHIPLIHGT-DGSDKMSSSKGNFIAIDDT
SYY_METTH       VDVALGGMEQRKIHMLARENLPRLGFDAPVCIHTPLLHGT-DGSEKMSSSKGNFIAVDDS
SYY_METKA       VDLAVGGLEQRKIHMLARDVLPKLGYDSPTCLHTPIIHGL-DGDEKMSSSKNNFIAVDDE
SYY_HALSA       LDLAIGGMDQRKVHMLAREELPSVGYEKRPVLHTPIIGDLGSGDGKMSSSEGVTISMEDS
SYY_HALMA       ADIAYGGVDQRGIYMLSREILPDHGGESPICLFAPLLSGL-SGGKMSASDEASKVNLTDS
SYY_NATPD       ADIAYGGIDQRGIYMLAREQLPDHGYDKPACVFAPLLSGL-SGGKMSASEAGSKINLTDD
                 * * **::** ::**:*: *          :. *:: .  .*    :*.    : : : 

SYY_METAC       GEDIYRKFKKAFCKIGDVEE----NPILALFRYHIFPRYE----TVVIERPEKFGGDITY
SYY_METMA       EEEIYRKFKKAFCKMGDVEE----NPILALFRYHIFPRYE----TIVIERPEKFGGNLVY
SYY_METBF       EEEIYRKLKKAYCKIGDTEE----NPILALFRYHIFPRYE----TIVIERPEKFGGNITY
SYY_METHJ       EEDIRKKMKKAFCP-PEVED----NPVLQVLQHHIFPRLD----TVTIERPEKFGGNRTF
SYY_ARCFU       PEEVERKIRKAYCPAGVVEE----NPILDIAKYHILPRFG----KIVVERDAKFGGDVEY
SYY_METJA       PEEIRAKIKKAYCPAGVVEG----NPIMEIAKYFLEYP-------LTIKRPEKFGGDLTV
SYY_METMP       EATIKKKMKNAFCPMKEVSG----NPVLEIAKYYLKYP-------ATVKRPEKFGGDLVL
SYY_METST       PKEIKNKINKSFCPIGVSED----NPVMEIAHYYIFDTHE----KILIERPEKFGGNLEL
SYY_METTH       PDEIREKVKKSYCPMGETEG----NPIIEIVKYFIMPEYG----MMTIRRPEKFGGDLEL
SYY_METKA       PEVIREKLRKAYCPAREAEG----NPILEIYRYFIFREYD----EVTIERPEKYGGDVTY
SYY_HALSA       TADIEEKVTGAFCPQTRDPEGETVNPVLELFQYHVFPRFD----EVVVQRPDEYGGDLVY
SYY_HALMA       PDEVDEKINQAYCPAGEVEE----NGVLEYLQHLVFPVLDVRGDSFVVERPEEYGGDLTY
SYY_NATPD       GEAIDEKIGGAYCPAGETEE----NGVLEYLEYLVFPVFDQRDTSFVVERPEKYGGDLEY
                   :  *.  ::*           * ::   .: :            :.*  ::**:   

SYY_METAC       HSYAEMESNFIEEKVHPMDLKNAAAKYINEILDPVRKVLL-----------------
SYY_METMA       NSYSEMESGFAEEKVHPMDLKNSAAKYINEILDPVRKVLL-----------------
SYY_METBF       TSYEEMENAFVAESVHPMDLKNSAAKYINEILDPVRKVLL-----------------
SYY_METHJ       GSYEEMEQAYAKGEIHPADLKTAVAESLITILAPVREYLK-----------------
SYY_ARCFU       ASFEELAEDFKSGQLHPLDLKIAVAKYLNMLLEDARKRLGVSV--------------
SYY_METJA       NSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILEPIRKRL------------------
SYY_METMP       ESYEALENAFV-EGLHPMDVKNLVSEQLIEILRPIREKMNK----------------
SYY_METST       TEEELIQTYEN-EDLHPMDLKNTVSKYLIERLAPAREYMENN---------------
SYY_METTH       ELDELLEMYSS-SELHPLDLKNAVSDYLVDMLEPVREYMEGV---------------
SYY_METKA       TSYEELERDFVDGELHPLDLKENAAGYLSEILKPVRKAVSAPS--------------
SYY_HALSA       ESYEDLADDLESGELHPADAKGALAAALDELIEPGRQRLREIRGE------------
SYY_HALMA       ESYDEVESDFVSGELHPADLKPSAASAISDVIDPVRERLADKDELLAEAYPEKYGAE
SYY_NATPD       GTYDELEADFVSGELHPADLKPAAAAAIDEVVAPVRELLLEDPELLASAYPERYE--
                     :        :** * *   :  :   :   *: :