CLUSTAL format seed alignment for MF_04092

_____________________________________________________________________________

Features found in the protein:
The following colors are used to highlight features:
blue indicates SIGNAL, PROPEP, TRANSMEM, DOMAIN, ZN_FING, REPEAT,
DNA_BIND and CA_BIND.
magenta is used to display DISULFID, THIOLEST and THIOETH.
red is used for all other features, such as INIT_MET, ACTIVE SITE,
 METAL,BINDING, NP_BIND, SITE, REGION, etc.
The ID of the sequence used as the template for feature propagation is 
underlined.
A '<' at the beginning of a sequence or '>' at the end indicate that
 the protein is fused with another domain either at the N- or C-terminus.
_____________________________________________________________________________

NSP5_ROTBS      --MSDFGINLDAICDNVRRNSSNSSIKSQVSNRSSRKMDFVD--EDELSTYFNSKT--SV
NSP5_ROTPC      --MSDFGINLDAICDNVKYKSSNSRTGSQVSNRSSRRMDFVD--EEELSTYFNSKA--SV
NSP5_ROTHC      --MSDFGINLDAICDNVKKGQTESRTGSQLSNRSSRRMDFVD--DEELSTYFNSKA--SV
NSP5_ROTSH      MSLSIDVTSLPSIPSTIYKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTS1      MSLSIDVTSLPSIPSTIYKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTHL      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTHP      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSLEDI
NSP5_ROTHT      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTWI      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSATSTLSGKSIGRSEQYISPDVEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTPY      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTP5      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTHW      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRNEQYVSSDIEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTAM      MSLSIDVTSLPSISSNIFKNESSSTTSTLSGKSIGRNEQYVSSDIEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTAD      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRNEQYVSSDIEAFNKYMLSKSLEDI
NSP5_ROTHK      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRNEQYVSPDIDAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTRH      MSLSIDVTSLPSISSSIYKHESSSTTSTLSGKSIGRSEQYVSPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROT41      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNESSSTTSTLSGKSIGRNELYVSPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTRA      MSLSIDVTSLPSISSSIFKNKSSSTASTLSGKSIGRNELYVSPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTBU      MYLSIDVTSLPSISSSIYKNESSSTASTLSGKSIGRSEQYVSPDAEASSKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTBV      MSLSIDVTSLPSFSSSIYKNESSATASTLSGKSIGRSVQYVSPDAEAFSKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTRF      MSLSIDVTSLPSISSSIYKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFSKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTW3      MSLSIDVTSLPSISSSIYKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFSKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTH7      MSLSIDVTSLPSISSSIYKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTH3      MSLSIDVTSLPSISSSIYKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFSKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTHJ      MSLSIDVTSLPSISSSIYKNESSSTTSTLSGKSIGRSEQYISPDAEAFSKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTH5      MSLSIDVTSLPSISSSVYKNESSSTTSTISGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTHD      MSLSIDVTGLPSISSSVYKNESSSTTSTISGKSIGRSEQYISPDAEAFRKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTH6      MSLSIDVTSLPSISSSIYKHESSSTTSTISGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTHB      MSLSIDVTSLPSISSSIYKHESSSTTSTISGKSIGRSEQYISPDAEAFNKYMLSKSPEDI
NSP5_ROTJ1      ------MSEVPRFELRSKRKIGKKQKVDIFGDKDDESMLQIDCETDSLISESVSSTHSYE
NSP5_ROTB2      ------MSEVPRFELRNKRKVGKKQKVDIFGDKDDESMLQIDCETDSLISESVSSTHSYE
NSP5_ROTGA      ------MAEASEFNFTIKRKQ-RTMS-DRRTREDTKQK-KIEE-KSDIDLVDSASVYSQE
NSP5_ROTGI      ------MAEASEFNFNLRRKS-RAVTASRRVKEEVKEKQKMDDSKSQVVDVDSVSVYSHE
                            :                      .    :.   .        .     

NSP5_ROTBS      TQSDSCSNDLNVKHSIIAEAVVCDESAHVSADAVQEKDVVVPKMDESVMKWMMDSHDGIC
NSP5_ROTPC      TQSDSCSNDLAVKTSIITEAVICDESEHVSADAIQEKEESIMQVDDNVMKWMMDSHDGIS
NSP5_ROTHC      TQSDSCSNDLEIKHSIITEAVVCDESAHVSADAIQEKDETVPQMDHRIMKWMLDSHDGVS
NSP5_ROTSH      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSAQSR---PSSNVGCDQVDFSLNKGLK
NSP5_ROTS1      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSAQSR---PSSNVGCDQVDFSLNKGLK
NSP5_ROTHL      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---SSSNVGCDQLDFSLTKGIN
NSP5_ROTHP      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQLDFSLTKGVN
NSP5_ROTHT      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQLDFSLTKGIN
NSP5_ROTWI      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQLDFSLNKGIN
NSP5_ROTPY      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSLTKGIN
NSP5_ROTP5      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSLTKGIN
NSP5_ROTHW      GPSDSASNNPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQMDFSLTKGIN
NSP5_ROTAM      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQMDFSLTKGIN
NSP5_ROTAD      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQMDFSLTKGIN
NSP5_ROTHK      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQMDFSLNKGIN
NSP5_ROTRH      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSLSKGIK
NSP5_ROT41      GPSDSASNDPLTSFSIRSHAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSFNKAVK
NSP5_ROTRA      GPSDSASNDPLTSFSIRSHAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDKVDFSFNKAMK
NSP5_ROTBU      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSVQSR---PSSNVGCDQVDFSFNKGIK
NSP5_ROTBV      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSVQSR---PSINVGCDQVDFSFNKGIK
NSP5_ROTRF      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSFNKGIS
NSP5_ROTW3      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSFNKGIK
NSP5_ROTH7      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSFNKGIK
NSP5_ROTH3      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSLTQSR---PSSNVGCDQVDFSLNKGIK
NSP5_ROTHJ      GPSDSASNDPLTSFSNRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSNVGCDQVDFSFNKGIK
NSP5_ROTH5      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSAQSR---PSSDIGYDQMDFSLNKGIK
NSP5_ROTHD      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSAQSR---PSSDIGYDQMDFSLNKGIK
NSP5_ROTH6      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNADAGVSMDSSTQSR---PSSDIGCDQVDFSLNRGIK
NSP5_ROTHB      GPSDSASNDPLTSFSIRSNAVKTNPDAGVSMDSSTQSR---PSSHIGCDQVDFSLNRGIK
NSP5_ROTJ1      DYS-KAYKELTLETPADVNDSASTIVDSVCEESWYDKT-----IKDEQTKEDKKTDKKLK
NSP5_ROTB2      DYS-KAYKELTLETPADTNDSTSTIIDSAYEESWYDKT-----IKDEQTKENKKTDKKLK
NSP5_ROTGA      SSR-SNYSDAYDKLKREPMVEESNDAKYRNFEFSEDEE-----VHRPSSKASDKSYREMK
NSP5_ROTGI      SSR-SNYSDAYEKLKREPVVEESNDARYRTFEFSEDEE-----TFKPANKMSDKSQRNSK
                    .  .:   .                  :   :.            :   .      

NSP5_ROTBS      VNGGLNFSKLKN--KSN-EHETKVTSETNVSAHVSAGINSQLGMFNPIQHKIKKEAIPEM
NSP5_ROTPC      MNGGINFSRSKS--KTGRSDFTESKSETSVSAHVSAGISSQLGMFNPIQNTVKKEAISEM
NSP5_ROTHC      LNGGINFTKAKSKLKETENEITEMKSKTNLLVNASVGINSNVGAFNPINQTIKTEAVSDM
NSP5_ROTSH      VKANLDSSISIS---------------TDTKKEKSK--QNHKSRKHYPRIEAESDSDDYV
NSP5_ROTS1      VKANLDSSISIS---------------TDTKKEKSK--QNHKSRKHYPRIEAESDSDDYV
NSP5_ROTHL      VNANLESCISIS---------------TDHKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYI
NSP5_ROTHP      VSANLDSCISIS---------------TDHKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYV
NSP5_ROTHT      VSANLDSCISIS---------------TDHKKEKSK--KD-KSRKYYPKIEADSDSEDYV
NSP5_ROTWI      VSANLDSCISIS---------------TDHKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYV
NSP5_ROTPY      VSANLDSCISIS---------------TDHKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYV
NSP5_ROTP5      VSANLDSCVSIS---------------TDNKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYV
NSP5_ROTHW      VSASLDSCVSIS---------------TNHKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDYEDYV
NSP5_ROTAM      VSASLDSCVSIS---------------TNHKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYV
NSP5_ROTAD      VSASLDSCVSIS---------------TNHKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYV
NSP5_ROTHK      VSASLDSCVSIS---------------TNQKKEKSK--KD-KSRKHYPRIEADSDSEDYV
NSP5_ROTRH      VNANLDSSISVS---------------TVSKKEKSK--SDHKNRKHYPRIEADSDSDEYV
NSP5_ROT41      VNANLDSSISIS---------------TDQKREKSK--KDHKNGKHYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTRA      VNANLDLSISIS---------------TDQKREKSK--KDHKNKKCYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTBU      VNANLDSSISVS---------------TNSRKEKSK--NDHKSRKHYPRIEAESDSDDYV
NSP5_ROTBV      VNANLDSSISVS---------------TNSRKEKSK--GDRKSRKHYPKIEAESDSDEYV
NSP5_ROTRF      MNANLDSSISIS---------------TSSKKEKSK--SDHKSRKHYPKIEAESDSDDYI
NSP5_ROTW3      MNANLDSSISIS---------------TISKKEKSK--SDHKSRKHYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTH7      MNANLDSSISIS---------------TNSKKEKSK--NEHKSRKHYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTH3      VSANLDSSVSIS---------------TNVKKEKSK--NDHRSRKHYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTHJ      VSANLDSSVSIS---------------TNVKKEKSK--NDHRSRKHYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTH5      IDATVDSSISIS---------------TTSQKEKSKQENKNKYKKCYPKIEAESDSDDYI
NSP5_ROTHD      FDATVDSSISIS---------------TTSKKEKSK--NKNKYKKCYPKIEAESDSDDYI
NSP5_ROTH6      IDAMVDSSISIS---------------TKSKKEKSK--HETKNRKCYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTHB      IDAMVDSSISIS---------------TKSKKEKSK--HETKNRKCYPKIEAESDSDDYV
NSP5_ROTJ1      RIEKVKENNQND----------------SMSLQIAQLSLRIQRIESETKLKTLDSAYNTI
NSP5_ROTB2      RIENIKENNQND----------------STSMQIAQLSLRIQRIESETKLKTLDSAYNTI
NSP5_ROTGA      R-KHDD-INTSD----------------SILEKLSELNLEIEKIKQMNQPITIDAAFNMI
NSP5_ROTGI      S-KHTEGLECSD----------------TVLEKISELTLEIEKVKQMNQPITVDAAFNMT
                     .     .                    . :             .           

NSP5_ROTBS      FEDEDTDECTCRNCPYKEKYLKLRKKLKNVLVDIITEM
NSP5_ROTPC      FEDEDGDGCTCRNCPYREKYLKLRNKMKSVLVDMINEM
NSP5_ROTHC      FEDEDIEGCICKNCPYREKYRKLRSKMKNVLIDMINEM
NSP5_ROTSH      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTS1      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTHL      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKRVAMQLIEDL
NSP5_ROTHP      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKRVAMQLIEDL
NSP5_ROTHT      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFVLRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTWI      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTPY      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTP5      LDDSDSDDGKCKNCKYKKRCFALRVRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTHW      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTAM      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTAD      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTHK      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTRH      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROT41      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKHVAMQLIEDL
NSP5_ROTRA      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKHVAMQLIEDL
NSP5_ROTBU      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTBV      LDDSDSDDGKCRNCKYKRKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTRF      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTW3      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTH7      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTH3      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKQVAMQLIEDL
NSP5_ROTHJ      LDDSDSDDGKCKNCKYKRKYFALRMRMKRVAMQLIEDL
NSP5_ROTH5      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRLRMKQVAMQLIKDL
NSP5_ROTHD      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRLRMKQVAMQLIKDL
NSP5_ROTH6      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRLRMKQVAMQLIENL
NSP5_ROTHB      LDDSDSDDGKCKNCKYKKKYFALRLRMKQVAMQLIENL
NSP5_ROTJ1      ITQADNLTTPQKKSLISAILATMR--------------
NSP5_ROTB2      ITQADNLTTPQKKSLISAILATMR--------------
NSP5_ROTGA      LRNVDNLTIRQKQALINAIVNSMN--------------
NSP5_ROTGI      LRNVDNLTTRQKQALVNSIINSMN--------------
                : : *      ::.        :.